RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469694.5

GPC1-208, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 2

Gene GPC1, Length 2,862 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-208ENST00000469694 SERP1Q9Y6X1 66 aa9.62□□□□□ -0.87
GPC1-208ENST00000469694 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa9.61□□□□□ -0.87
GPC1-208ENST00000469694 PAX4O43316 350 aa9.61□□□□□ -0.87
GPC1-208ENST00000469694 LINC00167Q96N53 147 aa9.61□□□□□ -0.87
GPC1-208ENST00000469694 NOTCH1P46531 2555 aa9.61□□□□□ -0.87
GPC1-208ENST00000469694 K7EQD1 137 aa9.61□□□□□ -0.87
GPC1-208ENST00000469694 PRO0628Q9UI54 55 aa9.61□□□□□ -0.87
GPC1-208ENST00000469694 X6R8D5 127 aa9.61□□□□□ -0.87
GPC1-208ENST00000469694 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa9.61□□□□□ -0.87
GPC1-208ENST00000469694 H7BZZ5 65 aa9.61□□□□□ -0.87
GPC1-208ENST00000469694 ANK2Q01484 3957 aa9.6□□□□□ -0.87
GPC1-208ENST00000469694 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa9.6□□□□□ -0.87
GPC1-208ENST00000469694 LINC00336Q6ZUF6 198 aa9.6□□□□□ -0.87
GPC1-208ENST00000469694 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa9.59□□□□□ -0.87
GPC1-208ENST00000469694 UBE2L6O14933 153 aa9.59□□□□□ -0.87
GPC1-208ENST00000469694 UBL5Q9BZL1 73 aa9.58□□□□□ -0.88
GPC1-208ENST00000469694 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa9.57□□□□□ -0.88
GPC1-208ENST00000469694 BCE1O60756 84 aa9.57□□□□□ -0.88
GPC1-208ENST00000469694 Q8N814 137 aa9.57□□□□□ -0.88
GPC1-208ENST00000469694 TRAV7A0A075B6U4 112 aa9.57□□□□□ -0.88
GPC1-208ENST00000469694 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa9.57□□□□□ -0.88
GPC1-208ENST00000469694 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa9.56□□□□□ -0.88
GPC1-208ENST00000469694 KRTAP10-11P60412 298 aa9.55□□□□□ -0.88
GPC1-208ENST00000469694 KLKP1Q107X0 134 aa9.54□□□□□ -0.88
GPC1-208ENST00000469694 A0A087WZ39 114 aa9.53□□□□□ -0.88
GPC1-208ENST00000469694 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa9.53□□□□□ -0.88
GPC1-208ENST00000469694 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
GPC1-208ENST00000469694 A0A096LPF7 62 aa9.53□□□□□ -0.88
GPC1-208ENST00000469694 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa9.52□□□□□ -0.88
GPC1-208ENST00000469694 CMYA5Q8N3K9 4069 aa9.52□□□□□ -0.89
GPC1-208ENST00000469694 APOC4P55056 127 aa9.52□□□□□ -0.89
GPC1-208ENST00000469694 SMIM26A0A096LP01 95 aa9.52□□□□□ -0.89
GPC1-208ENST00000469694 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
GPC1-208ENST00000469694 CELA1Q9UNI1 258 aa9.52□□□□□ -0.89
GPC1-208ENST00000469694 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa9.51□□□□□ -0.89
GPC1-208ENST00000469694 TENM3Q9P273 2699 aa9.51□□□□□ -0.89
GPC1-208ENST00000469694 C1orf43Q9BWL3 253 aa9.5□□□□□ -0.89
GPC1-208ENST00000469694 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GPC1-208ENST00000469694 RETNQ9HD89 108 aa9.5□□□□□ -0.89
GPC1-208ENST00000469694 TRAV10A0A0B4J240 114 aa9.49□□□□□ -0.89
GPC1-208ENST00000469694 C6orf226Q5I0X4 101 aa9.49□□□□□ -0.89
GPC1-208ENST00000469694 LINC00612Q8N6U2 182 aa9.49□□□□□ -0.89
GPC1-208ENST00000469694 RMI2Q96E14 147 aa9.49□□□□□ -0.89
GPC1-208ENST00000469694 SNURFQ9Y675 71 aa9.49□□□□□ -0.89
GPC1-208ENST00000469694 GYPEP15421 78 aa9.49□□□□□ -0.89
GPC1-208ENST00000469694 PRR3P79522 188 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GPC1-208ENST00000469694 Q6ZQT0 140 aa9.49□□□□□ -0.89
GPC1-208ENST00000469694 Q8NAQ8 132 aa9.49□□□□□ -0.89
GPC1-208ENST00000469694 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
GPC1-208ENST00000469694 F8WEM9 126 aa9.47□□□□□ -0.89
GPC1-208ENST00000469694 MGAM2Q2M2H8 2515 aa9.47□□□□□ -0.89
GPC1-208ENST00000469694 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
GPC1-208ENST00000469694 HTN3P15516 51 aa9.47□□□□□ -0.89
GPC1-208ENST00000469694 RBM3P98179 157 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
GPC1-208ENST00000469694 CLPSL2Q6UWE3 100 aa9.47□□□□□ -0.89
GPC1-208ENST00000469694 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa9.45□□□□□ -0.9
GPC1-208ENST00000469694 DAD1P61803 113 aa9.45□□□□□ -0.9
GPC1-208ENST00000469694 HAMPP81172 84 aa9.45□□□□□ -0.9
GPC1-208ENST00000469694 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa9.45□□□□□ -0.9
GPC1-208ENST00000469694 M0R2N4 97 aa9.45□□□□□ -0.9
GPC1-208ENST00000469694 Q6ZVQ6 151 aa9.45□□□□□ -0.9
GPC1-208ENST00000469694 PRO0255Q9UI72 69 aa9.44□□□□□ -0.9
GPC1-208ENST00000469694 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa9.44□□□□□ -0.9
GPC1-208ENST00000469694 LYRM9A8MSI8 78 aa9.44□□□□□ -0.9
GPC1-208ENST00000469694 PKIGQ9Y2B9 76 aa9.44□□□□□ -0.9
GPC1-208ENST00000469694 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa9.43□□□□□ -0.9
GPC1-208ENST00000469694 LINC00474Q9P2X8 69 aa9.43□□□□□ -0.9
GPC1-208ENST00000469694 NDUFC1O43677 76 aa9.43□□□□□ -0.9
GPC1-208ENST00000469694 MIFP14174 115 aa9.43□□□□□ -0.9
GPC1-208ENST00000469694 C6orf99Q4VX62 202 aa9.42□□□□□ -0.9
GPC1-208ENST00000469694 LINC00575Q6W349 94 aa9.42□□□□□ -0.9
GPC1-208ENST00000469694 Q8IZM0 81 aa9.42□□□□□ -0.9
GPC1-208ENST00000469694 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa9.42□□□□□ -0.9
GPC1-208ENST00000469694 CXCL6P80162 114 aa9.42□□□□□ -0.9
GPC1-208ENST00000469694 C6orf223Q8N319 242 aa9.42□□□□□ -0.9
GPC1-208ENST00000469694 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa9.42□□□□□ -0.9
GPC1-208ENST00000469694 F8WDY8 70 aa9.41□□□□□ -0.9
GPC1-208ENST00000469694 Q8N3U1 123 aa9.41□□□□□ -0.9
GPC1-208ENST00000469694 SPART-AS1P0CW21 52 aa9.4□□□□□ -0.9
GPC1-208ENST00000469694 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa9.4□□□□□ -0.9
GPC1-208ENST00000469694 TM2D3Q9BRN9 247 aa9.4□□□□□ -0.91
GPC1-208ENST00000469694 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa9.39□□□□□ -0.91
GPC1-208ENST00000469694 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
GPC1-208ENST00000469694 PDE6GP18545 87 aa9.37□□□□□ -0.91
GPC1-208ENST00000469694 COX17Q14061 63 aa9.37□□□□□ -0.91
GPC1-208ENST00000469694 BRK1Q8WUW1 75 aa9.36□□□□□ -0.91
GPC1-208ENST00000469694 DNAH3Q8TD57 4116 aa9.36□□□□□ -0.91
GPC1-208ENST00000469694 Q8NDZ9 215 aa9.36□□□□□ -0.91
GPC1-208ENST00000469694 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa9.35□□□□□ -0.91
GPC1-208ENST00000469694 KIAA0087Q14695 138 aa9.34□□□□□ -0.91
GPC1-208ENST00000469694 Q6ZTC4 211 aa9.34□□□□□ -0.92
GPC1-208ENST00000469694 NREPQ16612 68 aa9.33□□□□□ -0.92
GPC1-208ENST00000469694 MUC7Q8TAX7 377 aa9.33□□□□□ -0.92
GPC1-208ENST00000469694 TMEM254Q8TBM7 123 aa9.33□□□□□ -0.92
GPC1-208ENST00000469694 MDFIQ99750 246 aa9.33□□□□□ -0.92
GPC1-208ENST00000469694 A0A0J9YWU9 116 aa9.32□□□□□ -0.92
GPC1-208ENST00000469694 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
GPC1-208ENST00000469694 Q6ZQY7 126 aa9.32□□□□□ -0.92
GPC1-208ENST00000469694 SCXQ7RTU7 201 aa9.32□□□□□ -0.92
GPC1-208ENST00000469694 A0A1B0GUV1 79 aa9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms