RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472027.1

SYN3-211, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 4

Gene SYN3, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-211ENST00000472027 H0Y9J4 135 aa5.55□□□□□ -1.52
SYN3-211ENST00000472027 LINC00158P58513 81 aa5.55□□□□□ -1.52
SYN3-211ENST00000472027 C4orf48Q5BLP8 95 aa5.55□□□□□ -1.52
SYN3-211ENST00000472027 NKAPP1Q8N9T2 125 aa5.55□□□□□ -1.52
SYN3-211ENST00000472027 PMCHL2Q9BQD1 86 aa5.55□□□□□ -1.52
SYN3-211ENST00000472027 TNXBP22105 4242 aa5.55□□□□□ -1.52
SYN3-211ENST00000472027 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
SYN3-211ENST00000472027 A0A0U1RRA0 63 aa5.54□□□□□ -1.52
SYN3-211ENST00000472027 ZNF861PO60384 105 aa5.54□□□□□ -1.52
SYN3-211ENST00000472027 PLNP26678 52 aa5.54□□□□□ -1.52
SYN3-211ENST00000472027 RPL24P83731 157 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
SYN3-211ENST00000472027 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa5.54□□□□□ -1.52
SYN3-211ENST00000472027 LEPROTO15243 131 aa5.53□□□□□ -1.52
SYN3-211ENST00000472027 BCE1O60756 84 aa5.53□□□□□ -1.52
SYN3-211ENST00000472027 DPM2O94777 84 aa5.53□□□□□ -1.52
SYN3-211ENST00000472027 IGKCP01834 107 aa5.53□□□□□ -1.52
SYN3-211ENST00000472027 SMIM13P0DJ93 91 aa5.53□□□□□ -1.52
SYN3-211ENST00000472027 VPREB1P12018 145 aa5.53□□□□□ -1.52
SYN3-211ENST00000472027 HERV-K104P63124 156 aa5.53□□□□□ -1.52
SYN3-211ENST00000472027 MEIG1Q5JSS6 88 aa5.53□□□□□ -1.52
SYN3-211ENST00000472027 NDUFA12Q9UI09 145 aa5.53□□□□□ -1.52
SYN3-211ENST00000472027 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa5.52□□□□□ -1.53
SYN3-211ENST00000472027 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa5.52□□□□□ -1.53
SYN3-211ENST00000472027 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa5.52□□□□□ -1.53
SYN3-211ENST00000472027 LINC00587B1AMM8 73 aa5.52□□□□□ -1.53
SYN3-211ENST00000472027 ATP6V1G1O75348 118 aa5.52□□□□□ -1.53
SYN3-211ENST00000472027 IGKV2D-28P01615 120 aa5.52□□□□□ -1.53
SYN3-211ENST00000472027 Q8NDZ9 215 aa5.52□□□□□ -1.53
SYN3-211ENST00000472027 PLEKHB2Q96CS7 222 aa5.52□□□□□ -1.53
SYN3-211ENST00000472027 J3QQQ9 107 aa5.51□□□□□ -1.53
SYN3-211ENST00000472027 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.51□□□□□ -1.53
SYN3-211ENST00000472027 TSPEAR-AS2P59090 65 aa5.51□□□□□ -1.53
SYN3-211ENST00000472027 HERVK_113P61574 105 aa5.51□□□□□ -1.53
SYN3-211ENST00000472027 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa5.51□□□□□ -1.53
SYN3-211ENST00000472027 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.51□□□□□ -1.53
SYN3-211ENST00000472027 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.51□□□□□ -1.53
SYN3-211ENST00000472027 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa5.5□□□□□ -1.53
SYN3-211ENST00000472027 RPL28P46779 137 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SYN3-211ENST00000472027 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SYN3-211ENST00000472027 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SYN3-211ENST00000472027 TMEM238C9JI98 176 aa5.48□□□□□ -1.53
SYN3-211ENST00000472027 E9PLD3 99 aa5.48□□□□□ -1.53
SYN3-211ENST00000472027 M0R378 163 aa5.48□□□□□ -1.53
SYN3-211ENST00000472027 NMUP48645 174 aa5.48□□□□□ -1.53
SYN3-211ENST00000472027 UBE2AP49459 152 aa5.48□□□□□ -1.53
SYN3-211ENST00000472027 PET117Q6UWS5 81 aa5.48□□□□□ -1.53
SYN3-211ENST00000472027 BOD1L2Q8IYS8 172 aa5.48□□□□□ -1.53
SYN3-211ENST00000472027 TMEM126AQ9H061 195 aa5.48□□□□□ -1.53
SYN3-211ENST00000472027 C3orf79P0CE67 100 aa5.47□□□□□ -1.53
SYN3-211ENST00000472027 S100A1P23297 94 aa5.47□□□□□ -1.53
SYN3-211ENST00000472027 LINC01545Q5VT33 79 aa5.47□□□□□ -1.53
SYN3-211ENST00000472027 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa5.47□□□□□ -1.53
SYN3-211ENST00000472027 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa5.47□□□□□ -1.53
SYN3-211ENST00000472027 DAND5Q8N907 189 aa5.47□□□□□ -1.53
SYN3-211ENST00000472027 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa5.46□□□□□ -1.54
SYN3-211ENST00000472027 NCR3O14931 201 aa5.46□□□□□ -1.54
SYN3-211ENST00000472027 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
SYN3-211ENST00000472027 ARL17AQ8IVW1 177 aa5.46□□□□□ -1.54
SYN3-211ENST00000472027 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa5.45□□□□□ -1.54
SYN3-211ENST00000472027 A0A0J9YXY3 114 aa5.45□□□□□ -1.54
SYN3-211ENST00000472027 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
SYN3-211ENST00000472027 KRTDAPP60985 99 aa5.45□□□□□ -1.54
SYN3-211ENST00000472027 PRLHP81277 87 aa5.45□□□□□ -1.54
SYN3-211ENST00000472027 A0A087X002 238 aa5.43□□□□□ -1.54
SYN3-211ENST00000472027 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa5.43□□□□□ -1.54
SYN3-211ENST00000472027 LCE2CQ5TA81 110 aa5.43□□□□□ -1.54
SYN3-211ENST00000472027 MIEN1Q9BRT3 115 aa5.43□□□□□ -1.54
SYN3-211ENST00000472027 KCNQ1DNQ9H478 68 aa5.43□□□□□ -1.54
SYN3-211ENST00000472027 ANAPC11Q9NYG5 84 aa5.43□□□□□ -1.54
SYN3-211ENST00000472027 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa5.42□□□□□ -1.54
SYN3-211ENST00000472027 PRYO14603 147 aa5.42□□□□□ -1.54
SYN3-211ENST00000472027 NDUFC2O95298 119 aa5.42□□□□□ -1.54
SYN3-211ENST00000472027 CRYGAP11844 174 aa5.42□□□□□ -1.54
SYN3-211ENST00000472027 SPRR1AP35321 89 aa5.42□□□□□ -1.54
SYN3-211ENST00000472027 NPC2P61916 151 aa5.42□□□□□ -1.54
SYN3-211ENST00000472027 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa5.41□□□□□ -1.54
SYN3-211ENST00000472027 C20orf202A1L168 122 aa5.41□□□□□ -1.54
SYN3-211ENST00000472027 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
SYN3-211ENST00000472027 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa5.41□□□□□ -1.54
SYN3-211ENST00000472027 LINC00337Q8N6G1 96 aa5.41□□□□□ -1.54
SYN3-211ENST00000472027 TYMSOSQ8TAI1 123 aa5.41□□□□□ -1.54
SYN3-211ENST00000472027 HIGD2AQ9BW72 106 aa5.41□□□□□ -1.54
SYN3-211ENST00000472027 TTTY13Q9BZ97 58 aa5.41□□□□□ -1.54
SYN3-211ENST00000472027 ZNF815PA8K554 130 aa5.4□□□□□ -1.54
SYN3-211ENST00000472027 DDTP30046 118 aa5.4□□□□□ -1.54
SYN3-211ENST00000472027 S100A12P80511 92 aa5.4□□□□□ -1.54
SYN3-211ENST00000472027 LITAFQ99732 161 aa5.4□□□□□ -1.54
SYN3-211ENST00000472027 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
SYN3-211ENST00000472027 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa5.39□□□□□ -1.55
SYN3-211ENST00000472027 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
SYN3-211ENST00000472027 TIMM17BO60830 172 aa5.39□□□□□ -1.55
SYN3-211ENST00000472027 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.39□□□□□ -1.55
SYN3-211ENST00000472027 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.39□□□□□ -1.55
SYN3-211ENST00000472027 ANKRD39Q53RE8 183 aa5.39□□□□□ -1.55
SYN3-211ENST00000472027 S100A7L2Q5SY68 101 aa5.39□□□□□ -1.55
SYN3-211ENST00000472027 ATOH7Q8N100 152 aa5.39□□□□□ -1.55
SYN3-211ENST00000472027 HIST3H2BBQ8N257 126 aa5.39□□□□□ -1.55
SYN3-211ENST00000472027 LINC00308Q8TCZ7 52 aa5.39□□□□□ -1.55
SYN3-211ENST00000472027 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.38□□□□□ -1.55
SYN3-211ENST00000472027 IGLV6-57P01721 117 aa5.38□□□□□ -1.55
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