RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 SCO1O75880 301 aa8.16□□□□□ -1.1
PRAME-211ENST00000476336 PLEKHB2Q96CS7 222 aa8.16□□□□□ -1.1
PRAME-211ENST00000476336 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa8.16□□□□□ -1.1
PRAME-211ENST00000476336 IGKCP01834 107 aa8.15□□□□□ -1.1
PRAME-211ENST00000476336 MT1HL1P0DM35 61 aa8.15□□□□□ -1.1
PRAME-211ENST00000476336 LINC00158P58513 81 aa8.15□□□□□ -1.1
PRAME-211ENST00000476336 H0Y9J4 135 aa8.14□□□□□ -1.11
PRAME-211ENST00000476336 LEPROTO15243 131 aa8.14□□□□□ -1.11
PRAME-211ENST00000476336 S100A1P23297 94 aa8.14□□□□□ -1.11
PRAME-211ENST00000476336 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa8.14□□□□□ -1.11
PRAME-211ENST00000476336 LINC00167Q96N53 147 aa8.14□□□□□ -1.11
PRAME-211ENST00000476336 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.14□□□□□ -1.11
PRAME-211ENST00000476336 ZNF861PO60384 105 aa8.13□□□□□ -1.11
PRAME-211ENST00000476336 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
PRAME-211ENST00000476336 NMUP48645 174 aa8.13□□□□□ -1.11
PRAME-211ENST00000476336 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.13□□□□□ -1.11
PRAME-211ENST00000476336 BCE1O60756 84 aa8.12□□□□□ -1.11
PRAME-211ENST00000476336 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PRAME-211ENST00000476336 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa8.11□□□□□ -1.11
PRAME-211ENST00000476336 J3QQQ9 107 aa8.11□□□□□ -1.11
PRAME-211ENST00000476336 VPREB1P12018 145 aa8.11□□□□□ -1.11
PRAME-211ENST00000476336 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
PRAME-211ENST00000476336 KRTAP10-8P60410 259 aa8.1□□□□□ -1.11
PRAME-211ENST00000476336 PET117Q6UWS5 81 aa8.1□□□□□ -1.11
PRAME-211ENST00000476336 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa8.09□□□□□ -1.11
PRAME-211ENST00000476336 RPL37AP8A6NKH3 93 aa8.09□□□□□ -1.11
PRAME-211ENST00000476336 AKR1D1P51857 326 aa8.09□□□□□ -1.11
PRAME-211ENST00000476336 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.08□□□□□ -1.12
PRAME-211ENST00000476336 GAGE10A6NGK3 116 aa8.08□□□□□ -1.12
PRAME-211ENST00000476336 SMIM13P0DJ93 91 aa8.08□□□□□ -1.12
PRAME-211ENST00000476336 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
PRAME-211ENST00000476336 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.08□□□□□ -1.12
PRAME-211ENST00000476336 TNXBP22105 4242 aa8.07□□□□□ -1.12
PRAME-211ENST00000476336 E9PLD3 99 aa8.07□□□□□ -1.12
PRAME-211ENST00000476336 M0R378 163 aa8.07□□□□□ -1.12
PRAME-211ENST00000476336 LINC01545Q5VT33 79 aa8.07□□□□□ -1.12
PRAME-211ENST00000476336 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.07□□□□□ -1.12
PRAME-211ENST00000476336 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa8.06□□□□□ -1.12
PRAME-211ENST00000476336 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa8.06□□□□□ -1.12
PRAME-211ENST00000476336 A0A0U1RRA0 63 aa8.06□□□□□ -1.12
PRAME-211ENST00000476336 IGKV2D-28P01615 120 aa8.06□□□□□ -1.12
PRAME-211ENST00000476336 UBE2AP49459 152 aa8.06□□□□□ -1.12
PRAME-211ENST00000476336 S100A12P80511 92 aa8.06□□□□□ -1.12
PRAME-211ENST00000476336 ARL17AQ8IVW1 177 aa8.06□□□□□ -1.12
PRAME-211ENST00000476336 BOD1L2Q8IYS8 172 aa8.05□□□□□ -1.12
PRAME-211ENST00000476336 MIEN1Q9BRT3 115 aa8.05□□□□□ -1.12
PRAME-211ENST00000476336 C20orf202A1L168 122 aa8.04□□□□□ -1.12
PRAME-211ENST00000476336 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.04□□□□□ -1.12
PRAME-211ENST00000476336 TMEM126AQ9H061 195 aa8.04□□□□□ -1.12
PRAME-211ENST00000476336 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.03□□□□□ -1.12
PRAME-211ENST00000476336 C3orf79P0CE67 100 aa8.03□□□□□ -1.12
PRAME-211ENST00000476336 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa8.02□□□□□ -1.13
PRAME-211ENST00000476336 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa8.02□□□□□ -1.13
PRAME-211ENST00000476336 NDUFC2O95298 119 aa8.01□□□□□ -1.13
PRAME-211ENST00000476336 KRTDAPP60985 99 aa8.01□□□□□ -1.13
PRAME-211ENST00000476336 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa8.01□□□□□ -1.13
PRAME-211ENST00000476336 PRYO14603 147 aa8□□□□□ -1.13
PRAME-211ENST00000476336 PRR26Q8N8Z3 221 aa8□□□□□ -1.13
PRAME-211ENST00000476336 LRP2P98164 4655 aa7.99□□□□□ -1.13
PRAME-211ENST00000476336 A0A0J9YXY3 114 aa7.99□□□□□ -1.13
PRAME-211ENST00000476336 TIMM17BO60830 172 aa7.99□□□□□ -1.13
PRAME-211ENST00000476336 Q8NDZ9 215 aa7.99□□□□□ -1.13
PRAME-211ENST00000476336 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.99□□□□□ -1.13
PRAME-211ENST00000476336 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PRAME-211ENST00000476336 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.99□□□□□ -1.13
PRAME-211ENST00000476336 TMEM238C9JI98 176 aa7.98□□□□□ -1.13
PRAME-211ENST00000476336 CRYGAP11844 174 aa7.98□□□□□ -1.13
PRAME-211ENST00000476336 S100A2P29034 98 aa7.98□□□□□ -1.13
PRAME-211ENST00000476336 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
PRAME-211ENST00000476336 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.98□□□□□ -1.13
PRAME-211ENST00000476336 NCR3O14931 201 aa7.97□□□□□ -1.13
PRAME-211ENST00000476336 S100A6P06703 90 aa7.97□□□□□ -1.13
PRAME-211ENST00000476336 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.97□□□□□ -1.13
PRAME-211ENST00000476336 DAND5Q8N907 189 aa7.97□□□□□ -1.13
PRAME-211ENST00000476336 ZNF815PA8K554 130 aa7.96□□□□□ -1.14
PRAME-211ENST00000476336 SPRR1AP35321 89 aa7.96□□□□□ -1.14
PRAME-211ENST00000476336 PRLHP81277 87 aa7.96□□□□□ -1.14
PRAME-211ENST00000476336 COPS9Q8WXC6 57 aa7.96□□□□□ -1.14
PRAME-211ENST00000476336 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.95□□□□□ -1.14
PRAME-211ENST00000476336 DDTP30046 118 aa7.95□□□□□ -1.14
PRAME-211ENST00000476336 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.95□□□□□ -1.14
PRAME-211ENST00000476336 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PRAME-211ENST00000476336 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.94□□□□□ -1.14
PRAME-211ENST00000476336 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.93□□□□□ -1.14
PRAME-211ENST00000476336 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.93□□□□□ -1.14
PRAME-211ENST00000476336 SPANXCQ9NY87 97 aa7.93□□□□□ -1.14
PRAME-211ENST00000476336 CTAG1AP78358 180 aa7.92□□□□□ -1.14
PRAME-211ENST00000476336 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.92□□□□□ -1.14
PRAME-211ENST00000476336 Q6ZVH6 145 aa7.92□□□□□ -1.14
PRAME-211ENST00000476336 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.92□□□□□ -1.14
PRAME-211ENST00000476336 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.92□□□□□ -1.14
PRAME-211ENST00000476336 IGLV6-57P01721 117 aa7.91□□□□□ -1.14
PRAME-211ENST00000476336 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
PRAME-211ENST00000476336 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.91□□□□□ -1.14
PRAME-211ENST00000476336 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.91□□□□□ -1.14
PRAME-211ENST00000476336 LITAFQ99732 161 aa7.91□□□□□ -1.14
PRAME-211ENST00000476336 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.91□□□□□ -1.14
PRAME-211ENST00000476336 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.91□□□□□ -1.14
PRAME-211ENST00000476336 RNF213Q63HN8 5207 aa7.9□□□□□ -1.14
PRAME-211ENST00000476336 A0A087X002 238 aa7.9□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 124.8 ms