RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 VPREB1P12018 145 aa5□□□□□ -1.61
SH3BP1-204ENST00000459646 IFITM2Q01629 132 aa5□□□□□ -1.61
SH3BP1-204ENST00000459646 COX17Q14061 63 aa5□□□□□ -1.61
SH3BP1-204ENST00000459646 RHEBQ15382 184 aa5□□□□□ -1.61
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM229BQ4G0N7 80 aa5□□□□□ -1.61
SH3BP1-204ENST00000459646 C18orf32Q8TCD1 76 aa5□□□□□ -1.61
SH3BP1-204ENST00000459646 CDIP1Q9H305 208 aa5□□□□□ -1.61
SH3BP1-204ENST00000459646 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SH3BP1-204ENST00000459646 A0A096LNJ9 63 aa4.99□□□□□ -1.61
SH3BP1-204ENST00000459646 C11orf86A6NJI1 115 aa4.99□□□□□ -1.61
SH3BP1-204ENST00000459646 C4orf48Q5BLP8 95 aa4.99□□□□□ -1.61
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa4.99□□□□□ -1.61
SH3BP1-204ENST00000459646 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa4.99□□□□□ -1.61
SH3BP1-204ENST00000459646 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa4.98□□□□□ -1.61
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SH3BP1-204ENST00000459646 MEIG1Q5JSS6 88 aa4.98□□□□□ -1.61
SH3BP1-204ENST00000459646 C3orf22Q8N5N4 141 aa4.98□□□□□ -1.61
SH3BP1-204ENST00000459646 SFTA2Q6UW10 78 aa4.97□□□□□ -1.61
SH3BP1-204ENST00000459646 PLEKHB2Q96CS7 222 aa4.97□□□□□ -1.61
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SH3BP1-204ENST00000459646 C10orf91Q5T1B1 145 aa4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1-204ENST00000459646 BOD1L2Q8IYS8 172 aa4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1-204ENST00000459646 Q8NDZ9 215 aa4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1-204ENST00000459646 PPDPFQ9H3Y8 114 aa4.96□□□□□ -1.62
SH3BP1-204ENST00000459646 NCR3O14931 201 aa4.95□□□□□ -1.62
SH3BP1-204ENST00000459646 NDUFA5Q16718 116 aa4.95□□□□□ -1.62
SH3BP1-204ENST00000459646 IFI27L1Q96BM0 104 aa4.95□□□□□ -1.62
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
SH3BP1-204ENST00000459646 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa4.94□□□□□ -1.62
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM223A0PJW6 202 aa4.94□□□□□ -1.62
SH3BP1-204ENST00000459646 SNAPINO95295 136 aa4.94□□□□□ -1.62
SH3BP1-204ENST00000459646 S100A12P80511 92 aa4.94□□□□□ -1.62
SH3BP1-204ENST00000459646 LINC00337Q8N6G1 96 aa4.94□□□□□ -1.62
SH3BP1-204ENST00000459646 DAND5Q8N907 189 aa4.94□□□□□ -1.62
SH3BP1-204ENST00000459646 SMCR5Q8TEV8 140 aa4.94□□□□□ -1.62
SH3BP1-204ENST00000459646 SPRR4Q96PI1 79 aa4.94□□□□□ -1.62
SH3BP1-204ENST00000459646 SPAG11AQ6PDA7 123 aa4.93□□□□□ -1.62
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM19A2Q8N3H0 131 aa4.93□□□□□ -1.62
SH3BP1-204ENST00000459646 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa4.93□□□□□ -1.62
SH3BP1-204ENST00000459646 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1-204ENST00000459646 PRYO14603 147 aa4.92□□□□□ -1.62
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SH3BP1-204ENST00000459646 GAGE2AQ6NT46 116 aa4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1-204ENST00000459646 SVBPQ8N300 66 aa4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1-204ENST00000459646 Q8NBF4 154 aa4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1-204ENST00000459646 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1-204ENST00000459646 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1-204ENST00000459646 NDUFA12Q9UI09 145 aa4.92□□□□□ -1.62
SH3BP1-204ENST00000459646 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1-204ENST00000459646 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1-204ENST00000459646 LINC00587B1AMM8 73 aa4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1-204ENST00000459646 HERV-K104P63124 156 aa4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1-204ENST00000459646 TPRXLQ17RH7 258 aa4.91□□□□□ -1.62
SH3BP1-204ENST00000459646 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa4.9□□□□□ -1.63
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SH3BP1-204ENST00000459646 MIEN1Q9BRT3 115 aa4.89□□□□□ -1.63
SH3BP1-204ENST00000459646 KCNQ1DNQ9H478 68 aa4.89□□□□□ -1.63
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SH3BP1-204ENST00000459646 FABP4P15090 132 aa4.88□□□□□ -1.63
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SH3BP1-204ENST00000459646 NPC2P61916 151 aa4.88□□□□□ -1.63
SH3BP1-204ENST00000459646 S100A7L2Q5SY68 101 aa4.88□□□□□ -1.63
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SH3BP1-204ENST00000459646 HERVK_113P61574 105 aa4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1-204ENST00000459646 MOBPQ13875 183 aa4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1-204ENST00000459646 PMCHL2Q9BQD1 86 aa4.87□□□□□ -1.63
SH3BP1-204ENST00000459646 B5MCH6 92 aa4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1-204ENST00000459646 SPINK1P00995 79 aa4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1-204ENST00000459646 TRGC2P03986 189 aa4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1-204ENST00000459646 SPRR1AP35321 89 aa4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1-204ENST00000459646 C9orf153Q5TBE3 101 aa4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1-204ENST00000459646 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
SH3BP1-204ENST00000459646 J3QQQ9 107 aa4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1-204ENST00000459646 SERF1AO75920 110 aa4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1-204ENST00000459646 ERC2-IT1O76042 136 aa4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1-204ENST00000459646 DPM2O94777 84 aa4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1-204ENST00000459646 TSPEAR-AS2P59090 65 aa4.85□□□□□ -1.63
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
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SH3BP1-204ENST00000459646 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1-204ENST00000459646 YPEL4Q96NS1 127 aa4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1-204ENST00000459646 HSPB8Q9UJY1 196 aa4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1-204ENST00000459646 FSIP2Q5CZC0 6907 aa4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1-204ENST00000459646 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1-204ENST00000459646 IGKCP01834 107 aa4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1-204ENST00000459646 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1-204ENST00000459646 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1-204ENST00000459646 LINC00483Q53H64 154 aa4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1-204ENST00000459646 OR13C6PQ8NH95 151 aa4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1-204ENST00000459646 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1-204ENST00000459646 MUC17Q685J3 4493 aa4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1-204ENST00000459646 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC25A20O43772 301 aa4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1-204ENST00000459646 NMUP48645 174 aa4.82□□□□□ -1.64
SH3BP1-204ENST00000459646 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
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