RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477049.1

SETX-205, Transcript of senataxin, human

TSL 3

Gene SETX, Length 4,067 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SETX-205	ENST00000477049	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SETX-205	ENST00000477049	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SETX-205	ENST00000477049		A0A1B0GUV1	79 aa		5.09	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		5.09	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		5.09	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049		Q8N814	137 aa		5.09	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049	CCK	P06307	115 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049	MUC7	Q8TAX7	377 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049	VWF	P04275	2813 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049	INAFM1	C9JVW0	142 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049	TMEM258	P61165	79 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049	MRAP	Q8TCY5	172 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049		A0A087WVE0	104 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049	SCX	Q7RTU7	201 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049	BPY2	O14599	106 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049	LINC00846	Q9NV44	126 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049	CDK2AP2	O75956	126 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049	NDUFC2	O95298	119 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049	LINC01600	Q96MT4	127 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049	SYCN	Q0VAF6	134 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049	LY6G6D	O95868	133 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049	FAM236C	P0DP71	79 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049		X6R8D5	127 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049		M0R378	163 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049	IGKV2D-28	P01615	120 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SETX-205	ENST00000477049	C3orf84	H3BNL1	204 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SETX-205	ENST00000477049	C6orf223	Q8N319	242 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SETX-205	ENST00000477049	MP68	P56378	58 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SETX-205	ENST00000477049	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SETX-205	ENST00000477049		Q8N3U1	123 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SETX-205	ENST00000477049	SNURF	Q9Y675	71 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SETX-205	ENST00000477049	LINC00575	Q6W349	94 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SETX-205	ENST00000477049	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SETX-205	ENST00000477049	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SETX-205	ENST00000477049	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SETX-205	ENST00000477049	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SETX-205	ENST00000477049	F8	P00451	2351 aa		5	□□□□□ -1.61
SETX-205	ENST00000477049	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		5	□□□□□ -1.61
SETX-205	ENST00000477049	NDUFC1	O43677	76 aa		5	□□□□□ -1.61
SETX-205	ENST00000477049	C22orf24	Q9Y442	160 aa		5	□□□□□ -1.61
SETX-205	ENST00000477049	C5orf47	Q569G3	176 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SETX-205	ENST00000477049	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SETX-205	ENST00000477049	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SETX-205	ENST00000477049	CELA1	Q9UNI1	258 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SETX-205	ENST00000477049	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SETX-205	ENST00000477049	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SETX-205	ENST00000477049	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SETX-205	ENST00000477049	UBE2A	P49459	152 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SETX-205	ENST00000477049	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SETX-205	ENST00000477049	NDUFB1	O75438	58 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SETX-205	ENST00000477049	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SETX-205	ENST00000477049	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SETX-205	ENST00000477049		Q6ZVQ6	151 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SETX-205	ENST00000477049	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SETX-205	ENST00000477049	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SETX-205	ENST00000477049	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SETX-205	ENST00000477049	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SETX-205	ENST00000477049		Q6ZTC4	211 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SETX-205	ENST00000477049	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SETX-205	ENST00000477049	CRYGA	P11844	174 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SETX-205	ENST00000477049	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SETX-205	ENST00000477049	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SETX-205	ENST00000477049	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SETX-205	ENST00000477049		Q8NAQ8	132 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SETX-205	ENST00000477049	RETN	Q9HD89	108 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SETX-205	ENST00000477049	NDUFS5	O43920	106 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SETX-205	ENST00000477049	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SETX-205	ENST00000477049	HIVEP1	P15822	2718 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SETX-205	ENST00000477049		A0A0J9YWU9	116 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SETX-205	ENST00000477049	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SETX-205	ENST00000477049	KIAA0087	Q14695	138 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SETX-205	ENST00000477049	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SETX-205	ENST00000477049	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SETX-205	ENST00000477049	ATR	Q13535	2644 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SETX-205	ENST00000477049	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SETX-205	ENST00000477049		A0A096LNI7	61 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SETX-205	ENST00000477049		Q6ZRU5	148 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SETX-205	ENST00000477049	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SETX-205	ENST00000477049	C2orf48	Q96LS8	159 aa		4.95	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.1 ms