RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486192.1

SORCS1-208, Transcript of sortilin related VPS10 domain containing receptor 1, humanhuman

TSL 2

Gene SORCS1, Length 632 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS1-208ENST00000486192 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa5.68□□□□□ -1.5
SORCS1-208ENST00000486192 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.68□□□□□ -1.5
SORCS1-208ENST00000486192 A0A087WYN8 130 aa5.67□□□□□ -1.5
SORCS1-208ENST00000486192 ZNF815PA8K554 130 aa5.67□□□□□ -1.5
SORCS1-208ENST00000486192 M0R143 59 aa5.67□□□□□ -1.5
SORCS1-208ENST00000486192 CHTF8P0CG12 524 aa5.67□□□□□ -1.5
SORCS1-208ENST00000486192 PFN2P35080 140 aa5.67□□□□□ -1.5
SORCS1-208ENST00000486192 GAGE2EQ4V326 116 aa5.67□□□□□ -1.5
SORCS1-208ENST00000486192 C14orf144Q96I85 54 aa5.67□□□□□ -1.5
SORCS1-208ENST00000486192 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.67□□□□□ -1.5
SORCS1-208ENST00000486192 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa5.66□□□□□ -1.5
SORCS1-208ENST00000486192 PANO1I0J062 215 aa5.66□□□□□ -1.5
SORCS1-208ENST00000486192 TIMM17BO60830 172 aa5.66□□□□□ -1.5
SORCS1-208ENST00000486192 LINC00158P58513 81 aa5.66□□□□□ -1.5
SORCS1-208ENST00000486192 ANKRD39Q53RE8 183 aa5.66□□□□□ -1.5
SORCS1-208ENST00000486192 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa5.66□□□□□ -1.5
SORCS1-208ENST00000486192 A0A0J9YXY3 114 aa5.65□□□□□ -1.5
SORCS1-208ENST00000486192 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SORCS1-208ENST00000486192 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa5.65□□□□□ -1.5
SORCS1-208ENST00000486192 FAT1Q14517 4588 aa5.65□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 MYCBP2O75592 4640 aa5.65□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa5.64□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 TMEM238C9JI98 176 aa5.64□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 SMIM13P0DJ93 91 aa5.64□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 RPL24P83731 157 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 Q5VSD8 79 aa5.64□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.64□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 Q6ZVH6 145 aa5.64□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 ARL17AQ8IVW1 177 aa5.64□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa5.64□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 C7orf33Q8WU49 177 aa5.64□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 COPS9Q8WXC6 57 aa5.64□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 VAMP8Q9BV40 100 aa5.64□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 XAGE1AQ9HD64 81 aa5.64□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 TP73-AS1Q9UF72 201 aa5.64□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa5.63□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 MIEN1Q9BRT3 115 aa5.63□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 PPDPFQ9H3Y8 114 aa5.63□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 CBY1Q9Y3M2 126 aa5.63□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 A0A1W2PNN7 141 aa5.62□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 FAM229AH3BQW9 127 aa5.62□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 M0QXV9 152 aa5.62□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 DLEU1O43261 78 aa5.62□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 PCP2Q8IVA1 136 aa5.62□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 A0A0U1RRA0 63 aa5.61□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 COX8AP10176 69 aa5.61□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 HAMPP81172 84 aa5.61□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 SPATA45Q537H7 98 aa5.61□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 BOD1L2Q8IYS8 172 aa5.61□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 NKAPP1Q8N9T2 125 aa5.61□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 LITAFQ99732 161 aa5.61□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 SPANXDQ9BXN6 97 aa5.61□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 TTTY13Q9BZ97 58 aa5.61□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 SPANXCQ9NY87 97 aa5.61□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 PAM16Q9Y3D7 125 aa5.61□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.61□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 FAM168BA1KXE4 195 aa5.6□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 NDUFC2O95298 119 aa5.6□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 VPREB1P12018 145 aa5.6□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 IFITM1P13164 125 aa5.6□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa5.6□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 C22orf24Q9Y442 160 aa5.6□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 DNAH8Q96JB1 4490 aa5.6□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa5.59□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa5.59□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa5.59□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
SORCS1-208ENST00000486192 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa5.58□□□□□ -1.52
SORCS1-208ENST00000486192 A0A1B0GV90 55 aa5.58□□□□□ -1.52
SORCS1-208ENST00000486192 UBE2BP63146 152 aa5.58□□□□□ -1.52
SORCS1-208ENST00000486192 SLC25A34Q6PIV7 304 aa5.58□□□□□ -1.52
SORCS1-208ENST00000486192 DAND5Q8N907 189 aa5.58□□□□□ -1.52
SORCS1-208ENST00000486192 LINC00308Q8TCZ7 52 aa5.58□□□□□ -1.52
SORCS1-208ENST00000486192 PRO1933Q9H354 126 aa5.58□□□□□ -1.52
SORCS1-208ENST00000486192 M0R378 163 aa5.57□□□□□ -1.52
SORCS1-208ENST00000486192 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
SORCS1-208ENST00000486192 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
SORCS1-208ENST00000486192 HIGD1BQ9P298 99 aa5.57□□□□□ -1.52
SORCS1-208ENST00000486192 UQCR10Q9UDW1 63 aa5.57□□□□□ -1.52
SORCS1-208ENST00000486192 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.56□□□□□ -1.52
SORCS1-208ENST00000486192 PRR3P79522 188 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
SORCS1-208ENST00000486192 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa5.55□□□□□ -1.52
SORCS1-208ENST00000486192 LINC00167Q96N53 147 aa5.55□□□□□ -1.52
SORCS1-208ENST00000486192 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa5.54□□□□□ -1.52
SORCS1-208ENST00000486192 Q8NDZ9 215 aa5.54□□□□□ -1.52
SORCS1-208ENST00000486192 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.54□□□□□ -1.52
SORCS1-208ENST00000486192 NCR3O14931 201 aa5.53□□□□□ -1.52
SORCS1-208ENST00000486192 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
SORCS1-208ENST00000486192 NPC2P61916 151 aa5.53□□□□□ -1.52
SORCS1-208ENST00000486192 TAL2Q16559 108 aa5.53□□□□□ -1.52
SORCS1-208ENST00000486192 HIST1H4GQ99525 98 aa5.53□□□□□ -1.52
SORCS1-208ENST00000486192 SNHG12Q9BXW3 62 aa5.53□□□□□ -1.52
SORCS1-208ENST00000486192 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa5.52□□□□□ -1.53
SORCS1-208ENST00000486192 GAGE10A6NGK3 116 aa5.52□□□□□ -1.53
SORCS1-208ENST00000486192 A6NJY4 79 aa5.52□□□□□ -1.53
SORCS1-208ENST00000486192 RPL37AP8A6NKH3 93 aa5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms