RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428892.1

APOBEC3C-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

TSL 3

Gene APOBEC3C, Length 1,056 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-202ENST00000428892 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.92□□□□□ -1.3
APOBEC3C-202ENST00000428892 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.92□□□□□ -1.3
APOBEC3C-202ENST00000428892 Q6ZRU5 148 aa6.92□□□□□ -1.3
APOBEC3C-202ENST00000428892 HIST1H4GQ99525 98 aa6.92□□□□□ -1.3
APOBEC3C-202ENST00000428892 A6NDN8 102 aa6.91□□□□□ -1.3
APOBEC3C-202ENST00000428892 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.91□□□□□ -1.3
APOBEC3C-202ENST00000428892 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.91□□□□□ -1.3
APOBEC3C-202ENST00000428892 DPH3Q96FX2 82 aa6.91□□□□□ -1.3
APOBEC3C-202ENST00000428892 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.91□□□□□ -1.3
APOBEC3C-202ENST00000428892 PANO1I0J062 215 aa6.9□□□□□ -1.3
APOBEC3C-202ENST00000428892 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
APOBEC3C-202ENST00000428892 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.9□□□□□ -1.3
APOBEC3C-202ENST00000428892 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.9□□□□□ -1.3
APOBEC3C-202ENST00000428892 CEND1Q8N111 149 aa6.89□□□□□ -1.31
APOBEC3C-202ENST00000428892 RNF213Q63HN8 5207 aa6.88□□□□□ -1.31
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.88□□□□□ -1.31
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.88□□□□□ -1.31
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM238C9JI98 176 aa6.88□□□□□ -1.31
APOBEC3C-202ENST00000428892 COX7A2LO14548 114 aa6.88□□□□□ -1.31
APOBEC3C-202ENST00000428892 MT1HL1P0DM35 61 aa6.88□□□□□ -1.31
APOBEC3C-202ENST00000428892 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.88□□□□□ -1.31
APOBEC3C-202ENST00000428892 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.88□□□□□ -1.31
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A087WZ39 114 aa6.87□□□□□ -1.31
APOBEC3C-202ENST00000428892 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.87□□□□□ -1.31
APOBEC3C-202ENST00000428892 NDUFA1O15239 70 aa6.87□□□□□ -1.31
APOBEC3C-202ENST00000428892 HERV-K104P63124 156 aa6.87□□□□□ -1.31
APOBEC3C-202ENST00000428892 SFTA2Q6UW10 78 aa6.87□□□□□ -1.31
APOBEC3C-202ENST00000428892 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A0J9YXY3 114 aa6.86□□□□□ -1.31
APOBEC3C-202ENST00000428892 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.86□□□□□ -1.31
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRSS2P07478 247 aa6.86□□□□□ -1.31
APOBEC3C-202ENST00000428892 SMIM13P0DJ93 91 aa6.86□□□□□ -1.31
APOBEC3C-202ENST00000428892 Q6ZVH6 145 aa6.86□□□□□ -1.31
APOBEC3C-202ENST00000428892 C5orf38Q86SI9 138 aa6.86□□□□□ -1.31
APOBEC3C-202ENST00000428892 COX7B2Q8TF08 81 aa6.86□□□□□ -1.31
APOBEC3C-202ENST00000428892 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.86□□□□□ -1.31
APOBEC3C-202ENST00000428892 TNXBP22105 4242 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3C-202ENST00000428892 TIMM17BO60830 172 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3C-202ENST00000428892 APOMO95445 188 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3C-202ENST00000428892 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3C-202ENST00000428892 C7orf33Q8WU49 177 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3C-202ENST00000428892 COPS9Q8WXC6 57 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3C-202ENST00000428892 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3C-202ENST00000428892 LRP2P98164 4655 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3C-202ENST00000428892 CHTF8P0CG12 524 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3C-202ENST00000428892 PCP4P48539 62 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3C-202ENST00000428892 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3C-202ENST00000428892 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3C-202ENST00000428892 C2orf48Q96LS8 159 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3C-202ENST00000428892 CARD19Q96LW7 228 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A1B0GV90 55 aa6.83□□□□□ -1.32
APOBEC3C-202ENST00000428892 SYCNQ0VAF6 134 aa6.83□□□□□ -1.32
APOBEC3C-202ENST00000428892 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.83□□□□□ -1.32
APOBEC3C-202ENST00000428892 IFITM1P13164 125 aa6.82□□□□□ -1.32
APOBEC3C-202ENST00000428892 FXYD2P54710 66 aa6.82□□□□□ -1.32
APOBEC3C-202ENST00000428892 SPAG11BQ08648 103 aa6.82□□□□□ -1.32
APOBEC3C-202ENST00000428892 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
APOBEC3C-202ENST00000428892 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.82□□□□□ -1.32
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A087WYN8 130 aa6.81□□□□□ -1.32
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A096LNI7 61 aa6.81□□□□□ -1.32
APOBEC3C-202ENST00000428892 CXCL5P42830 114 aa6.81□□□□□ -1.32
APOBEC3C-202ENST00000428892 CKS1BP61024 79 aa6.81□□□□□ -1.32
APOBEC3C-202ENST00000428892 KIAA0087Q14695 138 aa6.81□□□□□ -1.32
APOBEC3C-202ENST00000428892 Q8IZM0 81 aa6.81□□□□□ -1.32
APOBEC3C-202ENST00000428892 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.81□□□□□ -1.32
APOBEC3C-202ENST00000428892 SPANXCQ9NY87 97 aa6.81□□□□□ -1.32
APOBEC3C-202ENST00000428892 GAGE10A6NGK3 116 aa6.8□□□□□ -1.32
APOBEC3C-202ENST00000428892 F8WDY8 70 aa6.8□□□□□ -1.32
APOBEC3C-202ENST00000428892 TAX1BP3O14907 124 aa6.8□□□□□ -1.32
APOBEC3C-202ENST00000428892 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.8□□□□□ -1.32
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
APOBEC3C-202ENST00000428892 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.8□□□□□ -1.32
APOBEC3C-202ENST00000428892 RAB37Q96AX2 223 aa6.79□□□□□ -1.32
APOBEC3C-202ENST00000428892 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.79□□□□□ -1.32
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.78□□□□□ -1.32
APOBEC3C-202ENST00000428892 LINC00158P58513 81 aa6.78□□□□□ -1.32
APOBEC3C-202ENST00000428892 VAMP3Q15836 100 aa6.78□□□□□ -1.32
APOBEC3C-202ENST00000428892 C10orf25Q5T742 122 aa6.78□□□□□ -1.32
APOBEC3C-202ENST00000428892 REG3GQ6UW15 175 aa6.78□□□□□ -1.32
APOBEC3C-202ENST00000428892 LINC01600Q96MT4 127 aa6.78□□□□□ -1.32
APOBEC3C-202ENST00000428892 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.77□□□□□ -1.33
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A1B0GWB2 263 aa6.77□□□□□ -1.33
APOBEC3C-202ENST00000428892 A4D1N5 150 aa6.77□□□□□ -1.33
APOBEC3C-202ENST00000428892 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.77□□□□□ -1.33
APOBEC3C-202ENST00000428892 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.77□□□□□ -1.33
APOBEC3C-202ENST00000428892 LITAFQ99732 161 aa6.77□□□□□ -1.33
APOBEC3C-202ENST00000428892 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.77□□□□□ -1.33
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A0U1RRA0 63 aa6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3C-202ENST00000428892 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A0B4J2C4 111 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3C-202ENST00000428892 H3BUT2 72 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3C-202ENST00000428892 K7ERJ3 54 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3C-202ENST00000428892 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3C-202ENST00000428892 FABP2P12104 132 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3C-202ENST00000428892 COX17Q14061 63 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3C-202ENST00000428892 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3C-202ENST00000428892 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.75□□□□□ -1.33
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