RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441998.5

NELFE-205, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene NELFE, Length 1,075 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-205ENST00000441998 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.72□□□□□ -1.33
NELFE-205ENST00000441998 BCE1O60756 84 aa6.71□□□□□ -1.34
NELFE-205ENST00000441998 FABP4P15090 132 aa6.71□□□□□ -1.34
NELFE-205ENST00000441998 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
NELFE-205ENST00000441998 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
NELFE-205ENST00000441998 C5orf52A6NGY3 159 aa6.7□□□□□ -1.34
NELFE-205ENST00000441998 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
NELFE-205ENST00000441998 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.7□□□□□ -1.34
NELFE-205ENST00000441998 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NELFE-205ENST00000441998 LINC00167Q96N53 147 aa6.69□□□□□ -1.34
NELFE-205ENST00000441998 H0Y8G0 127 aa6.68□□□□□ -1.34
NELFE-205ENST00000441998 S100A2P29034 98 aa6.68□□□□□ -1.34
NELFE-205ENST00000441998 AKR1D1P51857 326 aa6.68□□□□□ -1.34
NELFE-205ENST00000441998 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
NELFE-205ENST00000441998 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.68□□□□□ -1.34
NELFE-205ENST00000441998 PLNP26678 52 aa6.67□□□□□ -1.34
NELFE-205ENST00000441998 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.67□□□□□ -1.34
NELFE-205ENST00000441998 ERG28Q9UKR5 140 aa6.67□□□□□ -1.34
NELFE-205ENST00000441998 DPM2O94777 84 aa6.66□□□□□ -1.34
NELFE-205ENST00000441998 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.66□□□□□ -1.34
NELFE-205ENST00000441998 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.65□□□□□ -1.34
NELFE-205ENST00000441998 IGKCP01834 107 aa6.65□□□□□ -1.34
NELFE-205ENST00000441998 PFN2P35080 140 aa6.65□□□□□ -1.34
NELFE-205ENST00000441998 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.65□□□□□ -1.34
NELFE-205ENST00000441998 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.64□□□□□ -1.35
NELFE-205ENST00000441998 LINC00587B1AMM8 73 aa6.64□□□□□ -1.35
NELFE-205ENST00000441998 CRYGAP11844 174 aa6.64□□□□□ -1.35
NELFE-205ENST00000441998 CTAG1AP78358 180 aa6.64□□□□□ -1.35
NELFE-205ENST00000441998 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.64□□□□□ -1.35
NELFE-205ENST00000441998 LEPROTO15243 131 aa6.63□□□□□ -1.35
NELFE-205ENST00000441998 VPREB1P12018 145 aa6.63□□□□□ -1.35
NELFE-205ENST00000441998 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.63□□□□□ -1.35
NELFE-205ENST00000441998 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.63□□□□□ -1.35
NELFE-205ENST00000441998 LINC01545Q5VT33 79 aa6.63□□□□□ -1.35
NELFE-205ENST00000441998 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.63□□□□□ -1.35
NELFE-205ENST00000441998 RNF213Q63HN8 5207 aa6.63□□□□□ -1.35
NELFE-205ENST00000441998 GAGE10A6NGK3 116 aa6.62□□□□□ -1.35
NELFE-205ENST00000441998 C3orf79P0CE67 100 aa6.62□□□□□ -1.35
NELFE-205ENST00000441998 SMIM6P0DI80 62 aa6.62□□□□□ -1.35
NELFE-205ENST00000441998 UBE2AP49459 152 aa6.62□□□□□ -1.35
NELFE-205ENST00000441998 HERV-K104P63124 156 aa6.62□□□□□ -1.35
NELFE-205ENST00000441998 PET117Q6UWS5 81 aa6.62□□□□□ -1.35
NELFE-205ENST00000441998 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.62□□□□□ -1.35
NELFE-205ENST00000441998 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.62□□□□□ -1.35
NELFE-205ENST00000441998 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.6□□□□□ -1.35
NELFE-205ENST00000441998 E9PLD3 99 aa6.6□□□□□ -1.35
NELFE-205ENST00000441998 J3QQQ9 107 aa6.6□□□□□ -1.35
NELFE-205ENST00000441998 LINC00158P58513 81 aa6.6□□□□□ -1.35
NELFE-205ENST00000441998 HERVK_113P61574 105 aa6.6□□□□□ -1.35
NELFE-205ENST00000441998 Q8NDZ9 215 aa6.6□□□□□ -1.35
NELFE-205ENST00000441998 TMEM126AQ9H061 195 aa6.6□□□□□ -1.35
NELFE-205ENST00000441998 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.59□□□□□ -1.35
NELFE-205ENST00000441998 IGKV2D-28P01615 120 aa6.59□□□□□ -1.35
NELFE-205ENST00000441998 SMIM13P0DJ93 91 aa6.59□□□□□ -1.35
NELFE-205ENST00000441998 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.59□□□□□ -1.35
NELFE-205ENST00000441998 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.59□□□□□ -1.35
NELFE-205ENST00000441998 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.58□□□□□ -1.36
NELFE-205ENST00000441998 M0R378 163 aa6.58□□□□□ -1.36
NELFE-205ENST00000441998 NMUP48645 174 aa6.58□□□□□ -1.36
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NELFE-205ENST00000441998 A0A087X002 238 aa6.57□□□□□ -1.36
NELFE-205ENST00000441998 A0A0U1RRA0 63 aa6.57□□□□□ -1.36
NELFE-205ENST00000441998 KRTDAPP60985 99 aa6.57□□□□□ -1.36
NELFE-205ENST00000441998 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.57□□□□□ -1.36
NELFE-205ENST00000441998 C12orf57Q99622 126 aa6.57□□□□□ -1.36
NELFE-205ENST00000441998 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.56□□□□□ -1.36
NELFE-205ENST00000441998 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
NELFE-205ENST00000441998 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.56□□□□□ -1.36
NELFE-205ENST00000441998 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.56□□□□□ -1.36
NELFE-205ENST00000441998 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.56□□□□□ -1.36
NELFE-205ENST00000441998 A0A0J9YXY3 114 aa6.54□□□□□ -1.36
NELFE-205ENST00000441998 TMEM238C9JI98 176 aa6.54□□□□□ -1.36
NELFE-205ENST00000441998 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.54□□□□□ -1.36
NELFE-205ENST00000441998 PRYO14603 147 aa6.53□□□□□ -1.36
NELFE-205ENST00000441998 SPRR1AP35321 89 aa6.53□□□□□ -1.36
NELFE-205ENST00000441998 S100A12P80511 92 aa6.53□□□□□ -1.36
NELFE-205ENST00000441998 PRLHP81277 87 aa6.53□□□□□ -1.36
NELFE-205ENST00000441998 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
NELFE-205ENST00000441998 PRR4Q16378 134 aa6.53□□□□□ -1.36
NELFE-205ENST00000441998 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.53□□□□□ -1.36
NELFE-205ENST00000441998 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.53□□□□□ -1.36
NELFE-205ENST00000441998 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.53□□□□□ -1.36
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NELFE-205ENST00000441998 DAND5Q8N907 189 aa6.52□□□□□ -1.37
NELFE-205ENST00000441998 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
NELFE-205ENST00000441998 LPAP08519 4548 aa6.52□□□□□ -1.37
NELFE-205ENST00000441998 SCGB1D1O95968 90 aa6.51□□□□□ -1.37
NELFE-205ENST00000441998 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.51□□□□□ -1.37
NELFE-205ENST00000441998 PYY3Q5JQD4 70 aa6.51□□□□□ -1.37
NELFE-205ENST00000441998 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.51□□□□□ -1.37
NELFE-205ENST00000441998 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.51□□□□□ -1.37
NELFE-205ENST00000441998 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.51□□□□□ -1.37
NELFE-205ENST00000441998 LITAFQ99732 161 aa6.51□□□□□ -1.37
NELFE-205ENST00000441998 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.51□□□□□ -1.37
NELFE-205ENST00000441998 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NELFE-205ENST00000441998 TIMM17BO60830 172 aa6.5□□□□□ -1.37
NELFE-205ENST00000441998 TSPAN13O95857 204 aa6.5□□□□□ -1.37
NELFE-205ENST00000441998 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.5□□□□□ -1.37
NELFE-205ENST00000441998 ATOH7Q8N100 152 aa6.5□□□□□ -1.37
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