RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489650.1

PTPRN-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-217ENST00000489650 RPL28P46779 137 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
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PTPRN-217ENST00000489650 H3BRM9 83 aa10.8□□□□□ -0.68
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PTPRN-217ENST00000489650 C20orf202A1L168 122 aa10.75□□□□□ -0.69
PTPRN-217ENST00000489650 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa10.75□□□□□ -0.69
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PTPRN-217ENST00000489650 HIST1H2BLQ99880 126 aa10.71□□□□□ -0.69
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PTPRN-217ENST00000489650 LINC01545Q5VT33 79 aa10.68□□□□□ -0.7
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PTPRN-217ENST00000489650 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa10.67□□□□□ -0.7
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PTPRN-217ENST00000489650 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa10.66□□□□□ -0.7
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PTPRN-217ENST00000489650 PPDPFQ9H3Y8 114 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRN-217ENST00000489650 HSBP1L1C9JCN9 74 aa10.59□□□□□ -0.71
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PTPRN-217ENST00000489650 TMEM126AQ9H061 195 aa10.59□□□□□ -0.71
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PTPRN-217ENST00000489650 M0R378 163 aa10.55□□□□□ -0.72
PTPRN-217ENST00000489650 HERV-K104P63124 156 aa10.55□□□□□ -0.72
PTPRN-217ENST00000489650 J3QQQ9 107 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRN-217ENST00000489650 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa10.54□□□□□ -0.72
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PTPRN-217ENST00000489650 CTAG1AP78358 180 aa10.52□□□□□ -0.73
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PTPRN-217ENST00000489650 ZNF815PA8K554 130 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRN-217ENST00000489650 TSPEAR-AS2P59090 65 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRN-217ENST00000489650 ANKRD39Q53RE8 183 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRN-217ENST00000489650 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRN-217ENST00000489650 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
PTPRN-217ENST00000489650 VAMP8Q9BV40 100 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRN-217ENST00000489650 Q8NBF4 154 aa10.43□□□□□ -0.74
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