RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426939.6

APOL3-208, Transcript of apolipoprotein L3, humanhuman

TSL 4

Gene APOL3, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3-208ENST00000426939 VPREB1P12018 145 aa8.67□□□□□ -1.02
APOL3-208ENST00000426939 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.66□□□□□ -1.02
APOL3-208ENST00000426939 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.66□□□□□ -1.02
APOL3-208ENST00000426939 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.65□□□□□ -1.02
APOL3-208ENST00000426939 PLNP26678 52 aa8.65□□□□□ -1.02
APOL3-208ENST00000426939 NKAPP1Q8N9T2 125 aa8.65□□□□□ -1.02
APOL3-208ENST00000426939 A0A0U1RRA0 63 aa8.64□□□□□ -1.03
APOL3-208ENST00000426939 ZNF861PO60384 105 aa8.64□□□□□ -1.03
APOL3-208ENST00000426939 BCE1O60756 84 aa8.64□□□□□ -1.03
APOL3-208ENST00000426939 DPM2O94777 84 aa8.63□□□□□ -1.03
APOL3-208ENST00000426939 SMIM13P0DJ93 91 aa8.63□□□□□ -1.03
APOL3-208ENST00000426939 LINC00158P58513 81 aa8.63□□□□□ -1.03
APOL3-208ENST00000426939 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.63□□□□□ -1.03
APOL3-208ENST00000426939 LEPROTO15243 131 aa8.62□□□□□ -1.03
APOL3-208ENST00000426939 IGKCP01834 107 aa8.62□□□□□ -1.03
APOL3-208ENST00000426939 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa8.62□□□□□ -1.03
APOL3-208ENST00000426939 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa8.61□□□□□ -1.03
APOL3-208ENST00000426939 IGKV2D-28P01615 120 aa8.61□□□□□ -1.03
APOL3-208ENST00000426939 HERV-K104P63124 156 aa8.61□□□□□ -1.03
APOL3-208ENST00000426939 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.61□□□□□ -1.03
APOL3-208ENST00000426939 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa8.61□□□□□ -1.03
APOL3-208ENST00000426939 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.61□□□□□ -1.03
APOL3-208ENST00000426939 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa8.6□□□□□ -1.03
APOL3-208ENST00000426939 RPL24P83731 157 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
APOL3-208ENST00000426939 PLEKHB2Q96CS7 222 aa8.6□□□□□ -1.03
APOL3-208ENST00000426939 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.59□□□□□ -1.03
APOL3-208ENST00000426939 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa8.59□□□□□ -1.03
APOL3-208ENST00000426939 J3QQQ9 107 aa8.59□□□□□ -1.03
APOL3-208ENST00000426939 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
APOL3-208ENST00000426939 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.59□□□□□ -1.03
APOL3-208ENST00000426939 TMEM238C9JI98 176 aa8.58□□□□□ -1.04
APOL3-208ENST00000426939 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
APOL3-208ENST00000426939 HERVK_113P61574 105 aa8.58□□□□□ -1.04
APOL3-208ENST00000426939 TMEM126AQ9H061 195 aa8.57□□□□□ -1.04
APOL3-208ENST00000426939 M0R378 163 aa8.56□□□□□ -1.04
APOL3-208ENST00000426939 LINC01545Q5VT33 79 aa8.56□□□□□ -1.04
APOL3-208ENST00000426939 LINC00587B1AMM8 73 aa8.55□□□□□ -1.04
APOL3-208ENST00000426939 E9PLD3 99 aa8.55□□□□□ -1.04
APOL3-208ENST00000426939 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
APOL3-208ENST00000426939 NMUP48645 174 aa8.55□□□□□ -1.04
APOL3-208ENST00000426939 BOD1L2Q8IYS8 172 aa8.55□□□□□ -1.04
APOL3-208ENST00000426939 DAND5Q8N907 189 aa8.55□□□□□ -1.04
APOL3-208ENST00000426939 ATP6V1G1O75348 118 aa8.54□□□□□ -1.04
APOL3-208ENST00000426939 C3orf79P0CE67 100 aa8.54□□□□□ -1.04
APOL3-208ENST00000426939 UBE2AP49459 152 aa8.54□□□□□ -1.04
APOL3-208ENST00000426939 PRLHP81277 87 aa8.54□□□□□ -1.04
APOL3-208ENST00000426939 PET117Q6UWS5 81 aa8.54□□□□□ -1.04
APOL3-208ENST00000426939 NCR3O14931 201 aa8.53□□□□□ -1.04
APOL3-208ENST00000426939 UBR4Q5T4S7 5183 aa8.52□□□□□ -1.05
APOL3-208ENST00000426939 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa8.52□□□□□ -1.05
APOL3-208ENST00000426939 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa8.52□□□□□ -1.05
APOL3-208ENST00000426939 ARL17AQ8IVW1 177 aa8.52□□□□□ -1.05
APOL3-208ENST00000426939 A0A087X002 238 aa8.51□□□□□ -1.05
APOL3-208ENST00000426939 LRP2P98164 4655 aa8.5□□□□□ -1.05
APOL3-208ENST00000426939 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.5□□□□□ -1.05
APOL3-208ENST00000426939 A0A0J9YXY3 114 aa8.5□□□□□ -1.05
APOL3-208ENST00000426939 S100A1P23297 94 aa8.49□□□□□ -1.05
APOL3-208ENST00000426939 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
APOL3-208ENST00000426939 KRTDAPP60985 99 aa8.49□□□□□ -1.05
APOL3-208ENST00000426939 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.49□□□□□ -1.05
APOL3-208ENST00000426939 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.49□□□□□ -1.05
APOL3-208ENST00000426939 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.49□□□□□ -1.05
APOL3-208ENST00000426939 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa8.48□□□□□ -1.05
APOL3-208ENST00000426939 PRYO14603 147 aa8.48□□□□□ -1.05
APOL3-208ENST00000426939 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
APOL3-208ENST00000426939 SPRR1AP35321 89 aa8.48□□□□□ -1.05
APOL3-208ENST00000426939 LITAFQ99732 161 aa8.47□□□□□ -1.05
APOL3-208ENST00000426939 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.47□□□□□ -1.05
APOL3-208ENST00000426939 KCNQ1DNQ9H478 68 aa8.47□□□□□ -1.05
APOL3-208ENST00000426939 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
APOL3-208ENST00000426939 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa8.46□□□□□ -1.06
APOL3-208ENST00000426939 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa8.45□□□□□ -1.06
APOL3-208ENST00000426939 CRYGAP11844 174 aa8.45□□□□□ -1.06
APOL3-208ENST00000426939 NPC2P61916 151 aa8.45□□□□□ -1.06
APOL3-208ENST00000426939 NDUFC2O95298 119 aa8.44□□□□□ -1.06
APOL3-208ENST00000426939 FAM229BQ4G0N7 80 aa8.44□□□□□ -1.06
APOL3-208ENST00000426939 LINC00337Q8N6G1 96 aa8.44□□□□□ -1.06
APOL3-208ENST00000426939 MIEN1Q9BRT3 115 aa8.44□□□□□ -1.06
APOL3-208ENST00000426939 HIGD2AQ9BW72 106 aa8.44□□□□□ -1.06
APOL3-208ENST00000426939 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
APOL3-208ENST00000426939 ZNF815PA8K554 130 aa8.43□□□□□ -1.06
APOL3-208ENST00000426939 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.43□□□□□ -1.06
APOL3-208ENST00000426939 HIST3H2BBQ8N257 126 aa8.43□□□□□ -1.06
APOL3-208ENST00000426939 LPAP08519 4548 aa8.42□□□□□ -1.06
APOL3-208ENST00000426939 C20orf202A1L168 122 aa8.42□□□□□ -1.06
APOL3-208ENST00000426939 TIMM17BO60830 172 aa8.42□□□□□ -1.06
APOL3-208ENST00000426939 DDTP30046 118 aa8.42□□□□□ -1.06
APOL3-208ENST00000426939 ATOH7Q8N100 152 aa8.42□□□□□ -1.06
APOL3-208ENST00000426939 IGLV6-57P01721 117 aa8.41□□□□□ -1.06
APOL3-208ENST00000426939 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.41□□□□□ -1.06
APOL3-208ENST00000426939 SMCR5Q8TEV8 140 aa8.41□□□□□ -1.06
APOL3-208ENST00000426939 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa8.4□□□□□ -1.06
APOL3-208ENST00000426939 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.4□□□□□ -1.06
APOL3-208ENST00000426939 SPRR4Q96PI1 79 aa8.4□□□□□ -1.06
APOL3-208ENST00000426939 HIST1H2BLQ99880 126 aa8.4□□□□□ -1.06
APOL3-208ENST00000426939 B5MCH6 92 aa8.39□□□□□ -1.07
APOL3-208ENST00000426939 S100A7L2Q5SY68 101 aa8.37□□□□□ -1.07
APOL3-208ENST00000426939 C3orf22Q8N5N4 141 aa8.37□□□□□ -1.07
APOL3-208ENST00000426939 SPANXCQ9NY87 97 aa8.37□□□□□ -1.07
APOL3-208ENST00000426939 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.3 ms