RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495082.5

SLC13A3-211, Transcript of solute carrier family 13 member 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC13A3, Length 1,887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3-211ENST00000495082 PFN2P35080 140 aa7.49□□□□□ -1.21
SLC13A3-211ENST00000495082 LINC00158P58513 81 aa7.49□□□□□ -1.21
SLC13A3-211ENST00000495082 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
SLC13A3-211ENST00000495082 Q8N814 137 aa7.49□□□□□ -1.21
SLC13A3-211ENST00000495082 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.49□□□□□ -1.21
SLC13A3-211ENST00000495082 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.48□□□□□ -1.21
SLC13A3-211ENST00000495082 COPS9Q8WXC6 57 aa7.48□□□□□ -1.21
SLC13A3-211ENST00000495082 FRAS1Q86XX4 4008 aa7.48□□□□□ -1.21
SLC13A3-211ENST00000495082 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.47□□□□□ -1.21
SLC13A3-211ENST00000495082 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.47□□□□□ -1.21
SLC13A3-211ENST00000495082 RYR2Q92736 4967 aa7.47□□□□□ -1.21
SLC13A3-211ENST00000495082 TNP2Q05952 138 aa7.47□□□□□ -1.21
SLC13A3-211ENST00000495082 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
SLC13A3-211ENST00000495082 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.46□□□□□ -1.22
SLC13A3-211ENST00000495082 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.45□□□□□ -1.22
SLC13A3-211ENST00000495082 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.45□□□□□ -1.22
SLC13A3-211ENST00000495082 DNAH17Q9UFH2 4485 aa7.45□□□□□ -1.22
SLC13A3-211ENST00000495082 H7C2G1 150 aa7.44□□□□□ -1.22
SLC13A3-211ENST00000495082 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.44□□□□□ -1.22
SLC13A3-211ENST00000495082 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.44□□□□□ -1.22
SLC13A3-211ENST00000495082 H3BMG7 143 aa7.43□□□□□ -1.22
SLC13A3-211ENST00000495082 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.43□□□□□ -1.22
SLC13A3-211ENST00000495082 Q6ZRP5 223 aa7.43□□□□□ -1.22
SLC13A3-211ENST00000495082 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.43□□□□□ -1.22
SLC13A3-211ENST00000495082 Q1RN00 199 aa7.43□□□□□ -1.22
SLC13A3-211ENST00000495082 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.43□□□□□ -1.22
SLC13A3-211ENST00000495082 PSMB2P49721 201 aa7.42□□□□□ -1.22
SLC13A3-211ENST00000495082 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.42□□□□□ -1.22
SLC13A3-211ENST00000495082 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.41□□□□□ -1.22
SLC13A3-211ENST00000495082 RYR3Q15413 4870 aa7.41□□□□□ -1.22
SLC13A3-211ENST00000495082 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.41□□□□□ -1.22
SLC13A3-211ENST00000495082 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
SLC13A3-211ENST00000495082 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
SLC13A3-211ENST00000495082 GAGE2EQ4V326 116 aa7.41□□□□□ -1.22
SLC13A3-211ENST00000495082 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.41□□□□□ -1.22
SLC13A3-211ENST00000495082 TCL1BO95988 128 aa7.4□□□□□ -1.23
SLC13A3-211ENST00000495082 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.4□□□□□ -1.23
SLC13A3-211ENST00000495082 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-211ENST00000495082 C16orf90A8MZG2 172 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-211ENST00000495082 TRIAP1O43715 76 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-211ENST00000495082 NDUFC2O95298 119 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-211ENST00000495082 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-211ENST00000495082 FAT2Q9NYQ8 4349 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-211ENST00000495082 F8W1H4 67 aa7.38□□□□□ -1.23
SLC13A3-211ENST00000495082 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SLC13A3-211ENST00000495082 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.38□□□□□ -1.23
SLC13A3-211ENST00000495082 IGKV2D-28P01615 120 aa7.38□□□□□ -1.23
SLC13A3-211ENST00000495082 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
SLC13A3-211ENST00000495082 GAGE2BQ13066 116 aa7.38□□□□□ -1.23
SLC13A3-211ENST00000495082 A0A096LNI7 61 aa7.37□□□□□ -1.23
SLC13A3-211ENST00000495082 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.37□□□□□ -1.23
SLC13A3-211ENST00000495082 KRTAP10-2P60368 255 aa7.37□□□□□ -1.23
SLC13A3-211ENST00000495082 PRO0461Q9UI25 63 aa7.37□□□□□ -1.23
SLC13A3-211ENST00000495082 COX6CP09669 75 aa7.36□□□□□ -1.23
SLC13A3-211ENST00000495082 LINC01620Q4KN68 170 aa7.36□□□□□ -1.23
SLC13A3-211ENST00000495082 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.36□□□□□ -1.23
SLC13A3-211ENST00000495082 Q8NDZ9 215 aa7.36□□□□□ -1.23
SLC13A3-211ENST00000495082 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.36□□□□□ -1.23
SLC13A3-211ENST00000495082 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.36□□□□□ -1.23
SLC13A3-211ENST00000495082 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.36□□□□□ -1.23
SLC13A3-211ENST00000495082 MTURNQ8N3F0 131 aa7.36□□□□□ -1.23
SLC13A3-211ENST00000495082 VPREB1P12018 145 aa7.35□□□□□ -1.23
SLC13A3-211ENST00000495082 DNAH11Q96DT5 4516 aa7.35□□□□□ -1.23
SLC13A3-211ENST00000495082 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.34□□□□□ -1.23
SLC13A3-211ENST00000495082 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.34□□□□□ -1.23
SLC13A3-211ENST00000495082 ATXN8Q156A1 80 aa7.34□□□□□ -1.23
SLC13A3-211ENST00000495082 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.33□□□□□ -1.24
SLC13A3-211ENST00000495082 CHTF8P0CG12 524 aa7.32□□□□□ -1.24
SLC13A3-211ENST00000495082 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SLC13A3-211ENST00000495082 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SLC13A3-211ENST00000495082 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.32□□□□□ -1.24
SLC13A3-211ENST00000495082 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.32□□□□□ -1.24
SLC13A3-211ENST00000495082 A0A1B0GVY2 172 aa7.32□□□□□ -1.24
SLC13A3-211ENST00000495082 FAM168BA1KXE4 195 aa7.32□□□□□ -1.24
SLC13A3-211ENST00000495082 RPL28P46779 137 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SLC13A3-211ENST00000495082 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.32□□□□□ -1.24
SLC13A3-211ENST00000495082 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.32□□□□□ -1.24
SLC13A3-211ENST00000495082 CLEC2BQ92478 149 aa7.32□□□□□ -1.24
SLC13A3-211ENST00000495082 NCR3O14931 201 aa7.31□□□□□ -1.24
SLC13A3-211ENST00000495082 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.31□□□□□ -1.24
SLC13A3-211ENST00000495082 C9JAW5 83 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-211ENST00000495082 M0R378 163 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-211ENST00000495082 LST1O00453 97 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-211ENST00000495082 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-211ENST00000495082 SVIPQ8NHG7 77 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-211ENST00000495082 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-211ENST00000495082 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-211ENST00000495082 A0A1W2PNN7 141 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-211ENST00000495082 EPM2AB3EWF7 344 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-211ENST00000495082 PANO1I0J062 215 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-211ENST00000495082 ETDBQ3ZM63 59 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-211ENST00000495082 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-211ENST00000495082 TMEM126AQ9H061 195 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC13A3-211ENST00000495082 PKD1P98161 4303 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-211ENST00000495082 SLC25A20O43772 301 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-211ENST00000495082 IGLV6-57P01721 117 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-211ENST00000495082 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SLC13A3-211ENST00000495082 K7ERU9 68 aa7.28□□□□□ -1.24
SLC13A3-211ENST00000495082 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.28□□□□□ -1.24
SLC13A3-211ENST00000495082 C22orf24Q9Y442 160 aa7.28□□□□□ -1.24
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