RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 LY6G6DO95868 133 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRR-201ENST00000283228 ANGP03950 147 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
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PTPRR-201ENST00000283228 MXRA5Q9NR99 2828 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRR-201ENST00000283228 GYPEP15421 78 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRR-201ENST00000283228 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
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PTPRR-201ENST00000283228 C10orf25Q5T742 122 aa7.8□□□□□ -1.16
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PTPRR-201ENST00000283228 KRTAP10-9P60411 292 aa7.72□□□□□ -1.17
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PTPRR-201ENST00000283228 IGLV6-57P01721 117 aa7.68□□□□□ -1.18
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PTPRR-201ENST00000283228 hDV103S1A0JD37 113 aa7.66□□□□□ -1.18
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PTPRR-201ENST00000283228 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
PTPRR-201ENST00000283228 WFDC13Q8IUB5 93 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRR-201ENST00000283228 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRR-201ENST00000283228 A8MU10 97 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRR-201ENST00000283228 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
PTPRR-201ENST00000283228 TENM4Q6N022 2769 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRR-201ENST00000283228 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRR-201ENST00000283228 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
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