RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258243.6

URB2-201, Transcript of URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene URB2, Length 5,613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URB2-201ENST00000258243 A0A1B0GUV1 79 aa7.64□□□□□ -1.19
URB2-201ENST00000258243 C2orf48Q96LS8 159 aa7.64□□□□□ -1.19
URB2-201ENST00000258243 LINC00846Q9NV44 126 aa7.63□□□□□ -1.19
URB2-201ENST00000258243 Q6ZSN1 163 aa7.63□□□□□ -1.19
URB2-201ENST00000258243 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.63□□□□□ -1.19
URB2-201ENST00000258243 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
URB2-201ENST00000258243 SMIM29Q86T20 159 aa7.63□□□□□ -1.19
URB2-201ENST00000258243 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.62□□□□□ -1.19
URB2-201ENST00000258243 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
URB2-201ENST00000258243 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.61□□□□□ -1.19
URB2-201ENST00000258243 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
URB2-201ENST00000258243 ZNF462Q96JM2 2506 aa7.6□□□□□ -1.19
URB2-201ENST00000258243 A8MUN3 132 aa7.6□□□□□ -1.19
URB2-201ENST00000258243 A0A087WSZ3 146 aa7.6□□□□□ -1.19
URB2-201ENST00000258243 LINC01600Q96MT4 127 aa7.59□□□□□ -1.19
URB2-201ENST00000258243 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa7.59□□□□□ -1.19
URB2-201ENST00000258243 IGKV2-30P06310 120 aa7.59□□□□□ -1.19
URB2-201ENST00000258243 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa7.59□□□□□ -1.19
URB2-201ENST00000258243 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa7.59□□□□□ -1.19
URB2-201ENST00000258243 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa7.59□□□□□ -1.19
URB2-201ENST00000258243 C11orf72Q8NBR9 251 aa7.58□□□□□ -1.2
URB2-201ENST00000258243 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
URB2-201ENST00000258243 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.58□□□□□ -1.2
URB2-201ENST00000258243 JMJD1CQ15652 2540 aa7.57□□□□□ -1.2
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URB2-201ENST00000258243 H3BNG1 76 aa7.57□□□□□ -1.2
URB2-201ENST00000258243 MYO9AB2RTY4 2548 aa7.57□□□□□ -1.2
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URB2-201ENST00000258243 LRRK2Q5S007 2527 aa7.56□□□□□ -1.2
URB2-201ENST00000258243 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.56□□□□□ -1.2
URB2-201ENST00000258243 A0A1B0GW54 56 aa7.55□□□□□ -1.2
URB2-201ENST00000258243 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.55□□□□□ -1.2
URB2-201ENST00000258243 Q6ZRU5 148 aa7.55□□□□□ -1.2
URB2-201ENST00000258243 PRR15Q8IV56 129 aa7.55□□□□□ -1.2
URB2-201ENST00000258243 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.54□□□□□ -1.2
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URB2-201ENST00000258243 FAM229AH3BQW9 127 aa7.54□□□□□ -1.2
URB2-201ENST00000258243 DEFB116Q30KQ4 102 aa7.54□□□□□ -1.2
URB2-201ENST00000258243 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.54□□□□□ -1.2
URB2-201ENST00000258243 TM2D3Q9BRN9 247 aa7.54□□□□□ -1.2
URB2-201ENST00000258243 CHD8Q9HCK8 2581 aa7.54□□□□□ -1.2
URB2-201ENST00000258243 LINC00315P59091 139 aa7.53□□□□□ -1.2
URB2-201ENST00000258243 SPTBN4Q9H254 2564 aa7.53□□□□□ -1.2
URB2-201ENST00000258243 ABCA12Q86UK0 2595 aa7.52□□□□□ -1.2
URB2-201ENST00000258243 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa7.52□□□□□ -1.21
URB2-201ENST00000258243 WIPF1O43516 503 aa7.52□□□□□ -1.21
URB2-201ENST00000258243 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa7.51□□□□□ -1.21
URB2-201ENST00000258243 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.51□□□□□ -1.21
URB2-201ENST00000258243 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.51□□□□□ -1.21
URB2-201ENST00000258243 C16orf90A8MZG2 172 aa7.51□□□□□ -1.21
URB2-201ENST00000258243 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
URB2-201ENST00000258243 COA5Q86WW8 74 aa7.51□□□□□ -1.21
URB2-201ENST00000258243 PCSK5Q92824 1860 aa7.5□□□□□ -1.21
URB2-201ENST00000258243 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.5□□□□□ -1.21
URB2-201ENST00000258243 Q8NAQ8 132 aa7.5□□□□□ -1.21
URB2-201ENST00000258243 C22orf24Q9Y442 160 aa7.49□□□□□ -1.21
URB2-201ENST00000258243 APLNQ9ULZ1 77 aa7.49□□□□□ -1.21
URB2-201ENST00000258243 RTL8CO15255 209 aa7.48□□□□□ -1.21
URB2-201ENST00000258243 A0A096LNT2 108 aa7.48□□□□□ -1.21
URB2-201ENST00000258243 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.47□□□□□ -1.21
URB2-201ENST00000258243 EPM2AB3EWF7 344 aa7.47□□□□□ -1.21
URB2-201ENST00000258243 A8MTW9 85 aa7.46□□□□□ -1.21
URB2-201ENST00000258243 K7EIL1 84 aa7.46□□□□□ -1.21
URB2-201ENST00000258243 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.46□□□□□ -1.21
URB2-201ENST00000258243 KRTAP10-11P60412 298 aa7.45□□□□□ -1.22
URB2-201ENST00000258243 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.45□□□□□ -1.22
URB2-201ENST00000258243 PCNTO95613 3336 aa7.44□□□□□ -1.22
URB2-201ENST00000258243 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.44□□□□□ -1.22
URB2-201ENST00000258243 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
URB2-201ENST00000258243 KLK9Q2XQG4 91 aa7.43□□□□□ -1.22
URB2-201ENST00000258243 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
URB2-201ENST00000258243 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.42□□□□□ -1.22
URB2-201ENST00000258243 FN1P02751 2386 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
URB2-201ENST00000258243 PKD1L2Q7Z442 2459 aa7.42□□□□□ -1.22
URB2-201ENST00000258243 FASNP49327 2511 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
URB2-201ENST00000258243 TLN2Q9Y4G6 2542 aa7.41□□□□□ -1.22
URB2-201ENST00000258243 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.4□□□□□ -1.22
URB2-201ENST00000258243 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.4□□□□□ -1.22
URB2-201ENST00000258243 KRTAP10-3P60369 221 aa7.4□□□□□ -1.22
URB2-201ENST00000258243 Q6ZRP5 223 aa7.4□□□□□ -1.23
URB2-201ENST00000258243 LITAFQ99732 161 aa7.4□□□□□ -1.23
URB2-201ENST00000258243 C19orf73Q9NVV2 129 aa7.4□□□□□ -1.23
URB2-201ENST00000258243 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa7.39□□□□□ -1.23
URB2-201ENST00000258243 J3QL48 77 aa7.39□□□□□ -1.23
URB2-201ENST00000258243 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.39□□□□□ -1.23
URB2-201ENST00000258243 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.39□□□□□ -1.23
URB2-201ENST00000258243 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.39□□□□□ -1.23
URB2-201ENST00000258243 LINC00167Q96N53 147 aa7.39□□□□□ -1.23
URB2-201ENST00000258243 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.37□□□□□ -1.23
URB2-201ENST00000258243 Q1T7F1 81 aa7.37□□□□□ -1.23
URB2-201ENST00000258243 LINC00483Q53H64 154 aa7.37□□□□□ -1.23
URB2-201ENST00000258243 CEP350Q5VT06 3117 aa7.37□□□□□ -1.23
URB2-201ENST00000258243 MOBPQ13875 183 aa7.36□□□□□ -1.23
URB2-201ENST00000258243 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
URB2-201ENST00000258243 Q6ZQT0 140 aa7.36□□□□□ -1.23
URB2-201ENST00000258243 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
URB2-201ENST00000258243 DNAH12Q6ZR08 3092 aa7.35□□□□□ -1.23
URB2-201ENST00000258243 KIAA0087Q14695 138 aa7.35□□□□□ -1.23
URB2-201ENST00000258243 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.35□□□□□ -1.23
URB2-201ENST00000258243 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
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