RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF575	Q86XF7	245 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	PRSS2	P07478	247 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	PPP1R17	O96001	155 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495		M0R381	172 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	BCE1	O60756	84 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHV3-53	P01767	116 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	XCL1	P47992	114 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	KLK9	Q2XQG4	91 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	TIMM17A	Q99595	171 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	B9D2	Q9BPU9	175 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		5.15	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A0J9YXY3	114 aa		5.15	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495		H7BZZ5	65 aa		5.15	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	COX7A2L	O14548	114 aa		5.15	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF876P	Q49A33	203 aa		5.15	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	PRR15	Q8IV56	129 aa		5.15	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		5.15	□□□□□ -1.58
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A087WWL8	130 aa		5.15	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	IGIP	A6NJ69	53 aa		5.15	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	DNAL4	O96015	105 aa		5.15	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		5.15	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		5.14	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495		Q6ZRU5	148 aa		5.14	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		5.14	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	SOCS3	O14543	225 aa		5.14	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	MIA	Q16674	131 aa		5.14	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	LITAF	Q99732	161 aa		5.14	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		5.13	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	TSHB	P01222	138 aa		5.13	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		5.13	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	C20orf197	Q8N268	126 aa		5.13	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		5.13	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		5.13	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	KLKP1	Q107X0	134 aa		5.13	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		5.13	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A087WVE0	104 aa		5.13	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A096LPF7	62 aa		5.13	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495		H3BS24	57 aa		5.13	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	NDUFC1	O43677	76 aa		5.13	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	INS	P01308	110 aa		5.13	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		5.13	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	PRR9	Q5T870	116 aa		5.13	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		5.13	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		5.12	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	CCK	P06307	115 aa		5.12	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	CELA1	Q9UNI1	258 aa		5.12	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		5.12	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		5.12	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		5.12	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495		A8MZ25	164 aa		5.12	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	TIMM17B	O60830	172 aa		5.12	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		5.12	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		5.12	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	GNRH2	O43555	120 aa		5.11	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495		Q6ZTC4	211 aa		5.11	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		5.11	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	C22orf24	Q9Y442	160 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495		X6R8D5	127 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	MUC4	Q99102	2169 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	NXPH4	O95158	308 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	DAD1	P61803	113 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC00846	Q9NV44	126 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LETMD1-238	ENST00000623495	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		5.09	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495		Q6ZTI0	123 aa		5.09	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	SS18	Q15532	418 aa		5.08	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		5.08	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		5.08	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		5.08	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	LY6G6C	O95867	125 aa		5.08	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		5.08	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	MUC7	Q8TAX7	377 aa		5.08	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	VCY	O14598	125 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		5.07	□□□□□ -1.6

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