RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258341.4

LAMC1-201, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LAMC1, Length 7,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-201ENST00000258341 Q6ZSN1 163 aa11.62□□□□□ -0.55
LAMC1-201ENST00000258341 TSPEAR-AS2P59090 65 aa11.62□□□□□ -0.55
LAMC1-201ENST00000258341 UTRNP46939 3433 aa11.62□□□□□ -0.55
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF580Q9UK33 172 aa11.61□□□□□ -0.55
LAMC1-201ENST00000258341 Q8N2B8 174 aa11.61□□□□□ -0.55
LAMC1-201ENST00000258341 MDFIQ99750 246 aa11.61□□□□□ -0.55
LAMC1-201ENST00000258341 USP24Q9UPU5 2620 aa11.6□□□□□ -0.55
LAMC1-201ENST00000258341 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa11.6□□□□□ -0.55
LAMC1-201ENST00000258341 KIAA0087Q14695 138 aa11.6□□□□□ -0.55
LAMC1-201ENST00000258341 AMELXQ99217 191 aa11.59□□□□□ -0.55
LAMC1-201ENST00000258341 LINC00313P59037 77 aa11.59□□□□□ -0.55
LAMC1-201ENST00000258341 CXCL6P80162 114 aa11.59□□□□□ -0.55
LAMC1-201ENST00000258341 CHTF8P0CG12 524 aa11.59□□□□□ -0.55
LAMC1-201ENST00000258341 TMEM254Q8TBM7 123 aa11.59□□□□□ -0.55
LAMC1-201ENST00000258341 DNAH12Q6ZR08 3092 aa11.58□□□□□ -0.55
LAMC1-201ENST00000258341 TYMSOSQ8TAI1 123 aa11.58□□□□□ -0.56
LAMC1-201ENST00000258341 COX6B2Q6YFQ2 88 aa11.57□□□□□ -0.56
LAMC1-201ENST00000258341 SPINT4Q6UDR6 99 aa11.56□□□□□ -0.56
LAMC1-201ENST00000258341 SMIM29Q86T20 159 aa11.56□□□□□ -0.56
LAMC1-201ENST00000258341 C6orf48Q9UBA6 75 aa11.56□□□□□ -0.56
LAMC1-201ENST00000258341 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa11.55□□□□□ -0.56
LAMC1-201ENST00000258341 LINC01561Q8N1V8 128 aa11.55□□□□□ -0.56
LAMC1-201ENST00000258341 LINC00846Q9NV44 126 aa11.53□□□□□ -0.56
LAMC1-201ENST00000258341 POLQO75417 2590 aa11.51□□□□□ -0.57
LAMC1-201ENST00000258341 MTORP42345 2549 aa11.49□□□□□ -0.57
LAMC1-201ENST00000258341 Q96NJ1 140 aa11.46□□□□□ -0.57
LAMC1-201ENST00000258341 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
LAMC1-201ENST00000258341 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa11.46□□□□□ -0.58
LAMC1-201ENST00000258341 LINC00167Q96N53 147 aa11.46□□□□□ -0.58
LAMC1-201ENST00000258341 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
LAMC1-201ENST00000258341 SPATA3Q8NHX4 192 aa11.44□□□□□ -0.58
LAMC1-201ENST00000258341 RTL8CO15255 209 aa11.42□□□□□ -0.58
LAMC1-201ENST00000258341 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa11.42□□□□□ -0.58
LAMC1-201ENST00000258341 CHD8Q9HCK8 2581 aa11.42□□□□□ -0.58
LAMC1-201ENST00000258341 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa11.41□□□□□ -0.58
LAMC1-201ENST00000258341 Q6ZRP5 223 aa11.4□□□□□ -0.58
LAMC1-201ENST00000258341 TRAV22A0A0B4J277 110 aa11.39□□□□□ -0.59
LAMC1-201ENST00000258341 C5orf42Q9H799 3197 aa11.38□□□□□ -0.59
LAMC1-201ENST00000258341 PRO3102Q9H379 93 aa11.38□□□□□ -0.59
LAMC1-201ENST00000258341 LINC00476Q8WZB0 136 aa11.38□□□□□ -0.59
LAMC1-201ENST00000258341 C8orf87E5RJ46 101 aa11.37□□□□□ -0.59
LAMC1-201ENST00000258341 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa11.37□□□□□ -0.59
LAMC1-201ENST00000258341 LINC00315P59091 139 aa11.36□□□□□ -0.59
LAMC1-201ENST00000258341 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
LAMC1-201ENST00000258341 EPM2AB3EWF7 344 aa11.35□□□□□ -0.59
LAMC1-201ENST00000258341 Q8NBF4 154 aa11.35□□□□□ -0.59
LAMC1-201ENST00000258341 FASNP49327 2511 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
LAMC1-201ENST00000258341 CEP350Q5VT06 3117 aa11.34□□□□□ -0.59
LAMC1-201ENST00000258341 COL4A2P08572 1712 aa11.34□□□□□ -0.59
LAMC1-201ENST00000258341 LINC00310P59036 64 aa11.34□□□□□ -0.59
LAMC1-201ENST00000258341 A0A1W2PPR1 153 aa11.34□□□□□ -0.59
LAMC1-201ENST00000258341 COX8CQ7Z4L0 72 aa11.33□□□□□ -0.6
LAMC1-201ENST00000258341 C11orf72Q8NBR9 251 aa11.3□□□□□ -0.6
LAMC1-201ENST00000258341 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa11.29□□□□□ -0.6
LAMC1-201ENST00000258341 VPREB1P12018 145 aa11.29□□□□□ -0.6
LAMC1-201ENST00000258341 APLNQ9ULZ1 77 aa11.29□□□□□ -0.6
LAMC1-201ENST00000258341 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
LAMC1-201ENST00000258341 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa11.28□□□□□ -0.6
LAMC1-201ENST00000258341 Q6ZRX8 168 aa11.28□□□□□ -0.6
LAMC1-201ENST00000258341 C4orf26Q17RF5 130 aa11.28□□□□□ -0.6
LAMC1-201ENST00000258341 A0A096LNJ9 63 aa11.27□□□□□ -0.61
LAMC1-201ENST00000258341 BCE1O60756 84 aa11.26□□□□□ -0.61
LAMC1-201ENST00000258341 PRO0628Q9UI54 55 aa11.26□□□□□ -0.61
LAMC1-201ENST00000258341 CDIP1Q9H305 208 aa11.25□□□□□ -0.61
LAMC1-201ENST00000258341 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa11.24□□□□□ -0.61
LAMC1-201ENST00000258341 H3BPC8 53 aa11.24□□□□□ -0.61
LAMC1-201ENST00000258341 PCNTO95613 3336 aa11.24□□□□□ -0.61
LAMC1-201ENST00000258341 A0A1B0GW54 56 aa11.24□□□□□ -0.61
LAMC1-201ENST00000258341 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa11.24□□□□□ -0.61
LAMC1-201ENST00000258341 H3BNG1 76 aa11.23□□□□□ -0.61
LAMC1-201ENST00000258341 Q6ZQT0 140 aa11.23□□□□□ -0.61
LAMC1-201ENST00000258341 CRIPTQ9P021 101 aa11.22□□□□□ -0.61
LAMC1-201ENST00000258341 LINC01600Q96MT4 127 aa11.22□□□□□ -0.61
LAMC1-201ENST00000258341 LINC00588Q9Y4M8 146 aa11.21□□□□□ -0.61
LAMC1-201ENST00000258341 C9orf92A6NGG3 77 aa11.2□□□□□ -0.62
LAMC1-201ENST00000258341 FAM168BA1KXE4 195 aa11.2□□□□□ -0.62
LAMC1-201ENST00000258341 TM2D3Q9BRN9 247 aa11.2□□□□□ -0.62
LAMC1-201ENST00000258341 FAM218AQ96MZ4 157 aa11.19□□□□□ -0.62
LAMC1-201ENST00000258341 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
LAMC1-201ENST00000258341 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa11.19□□□□□ -0.62
LAMC1-201ENST00000258341 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa11.16□□□□□ -0.62
LAMC1-201ENST00000258341 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa11.16□□□□□ -0.62
LAMC1-201ENST00000258341 A8MWP4 228 aa11.16□□□□□ -0.62
LAMC1-201ENST00000258341 LINC01554Q52M75 96 aa11.16□□□□□ -0.62
LAMC1-201ENST00000258341 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa11.15□□□□□ -0.62
LAMC1-201ENST00000258341 LINC01546A6NGU7 62 aa11.15□□□□□ -0.63
LAMC1-201ENST00000258341 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
LAMC1-201ENST00000258341 XIRP2A4UGR9 3374 aa11.13□□□□□ -0.63
LAMC1-201ENST00000258341 IGLV6-57P01721 117 aa11.13□□□□□ -0.63
LAMC1-201ENST00000258341 FAM19A4Q96LR4 140 aa11.13□□□□□ -0.63
LAMC1-201ENST00000258341 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
LAMC1-201ENST00000258341 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa11.12□□□□□ -0.63
LAMC1-201ENST00000258341 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa11.12□□□□□ -0.63
LAMC1-201ENST00000258341 Q8NAQ8 132 aa11.11□□□□□ -0.63
LAMC1-201ENST00000258341 UQCR11O14957 56 aa11.11□□□□□ -0.63
LAMC1-201ENST00000258341 LINC00304Q8N9R0 145 aa11.11□□□□□ -0.63
LAMC1-201ENST00000258341 COA5Q86WW8 74 aa11.1□□□□□ -0.63
LAMC1-201ENST00000258341 DNAH10OSP0CZ25 163 aa11.1□□□□□ -0.63
LAMC1-201ENST00000258341 K7EQZ3 153 aa11.09□□□□□ -0.63
LAMC1-201ENST00000258341 DSCR10P59022 87 aa11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 159.6 ms