RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 C1orf43Q9BWL3 253 aa5.86□□□□□ -1.47
GINS1-201ENST00000262460 Q6ZTC4 211 aa5.86□□□□□ -1.47
GINS1-201ENST00000262460 A0A1B0GUV1 79 aa5.86□□□□□ -1.47
GINS1-201ENST00000262460 KRTAP10-11P60412 298 aa5.86□□□□□ -1.47
GINS1-201ENST00000262460 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.86□□□□□ -1.47
GINS1-201ENST00000262460 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
GINS1-201ENST00000262460 LINC01600Q96MT4 127 aa5.85□□□□□ -1.47
GINS1-201ENST00000262460 COL7A1Q02388 2944 aa5.84□□□□□ -1.47
GINS1-201ENST00000262460 SPART-AS1P0CW21 52 aa5.84□□□□□ -1.47
GINS1-201ENST00000262460 SMIM20Q8N5G0 67 aa5.84□□□□□ -1.47
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GINS1-201ENST00000262460 Q8N814 137 aa5.83□□□□□ -1.48
GINS1-201ENST00000262460 ORMDL1Q9P0S3 153 aa5.83□□□□□ -1.48
GINS1-201ENST00000262460 LYPD5Q6UWN5 251 aa5.83□□□□□ -1.48
GINS1-201ENST00000262460 MRAPQ8TCY5 172 aa5.83□□□□□ -1.48
GINS1-201ENST00000262460 C6orf48Q9UBA6 75 aa5.83□□□□□ -1.48
GINS1-201ENST00000262460 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa5.82□□□□□ -1.48
GINS1-201ENST00000262460 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
GINS1-201ENST00000262460 SCXQ7RTU7 201 aa5.82□□□□□ -1.48
GINS1-201ENST00000262460 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa5.82□□□□□ -1.48
GINS1-201ENST00000262460 LINC00643Q86TS7 51 aa5.82□□□□□ -1.48
GINS1-201ENST00000262460 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa5.82□□□□□ -1.48
GINS1-201ENST00000262460 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
GINS1-201ENST00000262460 CMYA5Q8N3K9 4069 aa5.81□□□□□ -1.48
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GINS1-201ENST00000262460 H0YGX0 51 aa5.81□□□□□ -1.48
GINS1-201ENST00000262460 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa5.81□□□□□ -1.48
GINS1-201ENST00000262460 DNAH10Q8IVF4 4471 aa5.81□□□□□ -1.48
GINS1-201ENST00000262460 INAFM2P0DMQ5 153 aa5.81□□□□□ -1.48
GINS1-201ENST00000262460 Q6ZQY7 126 aa5.81□□□□□ -1.48
GINS1-201ENST00000262460 A0A0J9YWU9 116 aa5.8□□□□□ -1.48
GINS1-201ENST00000262460 TMEM126AQ9H061 195 aa5.8□□□□□ -1.48
GINS1-201ENST00000262460 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa5.8□□□□□ -1.48
GINS1-201ENST00000262460 ESRGQ1W209 222 aa5.8□□□□□ -1.48
GINS1-201ENST00000262460 Q6Q795 121 aa5.8□□□□□ -1.48
GINS1-201ENST00000262460 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa5.79□□□□□ -1.48
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GINS1-201ENST00000262460 hADV29S1A0JD25 119 aa5.79□□□□□ -1.48
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GINS1-201ENST00000262460 CASC10Q5T4H9 136 aa5.79□□□□□ -1.48
GINS1-201ENST00000262460 C9orf153Q5TBE3 101 aa5.79□□□□□ -1.48
GINS1-201ENST00000262460 Q6ZRU5 148 aa5.79□□□□□ -1.48
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GINS1-201ENST00000262460 A0A1B0GX51 115 aa5.78□□□□□ -1.48
GINS1-201ENST00000262460 CAMK2N2Q96S95 79 aa5.78□□□□□ -1.48
GINS1-201ENST00000262460 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
GINS1-201ENST00000262460 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa5.78□□□□□ -1.48
GINS1-201ENST00000262460 ACYP1P07311 99 aa5.78□□□□□ -1.48
GINS1-201ENST00000262460 DEFB105AQ8NG35 78 aa5.78□□□□□ -1.48
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GINS1-201ENST00000262460 Q8N9L7 120 aa5.75□□□□□ -1.49
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GINS1-201ENST00000262460 C15orf56Q8N910 161 aa5.74□□□□□ -1.49
GINS1-201ENST00000262460 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa5.74□□□□□ -1.49
GINS1-201ENST00000262460 A0A0G2JQZ4 141 aa5.73□□□□□ -1.49
GINS1-201ENST00000262460 A0A1W2PNN7 141 aa5.73□□□□□ -1.49
GINS1-201ENST00000262460 USP17L23D6RBM5 183 aa5.73□□□□□ -1.49
GINS1-201ENST00000262460 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa5.73□□□□□ -1.49
GINS1-201ENST00000262460 COX17Q14061 63 aa5.73□□□□□ -1.49
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GINS1-201ENST00000262460 C2orf48Q96LS8 159 aa5.73□□□□□ -1.49
GINS1-201ENST00000262460 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
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GINS1-201ENST00000262460 IGLV6-57P01721 117 aa5.72□□□□□ -1.49
GINS1-201ENST00000262460 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa5.72□□□□□ -1.49
GINS1-201ENST00000262460 DNAH7Q8WXX0 4024 aa5.72□□□□□ -1.49
GINS1-201ENST00000262460 PPDPFQ9H3Y8 114 aa5.72□□□□□ -1.49
GINS1-201ENST00000262460 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa5.71□□□□□ -1.49
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GINS1-201ENST00000262460 F8WDY8 70 aa5.7□□□□□ -1.5
GINS1-201ENST00000262460 C3orf84H3BNL1 204 aa5.7□□□□□ -1.5
GINS1-201ENST00000262460 VPREB1P12018 145 aa5.7□□□□□ -1.5
GINS1-201ENST00000262460 Q6ZQT0 140 aa5.7□□□□□ -1.5
GINS1-201ENST00000262460 IMUPQ9GZP8 106 aa5.7□□□□□ -1.5
GINS1-201ENST00000262460 TRAV10A0A0B4J240 114 aa5.7□□□□□ -1.5
GINS1-201ENST00000262460 GHRHP01286 108 aa5.7□□□□□ -1.5
GINS1-201ENST00000262460 Q6JHZ5 121 aa5.7□□□□□ -1.5
GINS1-201ENST00000262460 LINC00167Q96N53 147 aa5.7□□□□□ -1.5
GINS1-201ENST00000262460 DSCR8Q96T75 97 aa5.7□□□□□ -1.5
GINS1-201ENST00000262460 UPK3BQ9BT76 320 aa5.7□□□□□ -1.5
GINS1-201ENST00000262460 COX7CP15954 63 aa5.69□□□□□ -1.5
GINS1-201ENST00000262460 COX7BP24311 80 aa5.69□□□□□ -1.5
GINS1-201ENST00000262460 UQCRQO14949 82 aa5.69□□□□□ -1.5
GINS1-201ENST00000262460 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa5.68□□□□□ -1.5
GINS1-201ENST00000262460 UBL5Q9BZL1 73 aa5.68□□□□□ -1.5
GINS1-201ENST00000262460 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
GINS1-201ENST00000262460 Q6ZVQ6 151 aa5.68□□□□□ -1.5
GINS1-201ENST00000262460 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa5.68□□□□□ -1.5
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