RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 LINC00575Q6W349 94 aa18.95■□□□□ 0.62
UBP1-201ENST00000283628 C6orf223Q8N319 242 aa18.95■□□□□ 0.62
UBP1-201ENST00000283628 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa18.94■□□□□ 0.62
UBP1-201ENST00000283628 HTN3P15516 51 aa18.94■□□□□ 0.62
UBP1-201ENST00000283628 CYSRT1A8MQ03 144 aa18.94■□□□□ 0.62
UBP1-201ENST00000283628 WIPF1O43516 503 aa18.93■□□□□ 0.62
UBP1-201ENST00000283628 COX7CP15954 63 aa18.93■□□□□ 0.62
UBP1-201ENST00000283628 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
UBP1-201ENST00000283628 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
UBP1-201ENST00000283628 KLK12Q9UKR0 248 aa18.92■□□□□ 0.62
UBP1-201ENST00000283628 F8P00451 2351 aa18.9■□□□□ 0.62
UBP1-201ENST00000283628 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.62
UBP1-201ENST00000283628 IGLV6-57P01721 117 aa18.89■□□□□ 0.62
UBP1-201ENST00000283628 ENHOQ6UWT2 76 aa18.89■□□□□ 0.61
UBP1-201ENST00000283628 C2orf48Q96LS8 159 aa18.89■□□□□ 0.61
UBP1-201ENST00000283628 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa18.88■□□□□ 0.61
UBP1-201ENST00000283628 hADV29S1A0JD25 119 aa18.88■□□□□ 0.61
UBP1-201ENST00000283628 ATRQ13535 2644 aa18.86■□□□□ 0.61
UBP1-201ENST00000283628 LYPD5Q6UWN5 251 aa18.85■□□□□ 0.61
UBP1-201ENST00000283628 C3orf56Q8N813 242 aa18.85■□□□□ 0.61
UBP1-201ENST00000283628 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa18.83■□□□□ 0.61
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa18.83■□□□□ 0.6
UBP1-201ENST00000283628 H3BQ85 93 aa18.82■□□□□ 0.6
UBP1-201ENST00000283628 CRYGAP11844 174 aa18.81■□□□□ 0.6
UBP1-201ENST00000283628 SMIM20Q8N5G0 67 aa18.8■□□□□ 0.6
UBP1-201ENST00000283628 C6orf48Q9UBA6 75 aa18.8■□□□□ 0.6
UBP1-201ENST00000283628 A0A087WVE0 104 aa18.79■□□□□ 0.6
UBP1-201ENST00000283628 RBM3P98179 157 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
UBP1-201ENST00000283628 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa18.78■□□□□ 0.6
UBP1-201ENST00000283628 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
UBP1-201ENST00000283628 H3BNG1 76 aa18.77■□□□□ 0.6
UBP1-201ENST00000283628 UBL5Q9BZL1 73 aa18.77■□□□□ 0.6
UBP1-201ENST00000283628 USP17L23D6RBM5 183 aa18.77■□□□□ 0.59
UBP1-201ENST00000283628 SERP2Q8N6R1 65 aa18.77■□□□□ 0.59
UBP1-201ENST00000283628 SVIPQ8NHG7 77 aa18.77■□□□□ 0.59
UBP1-201ENST00000283628 Q6ZQT0 140 aa18.76■□□□□ 0.59
UBP1-201ENST00000283628 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa18.75■□□□□ 0.59
UBP1-201ENST00000283628 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa18.74■□□□□ 0.59
UBP1-201ENST00000283628 DIRC1Q969H9 104 aa18.73■□□□□ 0.59
UBP1-201ENST00000283628 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa18.73■□□□□ 0.59
UBP1-201ENST00000283628 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa18.72■□□□□ 0.59
UBP1-201ENST00000283628 Q6ZQY7 126 aa18.7■□□□□ 0.58
UBP1-201ENST00000283628 XAGE1AQ9HD64 81 aa18.7■□□□□ 0.58
UBP1-201ENST00000283628 PDE6GP18545 87 aa18.69■□□□□ 0.58
UBP1-201ENST00000283628 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa18.68■□□□□ 0.58
UBP1-201ENST00000283628 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
UBP1-201ENST00000283628 WFDC10BQ8IUB3 73 aa18.68■□□□□ 0.58
UBP1-201ENST00000283628 OXLD1Q5BKU9 147 aa18.67■□□□□ 0.58
UBP1-201ENST00000283628 CAMK2N2Q96S95 79 aa18.67■□□□□ 0.58
UBP1-201ENST00000283628 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
UBP1-201ENST00000283628 GHRHP01286 108 aa18.67■□□□□ 0.58
UBP1-201ENST00000283628 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa18.67■□□□□ 0.58
UBP1-201ENST00000283628 DSCR8Q96T75 97 aa18.67■□□□□ 0.58
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa18.66■□□□□ 0.58
UBP1-201ENST00000283628 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP10-11P60412 298 aa18.65■□□□□ 0.58
UBP1-201ENST00000283628 COX7BP24311 80 aa18.64■□□□□ 0.57
UBP1-201ENST00000283628 VPREB1P12018 145 aa18.63■□□□□ 0.57
UBP1-201ENST00000283628 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
UBP1-201ENST00000283628 HIGD2BQ4VC39 106 aa18.63■□□□□ 0.57
UBP1-201ENST00000283628 UPK3BQ9BT76 320 aa18.62■□□□□ 0.57
UBP1-201ENST00000283628 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa18.61■□□□□ 0.57
UBP1-201ENST00000283628 M0R378 163 aa18.59■□□□□ 0.57
UBP1-201ENST00000283628 C15orf56Q8N910 161 aa18.58■□□□□ 0.57
UBP1-201ENST00000283628 Q6ZRU5 148 aa18.58■□□□□ 0.56
UBP1-201ENST00000283628 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa18.57■□□□□ 0.56
UBP1-201ENST00000283628 Q6ZTC4 211 aa18.57■□□□□ 0.56
UBP1-201ENST00000283628 RETNQ9HD89 108 aa18.57■□□□□ 0.56
UBP1-201ENST00000283628 F8WDY8 70 aa18.55■□□□□ 0.56
UBP1-201ENST00000283628 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
UBP1-201ENST00000283628 CMYA5Q8N3K9 4069 aa18.55■□□□□ 0.56
UBP1-201ENST00000283628 M0R2N4 97 aa18.54■□□□□ 0.56
UBP1-201ENST00000283628 Q6ZVQ6 151 aa18.53■□□□□ 0.56
UBP1-201ENST00000283628 CYSTM1Q9H1C7 97 aa18.53■□□□□ 0.56
UBP1-201ENST00000283628 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa18.53■□□□□ 0.56
UBP1-201ENST00000283628 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
UBP1-201ENST00000283628 TMEM258P61165 79 aa18.53■□□□□ 0.56
UBP1-201ENST00000283628 ESRGQ1W209 222 aa18.52■□□□□ 0.56
UBP1-201ENST00000283628 C1orf43Q9BWL3 253 aa18.52■□□□□ 0.56
UBP1-201ENST00000283628 BCE1O60756 84 aa18.51■□□□□ 0.55
UBP1-201ENST00000283628 LINC01556Q5JQF7 62 aa18.5■□□□□ 0.55
UBP1-201ENST00000283628 CXCL6P80162 114 aa18.49■□□□□ 0.55
UBP1-201ENST00000283628 J3KT08 172 aa18.48■□□□□ 0.55
UBP1-201ENST00000283628 LINC00528Q8N1L1 170 aa18.48■□□□□ 0.55
UBP1-201ENST00000283628 HAMPP81172 84 aa18.46■□□□□ 0.55
UBP1-201ENST00000283628 RPS28P62857 69 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
UBP1-201ENST00000283628 BAHCC1Q9P281 2608 aa18.43■□□□□ 0.54
UBP1-201ENST00000283628 Q6ZRP5 223 aa18.43■□□□□ 0.54
UBP1-201ENST00000283628 DNAH3Q8TD57 4116 aa18.42■□□□□ 0.54
UBP1-201ENST00000283628 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa18.42■□□□□ 0.54
UBP1-201ENST00000283628 SYCNQ0VAF6 134 aa18.41■□□□□ 0.54
UBP1-201ENST00000283628 STAB1Q9NY15 2570 aa18.4■□□□□ 0.54
UBP1-201ENST00000283628 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa18.4■□□□□ 0.54
UBP1-201ENST00000283628 TRAV7A0A075B6U4 112 aa18.36■□□□□ 0.53
UBP1-201ENST00000283628 C11orf45Q8TAV5 145 aa18.36■□□□□ 0.53
UBP1-201ENST00000283628 KCNQ1DNQ9H478 68 aa18.34■□□□□ 0.53
UBP1-201ENST00000283628 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa18.34■□□□□ 0.53
UBP1-201ENST00000283628 DNAH10OSP0CZ25 163 aa18.34■□□□□ 0.53
UBP1-201ENST00000283628 NKAPP1Q8N9T2 125 aa18.33■□□□□ 0.52
UBP1-201ENST00000283628 DPH3Q96FX2 82 aa18.33■□□□□ 0.52
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