RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376057.8

PDPN-202, Transcript of podoplanin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PDPN, Length 2,801 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPN-202ENST00000376057 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PDPN-202ENST00000376057 C3orf84H3BNL1 204 aa7.27□□□□□ -1.25
PDPN-202ENST00000376057 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PDPN-202ENST00000376057 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.27□□□□□ -1.25
PDPN-202ENST00000376057 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.27□□□□□ -1.25
PDPN-202ENST00000376057 CARD19Q96LW7 228 aa7.27□□□□□ -1.25
PDPN-202ENST00000376057 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PDPN-202ENST00000376057 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.27□□□□□ -1.25
PDPN-202ENST00000376057 DNAH6Q9C0G6 4158 aa7.27□□□□□ -1.25
PDPN-202ENST00000376057 COX6CP09669 75 aa7.27□□□□□ -1.25
PDPN-202ENST00000376057 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.27□□□□□ -1.25
PDPN-202ENST00000376057 CASC10Q5T4H9 136 aa7.27□□□□□ -1.25
PDPN-202ENST00000376057 Q6ZR54 194 aa7.27□□□□□ -1.25
PDPN-202ENST00000376057 LINC01600Q96MT4 127 aa7.26□□□□□ -1.25
PDPN-202ENST00000376057 STARD9Q9P2P6 4700 aa7.26□□□□□ -1.25
PDPN-202ENST00000376057 TRIAP1O43715 76 aa7.26□□□□□ -1.25
PDPN-202ENST00000376057 SLPIP03973 132 aa7.25□□□□□ -1.25
PDPN-202ENST00000376057 M0QXV9 152 aa7.25□□□□□ -1.25
PDPN-202ENST00000376057 PSMB2P49721 201 aa7.25□□□□□ -1.25
PDPN-202ENST00000376057 Q1RN00 199 aa7.25□□□□□ -1.25
PDPN-202ENST00000376057 SMIM20Q8N5G0 67 aa7.24□□□□□ -1.25
PDPN-202ENST00000376057 TMEM126AQ9H061 195 aa7.24□□□□□ -1.25
PDPN-202ENST00000376057 FBN3Q75N90 2809 aa7.24□□□□□ -1.25
PDPN-202ENST00000376057 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.24□□□□□ -1.25
PDPN-202ENST00000376057 F8W1H4 67 aa7.24□□□□□ -1.25
PDPN-202ENST00000376057 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.24□□□□□ -1.25
PDPN-202ENST00000376057 TCL1BO95988 128 aa7.23□□□□□ -1.25
PDPN-202ENST00000376057 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.23□□□□□ -1.25
PDPN-202ENST00000376057 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.23□□□□□ -1.25
PDPN-202ENST00000376057 PSCAO43653 123 aa7.23□□□□□ -1.25
PDPN-202ENST00000376057 IGLV6-57P01721 117 aa7.23□□□□□ -1.25
PDPN-202ENST00000376057 ATXN8Q156A1 80 aa7.23□□□□□ -1.25
PDPN-202ENST00000376057 Q6ZRP5 223 aa7.23□□□□□ -1.25
PDPN-202ENST00000376057 J3QR89 54 aa7.22□□□□□ -1.25
PDPN-202ENST00000376057 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.22□□□□□ -1.25
PDPN-202ENST00000376057 H0YGX0 51 aa7.22□□□□□ -1.25
PDPN-202ENST00000376057 VPREB1P12018 145 aa7.22□□□□□ -1.25
PDPN-202ENST00000376057 Q8NDZ9 215 aa7.22□□□□□ -1.25
PDPN-202ENST00000376057 LYSTQ99698 3801 aa7.22□□□□□ -1.25
PDPN-202ENST00000376057 PRO0461Q9UI25 63 aa7.22□□□□□ -1.25
PDPN-202ENST00000376057 H7C2G1 150 aa7.21□□□□□ -1.25
PDPN-202ENST00000376057 LST1O00453 97 aa7.21□□□□□ -1.26
PDPN-202ENST00000376057 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.21□□□□□ -1.26
PDPN-202ENST00000376057 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.2□□□□□ -1.26
PDPN-202ENST00000376057 B5MCH6 92 aa7.2□□□□□ -1.26
PDPN-202ENST00000376057 H3BMG7 143 aa7.2□□□□□ -1.26
PDPN-202ENST00000376057 M0R378 163 aa7.2□□□□□ -1.26
PDPN-202ENST00000376057 WFDC2Q14508 124 aa7.2□□□□□ -1.26
PDPN-202ENST00000376057 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PDPN-202ENST00000376057 A0A1B0GX51 115 aa7.19□□□□□ -1.26
PDPN-202ENST00000376057 TRACP01848 142 aa7.19□□□□□ -1.26
PDPN-202ENST00000376057 LINC00476Q8WZB0 136 aa7.19□□□□□ -1.26
PDPN-202ENST00000376057 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.19□□□□□ -1.26
PDPN-202ENST00000376057 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.18□□□□□ -1.26
PDPN-202ENST00000376057 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PDPN-202ENST00000376057 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.17□□□□□ -1.26
PDPN-202ENST00000376057 C16orf90A8MZG2 172 aa7.17□□□□□ -1.26
PDPN-202ENST00000376057 LINC01620Q4KN68 170 aa7.17□□□□□ -1.26
PDPN-202ENST00000376057 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.17□□□□□ -1.26
PDPN-202ENST00000376057 Q8N814 137 aa7.16□□□□□ -1.26
PDPN-202ENST00000376057 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.16□□□□□ -1.26
PDPN-202ENST00000376057 ANAPC13Q9BS18 74 aa7.16□□□□□ -1.26
PDPN-202ENST00000376057 NCR3O14931 201 aa7.16□□□□□ -1.26
PDPN-202ENST00000376057 LECT2O14960 151 aa7.16□□□□□ -1.26
PDPN-202ENST00000376057 GAGE2EQ4V326 116 aa7.15□□□□□ -1.26
PDPN-202ENST00000376057 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.15□□□□□ -1.26
PDPN-202ENST00000376057 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PDPN-202ENST00000376057 A0A087WTM6 91 aa7.14□□□□□ -1.27
PDPN-202ENST00000376057 H3BT86 120 aa7.14□□□□□ -1.27
PDPN-202ENST00000376057 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.14□□□□□ -1.27
PDPN-202ENST00000376057 LINC00167Q96N53 147 aa7.14□□□□□ -1.27
PDPN-202ENST00000376057 CLEC2BQ92478 149 aa7.14□□□□□ -1.27
PDPN-202ENST00000376057 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PDPN-202ENST00000376057 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.14□□□□□ -1.27
PDPN-202ENST00000376057 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.13□□□□□ -1.27
PDPN-202ENST00000376057 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.13□□□□□ -1.27
PDPN-202ENST00000376057 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.13□□□□□ -1.27
PDPN-202ENST00000376057 EPM2AB3EWF7 344 aa7.13□□□□□ -1.27
PDPN-202ENST00000376057 SLC25A20O43772 301 aa7.12□□□□□ -1.27
PDPN-202ENST00000376057 LY6G6CO95867 125 aa7.12□□□□□ -1.27
PDPN-202ENST00000376057 M0R2N4 97 aa7.12□□□□□ -1.27
PDPN-202ENST00000376057 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.12□□□□□ -1.27
PDPN-202ENST00000376057 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.12□□□□□ -1.27
PDPN-202ENST00000376057 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.12□□□□□ -1.27
PDPN-202ENST00000376057 C9JAW5 83 aa7.11□□□□□ -1.27
PDPN-202ENST00000376057 MT-ATP8P03928 68 aa7.11□□□□□ -1.27
PDPN-202ENST00000376057 C5orf47Q569G3 176 aa7.11□□□□□ -1.27
PDPN-202ENST00000376057 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.11□□□□□ -1.27
PDPN-202ENST00000376057 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.11□□□□□ -1.27
PDPN-202ENST00000376057 TENM2Q9NT68 2774 aa7.11□□□□□ -1.27
PDPN-202ENST00000376057 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.11□□□□□ -1.27
PDPN-202ENST00000376057 DNAH10Q8IVF4 4471 aa7.11□□□□□ -1.27
PDPN-202ENST00000376057 GAGE2BQ13066 116 aa7.1□□□□□ -1.27
PDPN-202ENST00000376057 ETDBQ3ZM63 59 aa7.1□□□□□ -1.27
PDPN-202ENST00000376057 H3BQ85 93 aa7.1□□□□□ -1.27
PDPN-202ENST00000376057 PRYO14603 147 aa7.1□□□□□ -1.27
PDPN-202ENST00000376057 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PDPN-202ENST00000376057 SNCGO76070 127 aa7.1□□□□□ -1.27
PDPN-202ENST00000376057 C6orf99Q4VX62 202 aa7.1□□□□□ -1.27
PDPN-202ENST00000376057 C7orf33Q8WU49 177 aa7.1□□□□□ -1.27
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