RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 H3BNG1 76 aa14.59□□□□□ -0.07
CCSAP-201ENST00000284617 MTORP42345 2549 aa14.59□□□□□ -0.07
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf64Q8NEQ6 169 aa14.59□□□□□ -0.07
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00167Q96N53 147 aa14.57□□□□□ -0.08
CCSAP-201ENST00000284617 KLK9Q2XQG4 91 aa14.57□□□□□ -0.08
CCSAP-201ENST00000284617 SMIM29Q86T20 159 aa14.57□□□□□ -0.08
CCSAP-201ENST00000284617 LIMD2Q9BT23 127 aa14.56□□□□□ -0.08
CCSAP-201ENST00000284617 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CCSAP-201ENST00000284617 Q9UF83 564 aa14.56□□□□□ -0.08
CCSAP-201ENST00000284617 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CCSAP-201ENST00000284617 EP400Q96L91 3159 aa14.56□□□□□ -0.08
CCSAP-201ENST00000284617 X6R8D5 127 aa14.55□□□□□ -0.08
CCSAP-201ENST00000284617 SPTBN4Q9H254 2564 aa14.54□□□□□ -0.08
CCSAP-201ENST00000284617 RETNLBQ9BQ08 111 aa14.54□□□□□ -0.08
CCSAP-201ENST00000284617 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa14.52□□□□□ -0.09
CCSAP-201ENST00000284617 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa14.51□□□□□ -0.09
CCSAP-201ENST00000284617 Q6ZQT0 140 aa14.51□□□□□ -0.09
CCSAP-201ENST00000284617 PTPRBP23467 1997 aa14.5□□□□□ -0.09
CCSAP-201ENST00000284617 SPINK1P00995 79 aa14.49□□□□□ -0.09
CCSAP-201ENST00000284617 CENPFP49454 3210 aa14.49□□□□□ -0.09
CCSAP-201ENST00000284617 MUC4Q99102 2169 aa14.48□□□□□ -0.09
CCSAP-201ENST00000284617 RPS28P62857 69 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CCSAP-201ENST00000284617 Q8NBF4 154 aa14.47□□□□□ -0.09
CCSAP-201ENST00000284617 Q6ZRX8 168 aa14.45□□□□□ -0.1
CCSAP-201ENST00000284617 FASNP49327 2511 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
CCSAP-201ENST00000284617 LITAFQ99732 161 aa14.44□□□□□ -0.1
CCSAP-201ENST00000284617 PRO0628Q9UI54 55 aa14.43□□□□□ -0.1
CCSAP-201ENST00000284617 H3BPC8 53 aa14.41□□□□□ -0.1
CCSAP-201ENST00000284617 MDFIQ99750 246 aa14.41□□□□□ -0.1
CCSAP-201ENST00000284617 FSHBP01225 129 aa14.4□□□□□ -0.1
CCSAP-201ENST00000284617 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
CCSAP-201ENST00000284617 COL4A2P08572 1712 aa14.4□□□□□ -0.1
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00476Q8WZB0 136 aa14.39□□□□□ -0.11
CCSAP-201ENST00000284617 MOBPQ13875 183 aa14.38□□□□□ -0.11
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa14.38□□□□□ -0.11
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV2-30P06310 120 aa14.38□□□□□ -0.11
CCSAP-201ENST00000284617 Q8NAQ8 132 aa14.37□□□□□ -0.11
CCSAP-201ENST00000284617 POLQO75417 2590 aa14.37□□□□□ -0.11
CCSAP-201ENST00000284617 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
CCSAP-201ENST00000284617 F8P00451 2351 aa14.36□□□□□ -0.11
CCSAP-201ENST00000284617 ACYP2P14621 99 aa14.34□□□□□ -0.11
CCSAP-201ENST00000284617 C16orf90A8MZG2 172 aa14.31□□□□□ -0.12
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1B0GU69 56 aa14.31□□□□□ -0.12
CCSAP-201ENST00000284617 IGLV6-57P01721 117 aa14.3□□□□□ -0.12
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
CCSAP-201ENST00000284617 TRAV22A0A0B4J277 110 aa14.29□□□□□ -0.12
CCSAP-201ENST00000284617 TM2D3Q9BRN9 247 aa14.29□□□□□ -0.12
CCSAP-201ENST00000284617 C7orf65Q6ZTY9 151 aa14.29□□□□□ -0.12
CCSAP-201ENST00000284617 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
CCSAP-201ENST00000284617 ACANP16112 2415 aa14.29□□□□□ -0.12
CCSAP-201ENST00000284617 EPM2AB3EWF7 344 aa14.29□□□□□ -0.12
CCSAP-201ENST00000284617 VPREB1P12018 145 aa14.28□□□□□ -0.12
CCSAP-201ENST00000284617 SPACA4Q8TDM5 124 aa14.28□□□□□ -0.12
CCSAP-201ENST00000284617 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa14.28□□□□□ -0.12
CCSAP-201ENST00000284617 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa14.27□□□□□ -0.13
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00588Q9Y4M8 146 aa14.26□□□□□ -0.13
CCSAP-201ENST00000284617 Q6ZRP5 223 aa14.24□□□□□ -0.13
CCSAP-201ENST00000284617 C4orf26Q17RF5 130 aa14.24□□□□□ -0.13
CCSAP-201ENST00000284617 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa14.23□□□□□ -0.13
CCSAP-201ENST00000284617 DNAH10OSP0CZ25 163 aa14.22□□□□□ -0.13
CCSAP-201ENST00000284617 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa14.21□□□□□ -0.13
CCSAP-201ENST00000284617 SPAG11AQ6PDA7 123 aa14.2□□□□□ -0.14
CCSAP-201ENST00000284617 ERC2-IT1O76042 136 aa14.19□□□□□ -0.14
CCSAP-201ENST00000284617 RTL8CO15255 209 aa14.18□□□□□ -0.14
CCSAP-201ENST00000284617 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa14.18□□□□□ -0.14
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00313P59037 77 aa14.17□□□□□ -0.14
CCSAP-201ENST00000284617 PCSK5Q92824 1860 aa14.16□□□□□ -0.14
CCSAP-201ENST00000284617 KCNQ1DNQ9H478 68 aa14.15□□□□□ -0.14
CCSAP-201ENST00000284617 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
CCSAP-201ENST00000284617 A8MWP4 228 aa14.14□□□□□ -0.15
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00528Q8N1L1 170 aa14.13□□□□□ -0.15
CCSAP-201ENST00000284617 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa14.12□□□□□ -0.15
CCSAP-201ENST00000284617 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
CCSAP-201ENST00000284617 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa14.11□□□□□ -0.15
CCSAP-201ENST00000284617 CHTF8P0CG12 524 aa14.1□□□□□ -0.15
CCSAP-201ENST00000284617 PRR34Q9NV39 138 aa14.09□□□□□ -0.15
CCSAP-201ENST00000284617 K7EQZ3 153 aa14.09□□□□□ -0.15
CCSAP-201ENST00000284617 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa14.09□□□□□ -0.15
CCSAP-201ENST00000284617 C8orf87E5RJ46 101 aa14.07□□□□□ -0.16
CCSAP-201ENST00000284617 FAM168BA1KXE4 195 aa14.07□□□□□ -0.16
CCSAP-201ENST00000284617 TYMSOSQ8TAI1 123 aa14.07□□□□□ -0.16
CCSAP-201ENST00000284617 FAM229AH3BQW9 127 aa14.05□□□□□ -0.16
CCSAP-201ENST00000284617 EPG5Q9HCE0 2579 aa14.05□□□□□ -0.16
CCSAP-201ENST00000284617 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa14.04□□□□□ -0.16
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
CCSAP-201ENST00000284617 KLKP1Q107X0 134 aa14□□□□□ -0.17
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00612Q8N6U2 182 aa14□□□□□ -0.17
CCSAP-201ENST00000284617 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
CCSAP-201ENST00000284617 IGFL1Q6UW32 110 aa13.98□□□□□ -0.17
CCSAP-201ENST00000284617 C19orf73Q9NVV2 129 aa13.97□□□□□ -0.17
CCSAP-201ENST00000284617 C15orf56Q8N910 161 aa13.97□□□□□ -0.17
CCSAP-201ENST00000284617 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa13.96□□□□□ -0.17
CCSAP-201ENST00000284617 A0A096LNT2 108 aa13.96□□□□□ -0.17
CCSAP-201ENST00000284617 COA5Q86WW8 74 aa13.95□□□□□ -0.18
CCSAP-201ENST00000284617 PRR15Q8IV56 129 aa13.95□□□□□ -0.18
CCSAP-201ENST00000284617 Q96NJ1 140 aa13.94□□□□□ -0.18
CCSAP-201ENST00000284617 Q8N377 158 aa13.94□□□□□ -0.18
CCSAP-201ENST00000284617 A8MUN3 132 aa13.91□□□□□ -0.18
CCSAP-201ENST00000284617 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa13.91□□□□□ -0.18
CCSAP-201ENST00000284617 TLX1NBP0CAT3 122 aa13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66 ms