RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 CCDC179H3BU77 68 aa6.59□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 COX17Q14061 63 aa6.59□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.59□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.59□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 TENM3Q9P273 2699 aa6.58□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 COL7A1Q02388 2944 aa6.58□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.58□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 A0A0J9YWU9 116 aa6.58□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 NDUFC2O95298 119 aa6.58□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.58□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.58□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 ATOX1O00244 68 aa6.57□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 UQCRQO14949 82 aa6.57□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 Q6JHZ5 121 aa6.57□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 C5orf38Q86SI9 138 aa6.57□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.57□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.57□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.57□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 A0A087WYN8 130 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 CFAP161Q6P656 301 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 Q9HAA7 133 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 C22orf24Q9Y442 160 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 A0A096LPF7 62 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 LECT2O14960 151 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 PFN2P35080 140 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 Q6ZTC4 211 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 LINC00167Q96N53 147 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 B9D2Q9BPU9 175 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 H3BQ85 93 aa6.54□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 XP32Q5T750 250 aa6.54□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.54□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 MRAPQ8TCY5 172 aa6.54□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 XCL1P47992 114 aa6.53□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.53□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.52□□□□□ -1.37
POLR1A-208ENST00000486964 HTN3P15516 51 aa6.52□□□□□ -1.37
POLR1A-208ENST00000486964 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.52□□□□□ -1.37
POLR1A-208ENST00000486964 LELP1Q5T871 98 aa6.51□□□□□ -1.37
POLR1A-208ENST00000486964 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.51□□□□□ -1.37
POLR1A-208ENST00000486964 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.51□□□□□ -1.37
POLR1A-208ENST00000486964 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR1A-208ENST00000486964 CCKP06307 115 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR1A-208ENST00000486964 COX7CP15954 63 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR1A-208ENST00000486964 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
POLR1A-208ENST00000486964 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
POLR1A-208ENST00000486964 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.49□□□□□ -1.37
POLR1A-208ENST00000486964 Q8N814 137 aa6.49□□□□□ -1.37
POLR1A-208ENST00000486964 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
POLR1A-208ENST00000486964 CRYGAP11844 174 aa6.48□□□□□ -1.37
POLR1A-208ENST00000486964 REG3AQ06141 175 aa6.48□□□□□ -1.37
POLR1A-208ENST00000486964 KIAA0087Q14695 138 aa6.48□□□□□ -1.37
POLR1A-208ENST00000486964 ESRGQ1W209 222 aa6.48□□□□□ -1.37
POLR1A-208ENST00000486964 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.47□□□□□ -1.37
POLR1A-208ENST00000486964 NCR3O14931 201 aa6.47□□□□□ -1.37
POLR1A-208ENST00000486964 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.47□□□□□ -1.37
POLR1A-208ENST00000486964 LINC00846Q9NV44 126 aa6.47□□□□□ -1.37
POLR1A-208ENST00000486964 PDE6GP18545 87 aa6.46□□□□□ -1.38
POLR1A-208ENST00000486964 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.46□□□□□ -1.38
POLR1A-208ENST00000486964 UBL5Q9BZL1 73 aa6.46□□□□□ -1.38
POLR1A-208ENST00000486964 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
POLR1A-208ENST00000486964 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.45□□□□□ -1.38
POLR1A-208ENST00000486964 SPAG11BQ08648 103 aa6.45□□□□□ -1.38
POLR1A-208ENST00000486964 SERP2Q8N6R1 65 aa6.45□□□□□ -1.38
POLR1A-208ENST00000486964 PRR34Q9NV39 138 aa6.45□□□□□ -1.38
POLR1A-208ENST00000486964 hADV29S1A0JD25 119 aa6.44□□□□□ -1.38
POLR1A-208ENST00000486964 LINC00575Q6W349 94 aa6.44□□□□□ -1.38
POLR1A-208ENST00000486964 Q8N3U1 123 aa6.44□□□□□ -1.38
POLR1A-208ENST00000486964 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.44□□□□□ -1.38
POLR1A-208ENST00000486964 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.43□□□□□ -1.38
POLR1A-208ENST00000486964 BCE1O60756 84 aa6.43□□□□□ -1.38
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POLR1A-208ENST00000486964 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.42□□□□□ -1.38
POLR1A-208ENST00000486964 USP17L23D6RBM5 183 aa6.42□□□□□ -1.38
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM258P61165 79 aa6.42□□□□□ -1.38
POLR1A-208ENST00000486964 C6orf99Q4VX62 202 aa6.42□□□□□ -1.38
POLR1A-208ENST00000486964 J3KT08 172 aa6.42□□□□□ -1.38
POLR1A-208ENST00000486964 IGLV6-57P01721 117 aa6.42□□□□□ -1.38
POLR1A-208ENST00000486964 ENHOQ6UWT2 76 aa6.42□□□□□ -1.38
POLR1A-208ENST00000486964 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.42□□□□□ -1.38
POLR1A-208ENST00000486964 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.41□□□□□ -1.38
POLR1A-208ENST00000486964 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
POLR1A-208ENST00000486964 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.41□□□□□ -1.38
POLR1A-208ENST00000486964 C6orf223Q8N319 242 aa6.41□□□□□ -1.38
POLR1A-208ENST00000486964 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.41□□□□□ -1.38
POLR1A-208ENST00000486964 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.4□□□□□ -1.39
POLR1A-208ENST00000486964 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.4□□□□□ -1.39
POLR1A-208ENST00000486964 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.4□□□□□ -1.39
POLR1A-208ENST00000486964 DIRC1Q969H9 104 aa6.4□□□□□ -1.39
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