RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 FN1P02751 2386 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
HCLS1-202ENST00000428394 USP17L23D6RBM5 183 aa11.51□□□□□ -0.57
HCLS1-202ENST00000428394 LELP1Q5T871 98 aa11.51□□□□□ -0.57
HCLS1-202ENST00000428394 SPATA3Q8NHX4 192 aa11.51□□□□□ -0.57
HCLS1-202ENST00000428394 UBL5Q9BZL1 73 aa11.51□□□□□ -0.57
HCLS1-202ENST00000428394 NOTCH3Q9UM47 2321 aa11.51□□□□□ -0.57
HCLS1-202ENST00000428394 ANGP03950 147 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
HCLS1-202ENST00000428394 SLPIP03973 132 aa11.5□□□□□ -0.57
HCLS1-202ENST00000428394 MIFP14174 115 aa11.5□□□□□ -0.57
HCLS1-202ENST00000428394 MDFIQ99750 246 aa11.5□□□□□ -0.57
HCLS1-202ENST00000428394 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa11.5□□□□□ -0.57
HCLS1-202ENST00000428394 STAB1Q9NY15 2570 aa11.49□□□□□ -0.57
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HCLS1-202ENST00000428394 C6orf223Q8N319 242 aa11.49□□□□□ -0.57
HCLS1-202ENST00000428394 PRR34Q9NV39 138 aa11.49□□□□□ -0.57
HCLS1-202ENST00000428394 ATRQ13535 2644 aa11.49□□□□□ -0.57
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HCLS1-202ENST00000428394 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa11.48□□□□□ -0.57
HCLS1-202ENST00000428394 IGLV6-57P01721 117 aa11.48□□□□□ -0.57
HCLS1-202ENST00000428394 SPAG11BQ08648 103 aa11.48□□□□□ -0.57
HCLS1-202ENST00000428394 C6orf99Q4VX62 202 aa11.48□□□□□ -0.57
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HCLS1-202ENST00000428394 CLPSL2Q6UWE3 100 aa11.46□□□□□ -0.57
HCLS1-202ENST00000428394 UPK3BQ9BT76 320 aa11.46□□□□□ -0.57
HCLS1-202ENST00000428394 Q6ZQT0 140 aa11.45□□□□□ -0.58
HCLS1-202ENST00000428394 SPART-AS1P0CW21 52 aa11.44□□□□□ -0.58
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP10-3P60369 221 aa11.42□□□□□ -0.58
HCLS1-202ENST00000428394 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
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HCLS1-202ENST00000428394 F8WDY8 70 aa11.41□□□□□ -0.58
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HCLS1-202ENST00000428394 H3BNG1 76 aa11.41□□□□□ -0.58
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HCLS1-202ENST00000428394 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa11.4□□□□□ -0.58
HCLS1-202ENST00000428394 A0A096LPF7 62 aa11.4□□□□□ -0.58
HCLS1-202ENST00000428394 DIRC1Q969H9 104 aa11.4□□□□□ -0.58
HCLS1-202ENST00000428394 CXCL6P80162 114 aa11.39□□□□□ -0.59
HCLS1-202ENST00000428394 DEFB135Q30KP9 77 aa11.39□□□□□ -0.59
HCLS1-202ENST00000428394 C3orf56Q8N813 242 aa11.39□□□□□ -0.59
HCLS1-202ENST00000428394 DSCR8Q96T75 97 aa11.39□□□□□ -0.59
HCLS1-202ENST00000428394 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa11.38□□□□□ -0.59
HCLS1-202ENST00000428394 A0A087WVE0 104 aa11.38□□□□□ -0.59
HCLS1-202ENST00000428394 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa11.38□□□□□ -0.59
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HCLS1-202ENST00000428394 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa11.37□□□□□ -0.59
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HCLS1-202ENST00000428394 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa11.37□□□□□ -0.59
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HCLS1-202ENST00000428394 C10orf25Q5T742 122 aa11.35□□□□□ -0.59
HCLS1-202ENST00000428394 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa11.34□□□□□ -0.59
HCLS1-202ENST00000428394 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa11.34□□□□□ -0.59
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HCLS1-202ENST00000428394 ENHOQ6UWT2 76 aa11.33□□□□□ -0.6
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HCLS1-202ENST00000428394 KLK12Q9UKR0 248 aa11.32□□□□□ -0.6
HCLS1-202ENST00000428394 CELA1Q9UNI1 258 aa11.32□□□□□ -0.6
HCLS1-202ENST00000428394 DPH3Q96FX2 82 aa11.31□□□□□ -0.6
HCLS1-202ENST00000428394 M0R378 163 aa11.3□□□□□ -0.6
HCLS1-202ENST00000428394 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
HCLS1-202ENST00000428394 Q6ZVQ6 151 aa11.3□□□□□ -0.6
HCLS1-202ENST00000428394 Q8N3U1 123 aa11.3□□□□□ -0.6
HCLS1-202ENST00000428394 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa11.29□□□□□ -0.6
HCLS1-202ENST00000428394 WFDC9Q8NEX5 89 aa11.29□□□□□ -0.6
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HCLS1-202ENST00000428394 DEFB4AO15263 64 aa11.26□□□□□ -0.61
HCLS1-202ENST00000428394 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
HCLS1-202ENST00000428394 CYSTM1Q9H1C7 97 aa11.25□□□□□ -0.61
HCLS1-202ENST00000428394 A0A1B0GW54 56 aa11.24□□□□□ -0.61
HCLS1-202ENST00000428394 KLKP1Q107X0 134 aa11.24□□□□□ -0.61
HCLS1-202ENST00000428394 CAMK2N2Q96S95 79 aa11.24□□□□□ -0.61
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HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa11.23□□□□□ -0.61
HCLS1-202ENST00000428394 LINC00528Q8N1L1 170 aa11.23□□□□□ -0.61
HCLS1-202ENST00000428394 HTN3P15516 51 aa11.22□□□□□ -0.61
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HCLS1-202ENST00000428394 C5orf47Q569G3 176 aa11.21□□□□□ -0.61
HCLS1-202ENST00000428394 ERC2-IT1O76042 136 aa11.2□□□□□ -0.62
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HCLS1-202ENST00000428394 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa11.19□□□□□ -0.62
HCLS1-202ENST00000428394 FAM236CP0DP71 79 aa11.19□□□□□ -0.62
HCLS1-202ENST00000428394 C20orf197Q8N268 126 aa11.18□□□□□ -0.62
HCLS1-202ENST00000428394 XAGE1AQ9HD64 81 aa11.18□□□□□ -0.62
HCLS1-202ENST00000428394 EPM2AB3EWF7 344 aa11.16□□□□□ -0.62
HCLS1-202ENST00000428394 LINC01556Q5JQF7 62 aa11.16□□□□□ -0.62
HCLS1-202ENST00000428394 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
HCLS1-202ENST00000428394 C15orf56Q8N910 161 aa11.16□□□□□ -0.62
HCLS1-202ENST00000428394 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa11.16□□□□□ -0.62
HCLS1-202ENST00000428394 SERP1Q9Y6X1 66 aa11.16□□□□□ -0.62
HCLS1-202ENST00000428394 Q6ZRU5 148 aa11.15□□□□□ -0.62
HCLS1-202ENST00000428394 C1orf43Q9BWL3 253 aa11.15□□□□□ -0.62
HCLS1-202ENST00000428394 KCNQ1DNQ9H478 68 aa11.15□□□□□ -0.62
HCLS1-202ENST00000428394 ANK2Q01484 3957 aa11.14□□□□□ -0.63
HCLS1-202ENST00000428394 H7BZZ5 65 aa11.14□□□□□ -0.63
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