RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293683.9

PDE4A-201, Transcript of phosphodiesterase 4A, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4A, Length 2,583 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4A-201ENST00000293683 UPK3BQ9BT76 320 aa11.74□□□□□ -0.53
PDE4A-201ENST00000293683 HTN3P15516 51 aa11.73□□□□□ -0.53
PDE4A-201ENST00000293683 SPAG11BQ08648 103 aa11.73□□□□□ -0.53
PDE4A-201ENST00000293683 LINC00575Q6W349 94 aa11.73□□□□□ -0.53
PDE4A-201ENST00000293683 M0R2N4 97 aa11.73□□□□□ -0.53
PDE4A-201ENST00000293683 DAD1P61803 113 aa11.72□□□□□ -0.53
PDE4A-201ENST00000293683 HIVEP1P15822 2718 aa11.72□□□□□ -0.53
PDE4A-201ENST00000293683 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa11.72□□□□□ -0.53
PDE4A-201ENST00000293683 CYSRT1A8MQ03 144 aa11.71□□□□□ -0.54
PDE4A-201ENST00000293683 KLK12Q9UKR0 248 aa11.69□□□□□ -0.54
PDE4A-201ENST00000293683 Q6ZQT0 140 aa11.68□□□□□ -0.54
PDE4A-201ENST00000293683 OTOGQ6ZRI0 2925 aa11.67□□□□□ -0.54
PDE4A-201ENST00000293683 GHRHP01286 108 aa11.67□□□□□ -0.54
PDE4A-201ENST00000293683 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa11.67□□□□□ -0.54
PDE4A-201ENST00000293683 XAGE1AQ9HD64 81 aa11.67□□□□□ -0.54
PDE4A-201ENST00000293683 J3KT08 172 aa11.66□□□□□ -0.54
PDE4A-201ENST00000293683 RBM3P98179 157 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PDE4A-201ENST00000293683 LYPD5Q6UWN5 251 aa11.66□□□□□ -0.54
PDE4A-201ENST00000293683 Q6ZQY7 126 aa11.66□□□□□ -0.54
PDE4A-201ENST00000293683 UBL5Q9BZL1 73 aa11.66□□□□□ -0.54
PDE4A-201ENST00000293683 J3QKU1 62 aa11.66□□□□□ -0.54
PDE4A-201ENST00000293683 IGLV6-57P01721 117 aa11.66□□□□□ -0.54
PDE4A-201ENST00000293683 Q8NAQ8 132 aa11.66□□□□□ -0.54
PDE4A-201ENST00000293683 ATRQ13535 2644 aa11.65□□□□□ -0.54
PDE4A-201ENST00000293683 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa11.65□□□□□ -0.55
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa11.64□□□□□ -0.55
PDE4A-201ENST00000293683 A0A0J9YWU9 116 aa11.64□□□□□ -0.55
PDE4A-201ENST00000293683 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa11.64□□□□□ -0.55
PDE4A-201ENST00000293683 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa11.64□□□□□ -0.55
PDE4A-201ENST00000293683 DSCR8Q96T75 97 aa11.64□□□□□ -0.55
PDE4A-201ENST00000293683 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PDE4A-201ENST00000293683 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PDE4A-201ENST00000293683 C6orf48Q9UBA6 75 aa11.63□□□□□ -0.55
PDE4A-201ENST00000293683 LELP1Q5T871 98 aa11.62□□□□□ -0.55
PDE4A-201ENST00000293683 C9orf66Q5T8R8 295 aa11.62□□□□□ -0.55
PDE4A-201ENST00000293683 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa11.62□□□□□ -0.55
PDE4A-201ENST00000293683 TMEM258P61165 79 aa11.61□□□□□ -0.55
PDE4A-201ENST00000293683 PRR34Q9NV39 138 aa11.61□□□□□ -0.55
PDE4A-201ENST00000293683 APOC4P55056 127 aa11.61□□□□□ -0.55
PDE4A-201ENST00000293683 DPH3Q96FX2 82 aa11.6□□□□□ -0.55
PDE4A-201ENST00000293683 OXTP01178 125 aa11.6□□□□□ -0.55
PDE4A-201ENST00000293683 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa11.59□□□□□ -0.55
PDE4A-201ENST00000293683 HAMPP81172 84 aa11.59□□□□□ -0.55
PDE4A-201ENST00000293683 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
PDE4A-201ENST00000293683 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
PDE4A-201ENST00000293683 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
PDE4A-201ENST00000293683 HIGD2BQ4VC39 106 aa11.58□□□□□ -0.56
PDE4A-201ENST00000293683 Q6ZVQ6 151 aa11.58□□□□□ -0.56
PDE4A-201ENST00000293683 SPART-AS1P0CW21 52 aa11.57□□□□□ -0.56
PDE4A-201ENST00000293683 C20orf197Q8N268 126 aa11.57□□□□□ -0.56
PDE4A-201ENST00000293683 MIFP14174 115 aa11.56□□□□□ -0.56
PDE4A-201ENST00000293683 DIRC1Q969H9 104 aa11.56□□□□□ -0.56
PDE4A-201ENST00000293683 RPS28P62857 69 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
PDE4A-201ENST00000293683 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
PDE4A-201ENST00000293683 WFDC10BQ8IUB3 73 aa11.54□□□□□ -0.56
PDE4A-201ENST00000293683 MUC7Q8TAX7 377 aa11.54□□□□□ -0.56
PDE4A-201ENST00000293683 ANK2Q01484 3957 aa11.53□□□□□ -0.56
PDE4A-201ENST00000293683 SCXQ7RTU7 201 aa11.53□□□□□ -0.56
PDE4A-201ENST00000293683 TRAV10A0A0B4J240 114 aa11.52□□□□□ -0.56
PDE4A-201ENST00000293683 INAFM1C9JVW0 142 aa11.51□□□□□ -0.57
PDE4A-201ENST00000293683 COX7BP24311 80 aa11.51□□□□□ -0.57
PDE4A-201ENST00000293683 CAMK2N2Q96S95 79 aa11.5□□□□□ -0.57
PDE4A-201ENST00000293683 VPREB1P12018 145 aa11.49□□□□□ -0.57
PDE4A-201ENST00000293683 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
PDE4A-201ENST00000293683 Q6ZRU5 148 aa11.48□□□□□ -0.57
PDE4A-201ENST00000293683 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa11.48□□□□□ -0.57
PDE4A-201ENST00000293683 RETNQ9HD89 108 aa11.48□□□□□ -0.57
PDE4A-201ENST00000293683 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
PDE4A-201ENST00000293683 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa11.46□□□□□ -0.58
PDE4A-201ENST00000293683 TENM3Q9P273 2699 aa11.46□□□□□ -0.58
PDE4A-201ENST00000293683 C15orf56Q8N910 161 aa11.45□□□□□ -0.58
PDE4A-201ENST00000293683 TRAV7A0A075B6U4 112 aa11.44□□□□□ -0.58
PDE4A-201ENST00000293683 PDE6GP18545 87 aa11.44□□□□□ -0.58
PDE4A-201ENST00000293683 SNURFQ9Y675 71 aa11.44□□□□□ -0.58
PDE4A-201ENST00000293683 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
PDE4A-201ENST00000293683 CXCL6P80162 114 aa11.43□□□□□ -0.58
PDE4A-201ENST00000293683 H7BZZ5 65 aa11.42□□□□□ -0.58
PDE4A-201ENST00000293683 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa11.41□□□□□ -0.58
PDE4A-201ENST00000293683 LINC00528Q8N1L1 170 aa11.41□□□□□ -0.58
PDE4A-201ENST00000293683 M0R378 163 aa11.41□□□□□ -0.58
PDE4A-201ENST00000293683 Q6ZRP5 223 aa11.41□□□□□ -0.58
PDE4A-201ENST00000293683 Q6ZTC4 211 aa11.41□□□□□ -0.58
PDE4A-201ENST00000293683 Q8N9L7 120 aa11.41□□□□□ -0.58
PDE4A-201ENST00000293683 C4orf26Q17RF5 130 aa11.4□□□□□ -0.58
PDE4A-201ENST00000293683 RMI2Q96E14 147 aa11.4□□□□□ -0.58
PDE4A-201ENST00000293683 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa11.4□□□□□ -0.58
PDE4A-201ENST00000293683 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa11.4□□□□□ -0.58
PDE4A-201ENST00000293683 FAM236CP0DP71 79 aa11.4□□□□□ -0.58
PDE4A-201ENST00000293683 TM2D3Q9BRN9 247 aa11.4□□□□□ -0.58
PDE4A-201ENST00000293683 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa11.39□□□□□ -0.59
PDE4A-201ENST00000293683 H3BQ85 93 aa11.39□□□□□ -0.59
PDE4A-201ENST00000293683 Q5XG85 94 aa11.39□□□□□ -0.59
PDE4A-201ENST00000293683 ESRGQ1W209 222 aa11.37□□□□□ -0.59
PDE4A-201ENST00000293683 C5orf47Q569G3 176 aa11.36□□□□□ -0.59
PDE4A-201ENST00000293683 KLKP1Q107X0 134 aa11.36□□□□□ -0.59
PDE4A-201ENST00000293683 BCE1O60756 84 aa11.35□□□□□ -0.59
PDE4A-201ENST00000293683 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa11.35□□□□□ -0.59
PDE4A-201ENST00000293683 OXLD1Q5BKU9 147 aa11.35□□□□□ -0.59
PDE4A-201ENST00000293683 DEFB105AQ8NG35 78 aa11.34□□□□□ -0.59
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