RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426141.5

BRDT-208, Transcript of bromodomain testis associated, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene BRDT, Length 1,707 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDT-208ENST00000426141 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.32□□□□□ -1.24
BRDT-208ENST00000426141 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
BRDT-208ENST00000426141 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.32□□□□□ -1.24
BRDT-208ENST00000426141 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.32□□□□□ -1.24
BRDT-208ENST00000426141 H3BRM9 83 aa7.32□□□□□ -1.24
BRDT-208ENST00000426141 CLLU1Q5K131 121 aa7.32□□□□□ -1.24
BRDT-208ENST00000426141 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.32□□□□□ -1.24
BRDT-208ENST00000426141 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
BRDT-208ENST00000426141 RAB14P61106 215 aa7.3□□□□□ -1.24
BRDT-208ENST00000426141 SPRR4Q96PI1 79 aa7.3□□□□□ -1.24
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BRDT-208ENST00000426141 ERG28Q9UKR5 140 aa7.3□□□□□ -1.24
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BRDT-208ENST00000426141 Q8NBF4 154 aa7.29□□□□□ -1.24
BRDT-208ENST00000426141 Q8NDZ9 215 aa7.29□□□□□ -1.24
BRDT-208ENST00000426141 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
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BRDT-208ENST00000426141 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.19□□□□□ -1.26
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BRDT-208ENST00000426141 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.17□□□□□ -1.26
BRDT-208ENST00000426141 SLC25A20O43772 301 aa7.17□□□□□ -1.26
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BRDT-208ENST00000426141 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.16□□□□□ -1.26
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BRDT-208ENST00000426141 A0A096LNJ9 63 aa7.15□□□□□ -1.26
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BRDT-208ENST00000426141 CFC1BP0CG36 223 aa7.13□□□□□ -1.27
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BRDT-208ENST00000426141 LCE1DQ5T752 114 aa7.08□□□□□ -1.28
BRDT-208ENST00000426141 TMEM218A2RU14 115 aa7.07□□□□□ -1.28
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BRDT-208ENST00000426141 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.07□□□□□ -1.28
BRDT-208ENST00000426141 Q6ZRX8 168 aa7.06□□□□□ -1.28
BRDT-208ENST00000426141 DDTP30046 118 aa7.05□□□□□ -1.28
BRDT-208ENST00000426141 SVBPQ8N300 66 aa7.05□□□□□ -1.28
BRDT-208ENST00000426141 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.05□□□□□ -1.28
BRDT-208ENST00000426141 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.04□□□□□ -1.28
BRDT-208ENST00000426141 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
BRDT-208ENST00000426141 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.04□□□□□ -1.28
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