RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 POLEQ07864 2286 aa4.84□□□□□ -1.63
CPS1-201ENST00000233072 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa4.83□□□□□ -1.64
CPS1-201ENST00000233072 C19orf73Q9NVV2 129 aa4.83□□□□□ -1.64
CPS1-201ENST00000233072 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CPS1-201ENST00000233072 NCOR1O75376 2440 aa4.83□□□□□ -1.64
CPS1-201ENST00000233072 GPR179Q6PRD1 2367 aa4.82□□□□□ -1.64
CPS1-201ENST00000233072 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.82□□□□□ -1.64
CPS1-201ENST00000233072 LINC00612Q8N6U2 182 aa4.82□□□□□ -1.64
CPS1-201ENST00000233072 TM2D3Q9BRN9 247 aa4.82□□□□□ -1.64
CPS1-201ENST00000233072 PCSK5Q92824 1860 aa4.82□□□□□ -1.64
CPS1-201ENST00000233072 HIVEP2P31629 2446 aa4.82□□□□□ -1.64
CPS1-201ENST00000233072 CHTF8P0CG12 524 aa4.82□□□□□ -1.64
CPS1-201ENST00000233072 LINC01600Q96MT4 127 aa4.82□□□□□ -1.64
CPS1-201ENST00000233072 PRR34Q9NV39 138 aa4.82□□□□□ -1.64
CPS1-201ENST00000233072 A8MUN3 132 aa4.81□□□□□ -1.64
CPS1-201ENST00000233072 LINC00528Q8N1L1 170 aa4.81□□□□□ -1.64
CPS1-201ENST00000233072 PRR14LQ5THK1 2151 aa4.81□□□□□ -1.64
CPS1-201ENST00000233072 KLKP1Q107X0 134 aa4.81□□□□□ -1.64
CPS1-201ENST00000233072 AKAP6Q13023 2319 aa4.81□□□□□ -1.64
CPS1-201ENST00000233072 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
CPS1-201ENST00000233072 PRR15Q8IV56 129 aa4.8□□□□□ -1.64
CPS1-201ENST00000233072 C8orf17Q9NRJ1 99 aa4.8□□□□□ -1.64
CPS1-201ENST00000233072 A0A1B0GVX0 72 aa4.79□□□□□ -1.64
CPS1-201ENST00000233072 LINC00336Q6ZUF6 198 aa4.79□□□□□ -1.64
CPS1-201ENST00000233072 LINC00304Q8N9R0 145 aa4.79□□□□□ -1.64
CPS1-201ENST00000233072 WIPF1O43516 503 aa4.79□□□□□ -1.64
CPS1-201ENST00000233072 K7EQZ3 153 aa4.78□□□□□ -1.64
CPS1-201ENST00000233072 ROS1P08922 2347 aa4.78□□□□□ -1.64
CPS1-201ENST00000233072 ZNF861PO60384 105 aa4.78□□□□□ -1.64
CPS1-201ENST00000233072 IGFL1Q6UW32 110 aa4.78□□□□□ -1.64
CPS1-201ENST00000233072 C15orf56Q8N910 161 aa4.78□□□□□ -1.64
CPS1-201ENST00000233072 J3QL48 77 aa4.78□□□□□ -1.64
CPS1-201ENST00000233072 DSCAML1Q8TD84 2053 aa4.77□□□□□ -1.65
CPS1-201ENST00000233072 FAM168BA1KXE4 195 aa4.77□□□□□ -1.65
CPS1-201ENST00000233072 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa4.76□□□□□ -1.65
CPS1-201ENST00000233072 KRTAP10-11P60412 298 aa4.76□□□□□ -1.65
CPS1-201ENST00000233072 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.76□□□□□ -1.65
CPS1-201ENST00000233072 A0A096LNT2 108 aa4.76□□□□□ -1.65
CPS1-201ENST00000233072 CNBPP62633 177 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CPS1-201ENST00000233072 AGRNO00468 2067 aa4.76□□□□□ -1.65
CPS1-201ENST00000233072 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa4.75□□□□□ -1.65
CPS1-201ENST00000233072 K7EIL1 84 aa4.75□□□□□ -1.65
CPS1-201ENST00000233072 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa4.74□□□□□ -1.65
CPS1-201ENST00000233072 A0A087WTM6 91 aa4.74□□□□□ -1.65
CPS1-201ENST00000233072 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CPS1-201ENST00000233072 DSCR10P59022 87 aa4.74□□□□□ -1.65
CPS1-201ENST00000233072 LUZP6Q538Z0 58 aa4.74□□□□□ -1.65
CPS1-201ENST00000233072 LINC01554Q52M75 96 aa4.73□□□□□ -1.65
CPS1-201ENST00000233072 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CPS1-201ENST00000233072 IGLV7-43P04211 117 aa4.73□□□□□ -1.65
CPS1-201ENST00000233072 ABCA1O95477 2261 aa4.73□□□□□ -1.65
CPS1-201ENST00000233072 C9orf163Q8N9P6 203 aa4.73□□□□□ -1.65
CPS1-201ENST00000233072 Q8N377 158 aa4.72□□□□□ -1.65
CPS1-201ENST00000233072 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa4.72□□□□□ -1.65
CPS1-201ENST00000233072 APLNQ9ULZ1 77 aa4.71□□□□□ -1.66
CPS1-201ENST00000233072 H7BZZ5 65 aa4.71□□□□□ -1.66
CPS1-201ENST00000233072 COX6B2Q6YFQ2 88 aa4.71□□□□□ -1.66
CPS1-201ENST00000233072 SPRR4Q96PI1 79 aa4.71□□□□□ -1.66
CPS1-201ENST00000233072 TNCP24821 2201 aa4.7□□□□□ -1.66
CPS1-201ENST00000233072 PCNX1Q96RV3 2341 aa4.7□□□□□ -1.66
CPS1-201ENST00000233072 ZNF575Q86XF7 245 aa4.7□□□□□ -1.66
CPS1-201ENST00000233072 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CPS1-201ENST00000233072 Q1T7F1 81 aa4.7□□□□□ -1.66
CPS1-201ENST00000233072 KRTAP10-3P60369 221 aa4.69□□□□□ -1.66
CPS1-201ENST00000233072 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP4.69□□□□□ -1.662e-7■■■■■ 28.7
CPS1-201ENST00000233072 FAM104AQ969W3 186 aa4.69□□□□□ -1.66
CPS1-201ENST00000233072 SPTBN2O15020 2390 aa4.69□□□□□ -1.66
CPS1-201ENST00000233072 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa4.68□□□□□ -1.66
CPS1-201ENST00000233072 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
CPS1-201ENST00000233072 MUC6Q6W4X9 2439 aa4.68□□□□□ -1.66
CPS1-201ENST00000233072 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa4.68□□□□□ -1.66
CPS1-201ENST00000233072 CACNA1HO95180 2353 aa4.67□□□□□ -1.66
CPS1-201ENST00000233072 PLCE1Q9P212 2302 aa4.67□□□□□ -1.66
CPS1-201ENST00000233072 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
CPS1-201ENST00000233072 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
CPS1-201ENST00000233072 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.66
CPS1-201ENST00000233072 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa4.65□□□□□ -1.66
CPS1-201ENST00000233072 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa4.65□□□□□ -1.67
CPS1-201ENST00000233072 A0A0A0MQY5 61 aa4.64□□□□□ -1.67
CPS1-201ENST00000233072 PLXNB1O43157 2135 aa4.64□□□□□ -1.67
CPS1-201ENST00000233072 C9orf92A6NGG3 77 aa4.64□□□□□ -1.67
CPS1-201ENST00000233072 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa4.64□□□□□ -1.67
CPS1-201ENST00000233072 CACNA1GO43497 2377 aa4.64□□□□□ -1.67
CPS1-201ENST00000233072 A0A1W2PNN7 141 aa4.64□□□□□ -1.67
CPS1-201ENST00000233072 LINC00483Q53H64 154 aa4.64□□□□□ -1.67
CPS1-201ENST00000233072 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa4.63□□□□□ -1.67
CPS1-201ENST00000233072 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa4.63□□□□□ -1.67
CPS1-201ENST00000233072 NAV3Q8IVL0 2385 aa4.63□□□□□ -1.67
CPS1-201ENST00000233072 Q75L30 129 aa4.63□□□□□ -1.67
CPS1-201ENST00000233072 FAM229BQ4G0N7 80 aa4.63□□□□□ -1.67
CPS1-201ENST00000233072 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa4.63□□□□□ -1.67
CPS1-201ENST00000233072 A0A1W2PNM2 257 aa4.61□□□□□ -1.67
CPS1-201ENST00000233072 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa4.61□□□□□ -1.67
CPS1-201ENST00000233072 H3BS24 57 aa4.61□□□□□ -1.67
CPS1-201ENST00000233072 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
CPS1-201ENST00000233072 DMAC1Q96GE9 116 aa4.6□□□□□ -1.67
CPS1-201ENST00000233072 KRTAP1-1Q07627 177 aa4.59□□□□□ -1.67
CPS1-201ENST00000233072 FAM208BQ5VWN6 2430 aa4.57□□□□□ -1.68
CPS1-201ENST00000233072 CASC10Q5T4H9 136 aa4.56□□□□□ -1.68
CPS1-201ENST00000233072 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 420.4 ms