RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447032.1

RBM17-206, Transcript of RNA binding motif protein 17, human

TSL 2

Gene RBM17, Length 676 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM17-206	ENST00000447032	CEND1	Q8N111	149 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM17-206	ENST00000447032	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM17-206	ENST00000447032	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM17-206	ENST00000447032	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM17-206	ENST00000447032	PKD1	P98161	4303 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-206	ENST00000447032	IFITM1	P13164	125 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-206	ENST00000447032	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-206	ENST00000447032	PTTG1IP	P53801	180 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-206	ENST00000447032	FXYD2	P54710	66 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-206	ENST00000447032	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-206	ENST00000447032	LINC01620	Q4KN68	170 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-206	ENST00000447032	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-206	ENST00000447032	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-206	ENST00000447032	PKHD1	P08F94	4074 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-206	ENST00000447032	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032		M0R143	59 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032		A0A096LNI7	61 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032		A4D1N5	150 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032	BATF	Q16520	125 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032		Q8NDZ9	215 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032	C16orf90	A8MZG2	172 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032		K7ERJ3	54 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032	CHTF8	P0CG12	524 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032		A0A1B0GVY2	172 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032		A0A1B0GWB2	263 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032	FAM168B	A1KXE4	195 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032	PANO1	I0J062	215 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032	NDUFC2	O95298	119 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032	IGKV2D-28	P01615	120 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032	CFC1	P0CG37	223 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032	VPREB1	P12018	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032		A0A0B4J2C4	111 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032		A6NDN8	102 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032	NCR3	O14931	201 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM17-206	ENST00000447032	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-206	ENST00000447032	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-206	ENST00000447032	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-206	ENST00000447032	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM17-206	ENST00000447032	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-206	ENST00000447032		A0A1W2PNN7	141 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-206	ENST00000447032	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-206	ENST00000447032	KRTAP10-1	P60331	282 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-206	ENST00000447032	RAB37	Q96AX2	223 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM17-206	ENST00000447032	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-206	ENST00000447032	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-206	ENST00000447032	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-206	ENST00000447032	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-206	ENST00000447032	C7orf33	Q8WU49	177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-206	ENST00000447032	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-206	ENST00000447032	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM17-206	ENST00000447032	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-206	ENST00000447032	GAGE10	A6NGK3	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-206	ENST00000447032		H7C2G1	150 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-206	ENST00000447032		M0QXV9	152 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-206	ENST00000447032		M0R378	163 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-206	ENST00000447032	TSPAN13	O95857	204 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-206	ENST00000447032	IGLV6-57	P01721	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-206	ENST00000447032		Q6ZSA8	131 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-206	ENST00000447032	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-206	ENST00000447032	C22orf24	Q9Y442	160 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-206	ENST00000447032	HERC1	Q15751	4861 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-206	ENST00000447032	HSPG2	P98160	4391 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-206	ENST00000447032	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM17-206	ENST00000447032		A0A087WYN8	130 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-206	ENST00000447032	EPM2A	B3EWF7	344 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-206	ENST00000447032	TAX1BP3	O14907	124 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-206	ENST00000447032	CDK2AP2	O75956	126 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-206	ENST00000447032	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-206	ENST00000447032	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-206	ENST00000447032	TMEM126A	Q9H061	195 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-206	ENST00000447032	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM17-206	ENST00000447032		Q1RN00	199 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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