RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368213.9

PTPRK-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 5,816 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-205ENST00000368213 C19orf73Q9NVV2 129 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-205ENST00000368213 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-205ENST00000368213 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-205ENST00000368213 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-205ENST00000368213 YPEL4Q96NS1 127 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-205ENST00000368213 A0A087WSZ3 146 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-205ENST00000368213 Q8N3U1 123 aa7.37□□□□□ -1.23
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PTPRK-205ENST00000368213 LINC00167Q96N53 147 aa7.37□□□□□ -1.23
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PTPRK-205ENST00000368213 Q8N9L7 120 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-205ENST00000368213 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-205ENST00000368213 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRK-205ENST00000368213 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRK-205ENST00000368213 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRK-205ENST00000368213 SZT2Q5T011 3432 aa7.36□□□□□ -1.23
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PTPRK-205ENST00000368213 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.35□□□□□ -1.23
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PTPRK-205ENST00000368213 A8MTW9 85 aa7.35□□□□□ -1.23
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PTPRK-205ENST00000368213 C20orf197Q8N268 126 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRK-205ENST00000368213 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRK-205ENST00000368213 Q6Q795 121 aa7.33□□□□□ -1.24
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PTPRK-205ENST00000368213 Q9UF83 564 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-205ENST00000368213 VCANP13611 3396 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-205ENST00000368213 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-205ENST00000368213 MGAQ8IWI9 3026 aa7.3□□□□□ -1.24
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PTPRK-205ENST00000368213 APLNQ9ULZ1 77 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRK-205ENST00000368213 SPINK1P00995 79 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRK-205ENST00000368213 C1orf195Q5TG92 126 aa7.23□□□□□ -1.25
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PTPRK-205ENST00000368213 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
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PTPRK-205ENST00000368213 CASC10Q5T4H9 136 aa7.18□□□□□ -1.26
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PTPRK-205ENST00000368213 CDIP1Q9H305 208 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRK-205ENST00000368213 NDUFC1O43677 76 aa7.17□□□□□ -1.26
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PTPRK-205ENST00000368213 H0Y9P7 68 aa7.16□□□□□ -1.26
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PTPRK-205ENST00000368213 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRK-205ENST00000368213 CFAP46Q8IYW2 2715 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRK-205ENST00000368213 LINC00313P59037 77 aa7.15□□□□□ -1.27
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PTPRK-205ENST00000368213 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRK-205ENST00000368213 Q96NJ1 140 aa7.14□□□□□ -1.27
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