RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 FBN3Q75N90 2809 aa5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 ESRGQ1W209 222 aa5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 TRGV2A0A075B6R0 118 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 C6orf223Q8N319 242 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 RMI2Q96E14 147 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 SPART-AS1P0CW21 52 aa5.04□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa5.04□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa5.04□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 K7EQD1 137 aa5.04□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 VCYO14598 125 aa5.04□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.04□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 C14orf132Q9NPU4 83 aa5.04□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 NDUFA12Q9UI09 145 aa5.04□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa5.03□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa5.03□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa5.03□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa5.03□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 Q6ZSN1 163 aa5.03□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 C11orf45Q8TAV5 145 aa5.03□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa5.02□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 DEFB130BP0DP73 79 aa5.02□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 DEFB130AP0DP74 79 aa5.02□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 Q1T7F1 81 aa5.02□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 SNURFQ9Y675 71 aa5.02□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 NDUFS5O43920 106 aa5.02□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 ERC2-IT1O76042 136 aa5.02□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 RPL39P62891 51 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa5.02□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 CD164L2Q6UWJ8 174 aa5.01□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 ENHOQ6UWT2 76 aa5.01□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 CELA1Q9UNI1 258 aa5.01□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 DEFB4AO15263 64 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM218AQ96MZ4 157 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 B9D2Q9BPU9 175 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 PRO0255Q9UI72 69 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A0J9YXV3 536 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC00308Q8TCZ7 52 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 H3BS24 57 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 UBE2BP63146 152 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 UBL5Q9BZL1 73 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 NDUFA1O15239 70 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 Q9HAA7 133 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC00588Q9Y4M8 146 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A0J9YWU9 116 aa4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 H0YGX0 51 aa4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 M0R378 163 aa4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 H3BNG1 76 aa4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 LCE3BQ5TA77 95 aa4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 Q6ZVQ6 151 aa4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa4.97□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa4.97□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP4.97□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 C20orf203Q8NBC4 194 aa4.97□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 GYPEP15421 78 aa4.97□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
SMARCE1-211ENST00000493660 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa4.96□□□□□ -1.62
SMARCE1-211ENST00000493660 CHCHD7Q9BUK0 85 aa4.96□□□□□ -1.62
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A087WZ39 114 aa4.95□□□□□ -1.62
SMARCE1-211ENST00000493660 C8orf87E5RJ46 101 aa4.95□□□□□ -1.62
SMARCE1-211ENST00000493660 UBE2L6O14933 153 aa4.95□□□□□ -1.62
SMARCE1-211ENST00000493660 ORMDL1Q9P0S3 153 aa4.95□□□□□ -1.62
SMARCE1-211ENST00000493660 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa4.95□□□□□ -1.62
SMARCE1-211ENST00000493660 NCR3O14931 201 aa4.95□□□□□ -1.62
SMARCE1-211ENST00000493660 HTN3P15516 51 aa4.95□□□□□ -1.62
SMARCE1-211ENST00000493660 Q6ZTC4 211 aa4.95□□□□□ -1.62
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM254Q8TBM7 123 aa4.95□□□□□ -1.62
SMARCE1-211ENST00000493660 MGAM2Q2M2H8 2515 aa4.95□□□□□ -1.62
SMARCE1-211ENST00000493660 TRAV10A0A0B4J240 114 aa4.94□□□□□ -1.62
SMARCE1-211ENST00000493660 hDV103S1A0JD37 113 aa4.94□□□□□ -1.62
SMARCE1-211ENST00000493660 PRYO14603 147 aa4.94□□□□□ -1.62
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
SMARCE1-211ENST00000493660 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa4.94□□□□□ -1.62
SMARCE1-211ENST00000493660 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
SMARCE1-211ENST00000493660 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.94□□□□□ -1.62
SMARCE1-211ENST00000493660 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.94□□□□□ -1.62
SMARCE1-211ENST00000493660 NOTCH1P46531 2555 aa4.94□□□□□ -1.62
SMARCE1-211ENST00000493660 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa4.94□□□□□ -1.62
SMARCE1-211ENST00000493660 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa4.94□□□□□ -1.62
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa4.94□□□□□ -1.62
SMARCE1-211ENST00000493660 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
SMARCE1-211ENST00000493660 DNAH9Q9NYC9 4486 aa4.94□□□□□ -1.62
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A087WYN8 130 aa4.93□□□□□ -1.62
SMARCE1-211ENST00000493660 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa4.93□□□□□ -1.62
SMARCE1-211ENST00000493660 CRPP02741 224 aa4.93□□□□□ -1.62
SMARCE1-211ENST00000493660 CXCL6P80162 114 aa4.93□□□□□ -1.62
SMARCE1-211ENST00000493660 Q6ZRP5 223 aa4.93□□□□□ -1.62
SMARCE1-211ENST00000493660 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa4.93□□□□□ -1.62
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