RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469034.1

SUMO1-210, Transcript of small ubiquitin-like modifier 1, human

TSL 3

Gene SUMO1, Length 511 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUMO1-210	ENST00000469034	LINC01006	Q8NI28	216 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	LRBA	P50851	2863 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	ATM	Q13315	3056 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	ZNF292	O60281	2723 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034		A0A0J9YWU9	116 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	MUC7	Q8TAX7	377 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	PRO0255	Q9UI72	69 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	AKAP6	Q13023	2319 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034		H7BZZ5	65 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	PRB1	P04280	392 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	REG3A	Q06141	175 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	C4orf26	Q17RF5	130 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034		Q6ZVQ6	151 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	UBL5	Q9BZL1	73 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	ZFHX3	Q15911	3703 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034		A0A096LPF7	62 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	LYRM9	A8MSI8	78 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034		H3BQ85	93 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	FAM236C	P0DP71	79 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	KRTAP10-8	P60410	259 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	CXCL6	P80162	114 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	SPAG11B	Q08648	103 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	C20orf197	Q8N268	126 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	ZNF843	Q8N446	348 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	TACC2	O95359	2948 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	PDE6G	P18545	87 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	KLKP1	Q107X0	134 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	PRR34	Q9NV39	138 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	VPREB1	P12018	145 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	COX7B	P24311	80 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	LELP1	Q5T871	98 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034		Q6ZQY7	126 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	RMI2	Q96E14	147 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	CELA1	Q9UNI1	258 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SUMO1-210	ENST00000469034	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SUMO1-210	ENST00000469034	ATRX	P46100	2492 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SUMO1-210	ENST00000469034	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SUMO1-210	ENST00000469034	HAMP	P81172	84 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SUMO1-210	ENST00000469034	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SUMO1-210	ENST00000469034	DIRC1	Q969H9	104 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SUMO1-210	ENST00000469034	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SUMO1-210	ENST00000469034	TTC28	Q96AY4	2481 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SUMO1-210	ENST00000469034	DEFB4A	O15263	64 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SUMO1-210	ENST00000469034	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SUMO1-210	ENST00000469034	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SUMO1-210	ENST00000469034		Q8NAQ8	132 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SUMO1-210	ENST00000469034	RELN	P78509	3460 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SUMO1-210	ENST00000469034	NBAS	A2RRP1	2371 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SUMO1-210	ENST00000469034		F8WEM9	126 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SUMO1-210	ENST00000469034		M0R378	163 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SUMO1-210	ENST00000469034	ERC2-IT1	O76042	136 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SUMO1-210	ENST00000469034	IGKV4-1	P06312	121 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SUMO1-210	ENST00000469034	DAD1	P61803	113 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SUMO1-210	ENST00000469034	NREP	Q16612	68 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SUMO1-210	ENST00000469034	SCX	Q7RTU7	201 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SUMO1-210	ENST00000469034	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SUMO1-210	ENST00000469034	KLK12	Q9UKR0	248 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SUMO1-210	ENST00000469034	SNURF	Q9Y675	71 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SUMO1-210	ENST00000469034	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SUMO1-210	ENST00000469034		A0A0U1RQV1	116 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SUMO1-210	ENST00000469034	NDUFC1	O43677	76 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SUMO1-210	ENST00000469034	MIF	P14174	115 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SUMO1-210	ENST00000469034	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SUMO1-210	ENST00000469034	DEFB135	Q30KP9	77 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SUMO1-210	ENST00000469034	OCR1	Q9BZK8	76 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SUMO1-210	ENST00000469034	LAMA5	O15230	3695 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SUMO1-210	ENST00000469034	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SUMO1-210	ENST00000469034	BPY2	O14599	106 aa		3.04	□□□□□ -1.92

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms