RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 TPM4P67936 248 aa-1.45□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa-1.45□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 Q6ZUT4 128 aa-1.45□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 TAC4Q86UU9 113 aa-1.45□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 PPDPFLQ8WWR9 84 aa-1.45□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRELID3AQ96N28 172 aa-1.45□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa-1.45□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 OTORQ9NRC9 128 aa-1.45□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 ARMC1Q9NVT9 282 aa-1.45□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 NAIPQ13075 1403 aa-1.46□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 ANKARQ7Z5J8 1434 aa-1.46□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa-1.46□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM210A6NLX4 147 aa-1.46□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP-1.46□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 NIPSNAP2O75323 286 aa-1.46□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 ADCYAP1P18509 176 aa-1.46□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 GNG5P63218 68 aa-1.46□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 DEFB114Q30KQ6 69 aa-1.46□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa-1.46□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR5H6Q8NGV6 325 aa-1.46□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 SMIM7Q9BQ49 75 aa-1.46□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 GINS2Q9Y248 185 aa-1.46□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCDC141Q6ZP82 1450 aa-1.47□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa-1.47□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRAV22A0A0B4J277 110 aa-1.47□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 HCG22E2RYF7 251 aa-1.47□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 G3V2T6 193 aa-1.47□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 CETN3O15182 167 aa-1.47□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 NDUFC1O43677 76 aa-1.47□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP-1.47□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 COTL1Q14019 142 aa-1.47□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 RGS21Q2M5E4 152 aa-1.47□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa-1.47□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM74A4Q5TZK3 123 aa-1.47□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR2T2Q6IF00 324 aa-1.47□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 MORN4Q8NDC4 146 aa-1.47□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 VPS25Q9BRG1 176 aa-1.47□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 C9orf16Q9BUW7 83 aa-1.47□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 FXYD6Q9H0Q3 95 aa-1.47□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 FKBP11Q9NYL4 201 aa-1.47□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 STOML2Q9UJZ1 356 aa-1.47□□□□□ -2.64
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa-1.48□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 CSN2P05814 226 aa-1.48□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC25A4P12235 298 aa-1.48□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 SNX29P2Q8IUI4 249 aa-1.48□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 PBDC1Q9BVG4 233 aa-1.48□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa-1.48□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 SMPXQ9UHP9 88 aa-1.48□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa-1.48□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 SSR3Q9UNL2 185 aa-1.48□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa-1.49□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa-1.49□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 NPFFO15130 113 aa-1.49□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 FADDQ13158 208 aa-1.49□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPA17Q15506 151 aa-1.49□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR8B8Q15620 311 aa-1.49□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 C9orf153Q5TBE3 101 aa-1.49□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC48A1Q6P1K1 146 aa-1.49□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 MMGT1Q8N4V1 131 aa-1.49□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 DEFB105AQ8NG35 78 aa-1.49□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 DYNLRB2Q8TF09 96 aa-1.49□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 BORCS8Q96FH0 119 aa-1.49□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP-1.49□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa-1.49□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa-1.5□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa-1.5□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 M0R2P5 195 aa-1.5□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 SRP9P49458 86 aaKnown RBP-1.5□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 CRYBA4P53673 196 aa-1.5□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP-1.5□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 C4orf33Q8N1A6 199 aa-1.5□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 Q9Y3F1 56 aa-1.5□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPCS1Q9Y6A9 102 aa-1.5□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa-1.51□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa-1.51□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM238C9JI98 176 aa-1.51□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 M0QY20 66 aa-1.51□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 DEGS1O15121 323 aa-1.51□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 C3orf79P0CE67 100 aa-1.51□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 FABP2P12104 132 aa-1.51□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 RPS28P62857 69 aaKnown RBP-1.51□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 Q0VG73 95 aa-1.51□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 LTC4SQ16873 150 aa-1.51□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 DEFB106AQ8N104 65 aa-1.51□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 OTOSQ8NHW6 89 aa-1.51□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 COX7B2Q8TF08 81 aa-1.51□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa-1.52□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 MFSD11O43934 449 aa-1.52□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 ATG12O94817 140 aa-1.52□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP-1.52□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 WT1-ASQ06250 92 aa-1.52□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 ENHOQ6UWT2 76 aa-1.52□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa-1.52□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP-1.52□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 V9GYV3 84 aa-1.52□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 I3L2K1 104 aa-1.53□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 S100A6P06703 90 aa-1.53□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 CTXN2P0C2S0 81 aa-1.53□□□□□ -2.65
CACNA2D1-211ENST00000486539 CKS2P33552 79 aa-1.53□□□□□ -2.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.3 ms