RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641642.1

CASC19-247, Transcript of cancer susceptibility 19, humanhuman

Gene CASC19, Length 1,107 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC19-247ENST00000641642 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.81□□□□□ -1.32
CASC19-247ENST00000641642 TMEM223A0PJW6 202 aa6.81□□□□□ -1.32
CASC19-247ENST00000641642 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.81□□□□□ -1.32
CASC19-247ENST00000641642 RTL8CO15255 209 aa6.81□□□□□ -1.32
CASC19-247ENST00000641642 CXCL5P42830 114 aa6.81□□□□□ -1.32
CASC19-247ENST00000641642 Q8IZM0 81 aa6.81□□□□□ -1.32
CASC19-247ENST00000641642 A0A087WTM6 91 aa6.8□□□□□ -1.32
CASC19-247ENST00000641642 USP17L23D6RBM5 183 aa6.8□□□□□ -1.32
CASC19-247ENST00000641642 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.8□□□□□ -1.32
CASC19-247ENST00000641642 SCGB1D1O95968 90 aa6.8□□□□□ -1.32
CASC19-247ENST00000641642 C2orf48Q96LS8 159 aa6.8□□□□□ -1.32
CASC19-247ENST00000641642 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.8□□□□□ -1.32
CASC19-247ENST00000641642 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-247ENST00000641642 E9PLD3 99 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-247ENST00000641642 PRSS2P07478 247 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-247ENST00000641642 C15orf56Q8N910 161 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-247ENST00000641642 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CASC19-247ENST00000641642 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-247ENST00000641642 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.79□□□□□ -1.32
CASC19-247ENST00000641642 SPINK8P0C7L1 97 aa6.78□□□□□ -1.32
CASC19-247ENST00000641642 SPAG11BQ08648 103 aa6.78□□□□□ -1.32
CASC19-247ENST00000641642 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.78□□□□□ -1.32
CASC19-247ENST00000641642 Q8N814 137 aa6.78□□□□□ -1.32
CASC19-247ENST00000641642 COX7B2Q8TF08 81 aa6.78□□□□□ -1.32
CASC19-247ENST00000641642 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CASC19-247ENST00000641642 hDV102S1A0JD36 115 aa6.77□□□□□ -1.33
CASC19-247ENST00000641642 LEPROTO15243 131 aa6.77□□□□□ -1.33
CASC19-247ENST00000641642 NMUP48645 174 aa6.77□□□□□ -1.33
CASC19-247ENST00000641642 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CASC19-247ENST00000641642 KIAA0087Q14695 138 aa6.77□□□□□ -1.33
CASC19-247ENST00000641642 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.77□□□□□ -1.33
CASC19-247ENST00000641642 NDUFA1O15239 70 aa6.76□□□□□ -1.33
CASC19-247ENST00000641642 CKS1BP61024 79 aa6.76□□□□□ -1.33
CASC19-247ENST00000641642 RNF151Q2KHN1 245 aa6.76□□□□□ -1.33
CASC19-247ENST00000641642 PYY3Q5JQD4 70 aa6.76□□□□□ -1.33
CASC19-247ENST00000641642 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.75□□□□□ -1.33
CASC19-247ENST00000641642 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.75□□□□□ -1.33
CASC19-247ENST00000641642 LINC00587B1AMM8 73 aa6.75□□□□□ -1.33
CASC19-247ENST00000641642 J3QQQ9 107 aa6.75□□□□□ -1.33
CASC19-247ENST00000641642 HERV-K104P63124 156 aa6.75□□□□□ -1.33
CASC19-247ENST00000641642 STPG4Q8N801 248 aa6.75□□□□□ -1.33
CASC19-247ENST00000641642 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.75□□□□□ -1.33
CASC19-247ENST00000641642 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.75□□□□□ -1.33
CASC19-247ENST00000641642 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CASC19-247ENST00000641642 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.74□□□□□ -1.33
CASC19-247ENST00000641642 LECT2O14960 151 aa6.74□□□□□ -1.33
CASC19-247ENST00000641642 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CASC19-247ENST00000641642 SYCNQ0VAF6 134 aa6.74□□□□□ -1.33
CASC19-247ENST00000641642 WFDC2Q14508 124 aa6.74□□□□□ -1.33
CASC19-247ENST00000641642 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.74□□□□□ -1.33
CASC19-247ENST00000641642 ATOH7Q8N100 152 aa6.74□□□□□ -1.33
CASC19-247ENST00000641642 CDIP1Q9H305 208 aa6.74□□□□□ -1.33
CASC19-247ENST00000641642 SMIM6P0DI80 62 aa6.73□□□□□ -1.33
CASC19-247ENST00000641642 S100A12P80511 92 aa6.73□□□□□ -1.33
CASC19-247ENST00000641642 COX17Q14061 63 aa6.73□□□□□ -1.33
CASC19-247ENST00000641642 CARD19Q96LW7 228 aa6.73□□□□□ -1.33
CASC19-247ENST00000641642 VAMP8Q9BV40 100 aa6.73□□□□□ -1.33
CASC19-247ENST00000641642 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.72□□□□□ -1.33
CASC19-247ENST00000641642 DNAH2Q9P225 4427 aa6.72□□□□□ -1.33
CASC19-247ENST00000641642 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.72□□□□□ -1.33
CASC19-247ENST00000641642 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CASC19-247ENST00000641642 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.72□□□□□ -1.33
CASC19-247ENST00000641642 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.72□□□□□ -1.33
CASC19-247ENST00000641642 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.71□□□□□ -1.34
CASC19-247ENST00000641642 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-247ENST00000641642 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CASC19-247ENST00000641642 DLEU1O43261 78 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-247ENST00000641642 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-247ENST00000641642 Q6ZRU5 148 aa6.7□□□□□ -1.34
CASC19-247ENST00000641642 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-247ENST00000641642 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-247ENST00000641642 A0A1B0GVY2 172 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-247ENST00000641642 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-247ENST00000641642 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CASC19-247ENST00000641642 SPATA45Q537H7 98 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-247ENST00000641642 C2orf82Q6UX34 121 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-247ENST00000641642 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-247ENST00000641642 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.69□□□□□ -1.34
CASC19-247ENST00000641642 RYR2Q92736 4967 aa6.68□□□□□ -1.34
CASC19-247ENST00000641642 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.68□□□□□ -1.34
CASC19-247ENST00000641642 ZNF815PA8K554 130 aa6.68□□□□□ -1.34
CASC19-247ENST00000641642 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.68□□□□□ -1.34
CASC19-247ENST00000641642 TIMM17BO60830 172 aa6.68□□□□□ -1.34
CASC19-247ENST00000641642 COX8AP10176 69 aa6.68□□□□□ -1.34
CASC19-247ENST00000641642 GCSHP23434 173 aa6.68□□□□□ -1.34
CASC19-247ENST00000641642 MAJINQ3KP22 176 aa6.68□□□□□ -1.34
CASC19-247ENST00000641642 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.68□□□□□ -1.34
CASC19-247ENST00000641642 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.68□□□□□ -1.34
CASC19-247ENST00000641642 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.68□□□□□ -1.34
CASC19-247ENST00000641642 C10orf25Q5T742 122 aa6.67□□□□□ -1.34
CASC19-247ENST00000641642 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.67□□□□□ -1.34
CASC19-247ENST00000641642 ERG28Q9UKR5 140 aa6.67□□□□□ -1.34
CASC19-247ENST00000641642 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.66□□□□□ -1.34
CASC19-247ENST00000641642 Q6ZVH6 145 aa6.66□□□□□ -1.34
CASC19-247ENST00000641642 A0A0J9YXY3 114 aa6.65□□□□□ -1.34
CASC19-247ENST00000641642 C16orf90A8MZG2 172 aa6.65□□□□□ -1.34
CASC19-247ENST00000641642 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.65□□□□□ -1.34
CASC19-247ENST00000641642 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.65□□□□□ -1.34
CASC19-247ENST00000641642 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.65□□□□□ -1.34
CASC19-247ENST00000641642 PCP2Q8IVA1 136 aa6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms