RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491166.1

TMCO3-208, Transcript of transmembrane and coiled-coil domains 3, human

TSL 2

Gene TMCO3, Length 595 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMCO3-208	ENST00000491166	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TMCO3-208	ENST00000491166	LINC00167	Q96N53	147 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TMCO3-208	ENST00000491166		H3BRM9	83 aa		7.46	□□□□□ -1.22
TMCO3-208	ENST00000491166	PFN2	P35080	140 aa		7.46	□□□□□ -1.22
TMCO3-208	ENST00000491166	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
TMCO3-208	ENST00000491166	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		7.45	□□□□□ -1.22
TMCO3-208	ENST00000491166	TMEM223	A0PJW6	202 aa		7.45	□□□□□ -1.22
TMCO3-208	ENST00000491166	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
TMCO3-208	ENST00000491166	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		7.45	□□□□□ -1.22
TMCO3-208	ENST00000491166	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		7.45	□□□□□ -1.22
TMCO3-208	ENST00000491166		A0A0U1RQV1	116 aa		7.44	□□□□□ -1.22
TMCO3-208	ENST00000491166	BCE1	O60756	84 aa		7.43	□□□□□ -1.22
TMCO3-208	ENST00000491166	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
TMCO3-208	ENST00000491166	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		7.43	□□□□□ -1.22
TMCO3-208	ENST00000491166	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		7.42	□□□□□ -1.22
TMCO3-208	ENST00000491166	IGKV2D-28	P01615	120 aa		7.42	□□□□□ -1.22
TMCO3-208	ENST00000491166	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TMCO3-208	ENST00000491166	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
TMCO3-208	ENST00000491166	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TMCO3-208	ENST00000491166	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TMCO3-208	ENST00000491166	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TMCO3-208	ENST00000491166	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TMCO3-208	ENST00000491166	ERG28	Q9UKR5	140 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TMCO3-208	ENST00000491166	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TMCO3-208	ENST00000491166	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TMCO3-208	ENST00000491166		A0A087X002	238 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TMCO3-208	ENST00000491166	DPM2	O94777	84 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TMCO3-208	ENST00000491166	C3orf79	P0CE67	100 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TMCO3-208	ENST00000491166		Q8NDZ9	215 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TMCO3-208	ENST00000491166		A0A0U1RRA0	63 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TMCO3-208	ENST00000491166	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
TMCO3-208	ENST00000491166	UBE2A	P49459	152 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TMCO3-208	ENST00000491166	TSPAN13	O95857	204 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TMCO3-208	ENST00000491166	IGKC	P01834	107 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TMCO3-208	ENST00000491166	VPREB1	P12018	145 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TMCO3-208	ENST00000491166	PLN	P26678	52 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TMCO3-208	ENST00000491166	PRLH	P81277	87 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TMCO3-208	ENST00000491166	LINC01545	Q5VT33	79 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TMCO3-208	ENST00000491166	TMEM238	C9JI98	176 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TMCO3-208	ENST00000491166	PRR4	Q16378	134 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TMCO3-208	ENST00000491166	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TMCO3-208	ENST00000491166	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TMCO3-208	ENST00000491166	KRTDAP	P60985	99 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TMCO3-208	ENST00000491166	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TMCO3-208	ENST00000491166	LEPROT	O15243	131 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TMCO3-208	ENST00000491166	LINC00158	P58513	81 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TMCO3-208	ENST00000491166	PET117	Q6UWS5	81 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TMCO3-208	ENST00000491166	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TMCO3-208	ENST00000491166	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TMCO3-208	ENST00000491166	CRYGA	P11844	174 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TMCO3-208	ENST00000491166	COX17	Q14061	63 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TMCO3-208	ENST00000491166	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TMCO3-208	ENST00000491166	TMEM126A	Q9H061	195 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TMCO3-208	ENST00000491166	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TMCO3-208	ENST00000491166		J3QQQ9	107 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TMCO3-208	ENST00000491166		M0R378	163 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TMCO3-208	ENST00000491166	SMIM13	P0DJ93	91 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TMCO3-208	ENST00000491166	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
TMCO3-208	ENST00000491166	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TMCO3-208	ENST00000491166	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TMCO3-208	ENST00000491166	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
TMCO3-208	ENST00000491166	ATOH7	Q8N100	152 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TMCO3-208	ENST00000491166	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TMCO3-208	ENST00000491166	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TMCO3-208	ENST00000491166		E9PLD3	99 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TMCO3-208	ENST00000491166	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TMCO3-208	ENST00000491166	SFTA2	Q6UW10	78 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TMCO3-208	ENST00000491166	HERVK_113	P61574	105 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TMCO3-208	ENST00000491166	DAND5	Q8N907	189 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TMCO3-208	ENST00000491166	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TMCO3-208	ENST00000491166	C5orf52	A6NGY3	159 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TMCO3-208	ENST00000491166	NCR3	O14931	201 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TMCO3-208	ENST00000491166	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
TMCO3-208	ENST00000491166	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TMCO3-208	ENST00000491166	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TMCO3-208	ENST00000491166	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TMCO3-208	ENST00000491166	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TMCO3-208	ENST00000491166	S100A6	P06703	90 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TMCO3-208	ENST00000491166	S100A2	P29034	98 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TMCO3-208	ENST00000491166	HERV-K104	P63124	156 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TMCO3-208	ENST00000491166	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TMCO3-208	ENST00000491166		A0A0J9YXY3	114 aa		7.27	□□□□□ -1.25
TMCO3-208	ENST00000491166	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
TMCO3-208	ENST00000491166	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TMCO3-208	ENST00000491166	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TMCO3-208	ENST00000491166	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TMCO3-208	ENST00000491166	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TMCO3-208	ENST00000491166	NMU	P48645	174 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TMCO3-208	ENST00000491166	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TMCO3-208	ENST00000491166	C20orf202	A1L168	122 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TMCO3-208	ENST00000491166	LITAF	Q99732	161 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TMCO3-208	ENST00000491166	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TMCO3-208	ENST00000491166	NPC2	P61916	151 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TMCO3-208	ENST00000491166	PCP2	Q8IVA1	136 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TMCO3-208	ENST00000491166	ZNF815P	A8K554	130 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TMCO3-208	ENST00000491166	SPRR4	Q96PI1	79 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TMCO3-208	ENST00000491166	PRY	O14603	147 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TMCO3-208	ENST00000491166	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TMCO3-208	ENST00000491166	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		7.2	□□□□□ -1.26
TMCO3-208	ENST00000491166	LINC00587	B1AMM8	73 aa		7.2	□□□□□ -1.26

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