RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478378.5

TIMM17A-202, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 17A, humanhuman

TSL 3

Gene TIMM17A, Length 821 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17A-202ENST00000478378 IFI27L1Q96BM0 104 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMM17A-202ENST00000478378 CST9LQ9H4G1 147 aa3.92□□□□□ -1.78
TIMM17A-202ENST00000478378 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa3.91□□□□□ -1.78
TIMM17A-202ENST00000478378 H0Y8G0 127 aa3.91□□□□□ -1.78
TIMM17A-202ENST00000478378 LEPROTL1O95214 131 aa3.91□□□□□ -1.78
TIMM17A-202ENST00000478378 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
TIMM17A-202ENST00000478378 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa3.91□□□□□ -1.78
TIMM17A-202ENST00000478378 LINC00304Q8N9R0 145 aa3.91□□□□□ -1.78
TIMM17A-202ENST00000478378 C6orf48Q9UBA6 75 aa3.91□□□□□ -1.78
TIMM17A-202ENST00000478378 IGLC3P0DOY3 106 aa3.9□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 RPL28P46779 137 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 C10orf25Q5T742 122 aa3.9□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa3.9□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 LINC00469Q8N7U9 141 aa3.9□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa3.9□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 HSPB8Q9UJY1 196 aa3.9□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa3.89□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 C11orf86A6NJI1 115 aa3.89□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa3.89□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 HERVK_113P63121 156 aa3.89□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 SEC11AP67812 179 aa3.89□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa3.89□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 PPDPFQ9H3Y8 114 aa3.89□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa3.88□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa3.88□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 SMIM1B2RUZ4 78 aa3.88□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 F8VRH5 84 aa3.88□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 SPINK8P0C7L1 97 aa3.88□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 HIST3H2BBQ8N257 126 aa3.88□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 PMCHL2Q9BQD1 86 aa3.88□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa3.87□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 BCE1O60756 84 aa3.87□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 S100A6P06703 90 aa3.87□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.87□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 TMEM170BQ5T4T1 132 aa3.87□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 LINC01561Q8N1V8 128 aa3.87□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa3.87□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 ANAPC11Q9NYG5 84 aa3.87□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 TOMM7Q9P0U1 55 aa3.87□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 H3BRM9 83 aa3.86□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa3.86□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 C3orf79P0CE67 100 aa3.86□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 S100A2P29034 98 aa3.86□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 KRTDAPP60985 99 aa3.86□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 CTAG1AP78358 180 aa3.86□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 KIAA0087Q14695 138 aa3.86□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa3.86□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 FAM229BQ4G0N7 80 aa3.86□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 C2orf82Q6UX34 121 aa3.86□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 LINC00337Q8N6G1 96 aa3.86□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 HIST1H2BLQ99880 126 aa3.86□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa3.85□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa3.85□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 C5orf52A6NGY3 159 aa3.85□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 DPM2O94777 84 aa3.85□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 PRSS2P07478 247 aa3.85□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 LINC01545Q5VT33 79 aa3.85□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 COX7B2Q8TF08 81 aa3.85□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 C22orf24Q9Y442 160 aa3.85□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 TMEM223A0PJW6 202 aa3.84□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 IGKCP01834 107 aa3.84□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 PLNP26678 52 aa3.84□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 UBE2AP49459 152 aa3.84□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 PET117Q6UWS5 81 aa3.84□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 Q8IZM0 81 aa3.84□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 TP73-AS1Q9UF72 201 aa3.84□□□□□ -1.79
TIMM17A-202ENST00000478378 CFC1BP0CG36 223 aa3.83□□□□□ -1.8
TIMM17A-202ENST00000478378 TSPEAR-AS2P59090 65 aa3.83□□□□□ -1.8
TIMM17A-202ENST00000478378 CKS1BP61024 79 aa3.83□□□□□ -1.8
TIMM17A-202ENST00000478378 C6orf226Q5I0X4 101 aa3.83□□□□□ -1.8
TIMM17A-202ENST00000478378 ATOH7Q8N100 152 aa3.83□□□□□ -1.8
TIMM17A-202ENST00000478378 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa3.83□□□□□ -1.8
TIMM17A-202ENST00000478378 XAGE1AQ9HD64 81 aa3.83□□□□□ -1.8
TIMM17A-202ENST00000478378 C20orf202A1L168 122 aa3.82□□□□□ -1.8
TIMM17A-202ENST00000478378 CXCL5P42830 114 aa3.82□□□□□ -1.8
TIMM17A-202ENST00000478378 HERVK_113P61574 105 aa3.82□□□□□ -1.8
TIMM17A-202ENST00000478378 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.82□□□□□ -1.8
TIMM17A-202ENST00000478378 RPL37AP8A6NKH3 93 aa3.81□□□□□ -1.8
TIMM17A-202ENST00000478378 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa3.81□□□□□ -1.8
TIMM17A-202ENST00000478378 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
TIMM17A-202ENST00000478378 J3QQQ9 107 aa3.8□□□□□ -1.8
TIMM17A-202ENST00000478378 LEPROTO15243 131 aa3.8□□□□□ -1.8
TIMM17A-202ENST00000478378 ANKRD39Q53RE8 183 aa3.8□□□□□ -1.8
TIMM17A-202ENST00000478378 SPAG11AQ6PDA7 123 aa3.8□□□□□ -1.8
TIMM17A-202ENST00000478378 PLEKHB2Q96CS7 222 aa3.8□□□□□ -1.8
TIMM17A-202ENST00000478378 LINC00167Q96N53 147 aa3.8□□□□□ -1.8
TIMM17A-202ENST00000478378 NDUFA12Q9UI09 145 aa3.8□□□□□ -1.8
TIMM17A-202ENST00000478378 GAGE10A6NGK3 116 aa3.79□□□□□ -1.8
TIMM17A-202ENST00000478378 E9PLD3 99 aa3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.6 ms