RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428482.5

HDLBP-216, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-216ENST00000428482 Q6ZVH6 145 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 A0A0J9YXY3 114 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF815PA8K554 130 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 MALP21145 153 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 C2orf48Q96LS8 159 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 PRSS2P07478 247 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 COX17Q14061 63 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 C10orf25Q5T742 122 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 SYCNQ0VAF6 134 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 RNF151Q2KHN1 245 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.41□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 CKS1BP61024 79 aa6.41□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.41□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 LITAFQ99732 161 aa6.41□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 LRP2P98164 4655 aa6.41□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.4□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 A0A1B0GV90 55 aa6.4□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 IFITM1P13164 125 aa6.4□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 GAGE2BQ13066 116 aa6.4□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.4□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.4□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.4□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 SPANXCQ9NY87 97 aa6.4□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.4□□□□□ -1.38
HDLBP-216ENST00000428482 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-216ENST00000428482 A0A1W2PNN7 141 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-216ENST00000428482 FAM168BA1KXE4 195 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-216ENST00000428482 TMEM238C9JI98 176 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-216ENST00000428482 HSD52Q0P140 79 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-216ENST00000428482 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-216ENST00000428482 M0R143 59 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-216ENST00000428482 C2orf82Q6UX34 121 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-216ENST00000428482 COPS9Q8WXC6 57 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-216ENST00000428482 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
HDLBP-216ENST00000428482 J3QL48 77 aa6.37□□□□□ -1.39
HDLBP-216ENST00000428482 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.37□□□□□ -1.393e-10■■■■■ 32.5
HDLBP-216ENST00000428482 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
HDLBP-216ENST00000428482 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.37□□□□□ -1.39
HDLBP-216ENST00000428482 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.37□□□□□ -1.39
HDLBP-216ENST00000428482 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.37□□□□□ -1.39
HDLBP-216ENST00000428482 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.37□□□□□ -1.39
HDLBP-216ENST00000428482 CEND1Q8N111 149 aa6.37□□□□□ -1.39
HDLBP-216ENST00000428482 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-216ENST00000428482 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-216ENST00000428482 MT1HL1P0DM35 61 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-216ENST00000428482 Q6ZRP5 223 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-216ENST00000428482 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-216ENST00000428482 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-216ENST00000428482 HIST1H4GQ99525 98 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-216ENST00000428482 ERG28Q9UKR5 140 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-216ENST00000428482 LPAP08519 4548 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-216ENST00000428482 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-216ENST00000428482 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-216ENST00000428482 DPH3Q96FX2 82 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-216ENST00000428482 A0A1B0GWB2 263 aa6.34□□□□□ -1.39
HDLBP-216ENST00000428482 SMIM13P0DJ93 91 aa6.34□□□□□ -1.39
HDLBP-216ENST00000428482 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
HDLBP-216ENST00000428482 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.34□□□□□ -1.39
HDLBP-216ENST00000428482 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.34□□□□□ -1.39
HDLBP-216ENST00000428482 LINC00158P58513 81 aa6.33□□□□□ -1.4
HDLBP-216ENST00000428482 GAGE2EQ4V326 116 aa6.33□□□□□ -1.4
HDLBP-216ENST00000428482 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.33□□□□□ -1.4
HDLBP-216ENST00000428482 C7orf33Q8WU49 177 aa6.33□□□□□ -1.4
HDLBP-216ENST00000428482 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.33□□□□□ -1.4
HDLBP-216ENST00000428482 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.33□□□□□ -1.4
HDLBP-216ENST00000428482 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.32□□□□□ -1.4
HDLBP-216ENST00000428482 A6NJY4 79 aa6.32□□□□□ -1.4
HDLBP-216ENST00000428482 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.32□□□□□ -1.4
HDLBP-216ENST00000428482 NDUFC2O95298 119 aa6.32□□□□□ -1.4
HDLBP-216ENST00000428482 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
HDLBP-216ENST00000428482 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.32□□□□□ -1.4
HDLBP-216ENST00000428482 A6NDN8 102 aa6.31□□□□□ -1.4
HDLBP-216ENST00000428482 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
HDLBP-216ENST00000428482 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
HDLBP-216ENST00000428482 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.31□□□□□ -1.4
HDLBP-216ENST00000428482 PFN2P35080 140 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-216ENST00000428482 FXYD2P54710 66 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-216ENST00000428482 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-216ENST00000428482 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-216ENST00000428482 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-216ENST00000428482 A0A0B4J2C4 111 aa6.29□□□□□ -1.4
HDLBP-216ENST00000428482 A4D1N5 150 aa6.29□□□□□ -1.4
HDLBP-216ENST00000428482 M0QXV9 152 aa6.29□□□□□ -1.4
HDLBP-216ENST00000428482 CFC1BP0CG36 223 aa6.29□□□□□ -1.4
HDLBP-216ENST00000428482 CFC1P0CG37 223 aa6.29□□□□□ -1.4
HDLBP-216ENST00000428482 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.29□□□□□ -1.4
HDLBP-216ENST00000428482 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
HDLBP-216ENST00000428482 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.29□□□□□ -1.4
HDLBP-216ENST00000428482 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.29□□□□□ -1.4
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