RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398743.6

PRAME-202, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAME, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-202ENST00000398743 ANAPC13Q9BS18 74 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-202ENST00000398743 BAHCC1Q9P281 2608 aa9.29□□□□□ -0.92
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PRAME-202ENST00000398743 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PRAME-202ENST00000398743 C11orf45Q8TAV5 145 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-202ENST00000398743 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-202ENST00000398743 C6orf48Q9UBA6 75 aa9.29□□□□□ -0.92
PRAME-202ENST00000398743 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-202ENST00000398743 C6orf99Q4VX62 202 aa9.28□□□□□ -0.92
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PRAME-202ENST00000398743 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa9.27□□□□□ -0.92
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PRAME-202ENST00000398743 C14orf132Q9NPU4 83 aa9.27□□□□□ -0.92
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PRAME-202ENST00000398743 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa9.09□□□□□ -0.95
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PRAME-202ENST00000398743 COL6A5A8TX70 2615 aa9.07□□□□□ -0.96
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PRAME-202ENST00000398743 DSCR8Q96T75 97 aa9.06□□□□□ -0.96
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PRAME-202ENST00000398743 NKAPP1Q8N9T2 125 aa9.05□□□□□ -0.96
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PRAME-202ENST00000398743 C7orf33Q8WU49 177 aa9.01□□□□□ -0.97
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PRAME-202ENST00000398743 M0R2N4 97 aa8.98□□□□□ -0.97
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