RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 ATRQ13535 2644 aa4.92□□□□□ -1.62
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PTPRR-202ENST00000342084 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRR-202ENST00000342084 S100A7L2Q5SY68 101 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRR-202ENST00000342084 RETNQ9HD89 108 aa4.92□□□□□ -1.62
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PTPRR-202ENST00000342084 KRTAP10-11P60412 298 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRR-202ENST00000342084 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRR-202ENST00000342084 VPREB1P12018 145 aa4.82□□□□□ -1.64
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PTPRR-202ENST00000342084 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa4.81□□□□□ -1.64
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PTPRR-202ENST00000342084 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa4.79□□□□□ -1.64
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PTPRR-202ENST00000342084 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-202ENST00000342084 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-202ENST00000342084 OXTP01178 125 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-202ENST00000342084 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-202ENST00000342084 CASC10Q5T4H9 136 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-202ENST00000342084 DEFB105AQ8NG35 78 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRR-202ENST00000342084 STAB1Q9NY15 2570 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRR-202ENST00000342084 Q8N9L7 120 aa4.76□□□□□ -1.65
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