RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615579.1

TTC28-AS1_3.1-201, humanhuman

BASIC

Gene TTC28-AS1_3, Length 181 nt, Biotype misc RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CNBPP62633 177 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 STPG4Q8N801 248 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C2orf48Q96LS8 159 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa9.43□□□□□ -0.9
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GCSHP23434 173 aa9.42□□□□□ -0.9
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 AKR1D1P51857 326 aa9.42□□□□□ -0.9
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TSPEAR-AS2P59090 65 aa9.42□□□□□ -0.9
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CDPF1Q6NVV7 123 aa9.42□□□□□ -0.9
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C6orf48Q9UBA6 75 aa9.41□□□□□ -0.9
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LEPROTO15243 131 aa9.4□□□□□ -0.9
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MAJINQ3KP22 176 aa9.4□□□□□ -0.9
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CXCL5P42830 114 aa9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KRTAP10-1P60331 282 aa9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C9orf163Q8N9P6 203 aa9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PLEKHB2Q96CS7 222 aa9.39□□□□□ -0.91
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa9.38□□□□□ -0.91
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 J3QQQ9 107 aa9.38□□□□□ -0.91
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NMUP48645 174 aa9.38□□□□□ -0.91
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ANKRD39Q53RE8 183 aa9.38□□□□□ -0.91
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 E9PLD3 99 aa9.37□□□□□ -0.91
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CHTF8P0CG12 524 aa9.37□□□□□ -0.91
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HAMPP81172 84 aa9.37□□□□□ -0.91
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NDUFA12Q9UI09 145 aa9.37□□□□□ -0.91
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa9.36□□□□□ -0.91
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa9.36□□□□□ -0.91
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HSBP1L1C9JCN9 74 aa9.36□□□□□ -0.91
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 F8WDY8 70 aa9.36□□□□□ -0.91
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GAGE2BQ13066 116 aa9.36□□□□□ -0.91
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TTTY13Q9BZ97 58 aa9.36□□□□□ -0.91
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 A0A096LNI7 61 aa9.35□□□□□ -0.91
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 A0A0U1RRA0 63 aa9.35□□□□□ -0.91
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa9.35□□□□□ -0.91
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PFN2P35080 140 aa9.35□□□□□ -0.91
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MEIG1Q5JSS6 88 aa9.35□□□□□ -0.91
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GAGE2EQ4V326 116 aa9.34□□□□□ -0.91
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GAGE2DQ9UEU5 116 aa9.34□□□□□ -0.91
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa9.33□□□□□ -0.92
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RNF151Q2KHN1 245 aa9.33□□□□□ -0.92
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SDIM1Q6ZPB5 146 aa9.33□□□□□ -0.92
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ERG28Q9UKR5 140 aa9.33□□□□□ -0.92
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LRP1BQ9NZR2 4599 aa9.32□□□□□ -0.92
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF815PA8K554 130 aa9.32□□□□□ -0.92
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PANO1I0J062 215 aa9.32□□□□□ -0.92
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PYY3Q5JQD4 70 aa9.32□□□□□ -0.92
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 Q6ZRP5 223 aa9.32□□□□□ -0.92
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DPH3Q96FX2 82 aa9.32□□□□□ -0.92
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM30AQ9NZY2 134 aa9.32□□□□□ -0.92
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PAM16Q9Y3D7 125 aa9.32□□□□□ -0.92
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa9.31□□□□□ -0.92
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LINC00158P58513 81 aa9.31□□□□□ -0.92
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SFTA2Q6UW10 78 aa9.31□□□□□ -0.92
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 VAMP8Q9BV40 100 aa9.31□□□□□ -0.92
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PKIGQ9Y2B9 76 aa9.31□□□□□ -0.92
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DNAH8Q96JB1 4490 aa9.3□□□□□ -0.92
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SMIM13P0DJ93 91 aa9.3□□□□□ -0.92
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PTTG1IPP53801 180 aa9.3□□□□□ -0.92
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HERV-K104P63124 156 aa9.3□□□□□ -0.92
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PCP2Q8IVA1 136 aa9.3□□□□□ -0.92
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 XAGE1AQ9HD64 81 aa9.3□□□□□ -0.92
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SPATA45Q537H7 98 aa9.29□□□□□ -0.92
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TP73-AS1Q9UF72 201 aa9.29□□□□□ -0.92
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SPACA4Q8TDM5 124 aa9.28□□□□□ -0.92
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TLX1NBP0CAT3 122 aa9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DAND5Q8N907 189 aa9.27□□□□□ -0.93
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BIRC6Q9NR09 4857 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 A0A0J9YXY3 114 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NPC2P61916 151 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SCGB1D4Q6XE38 83 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SCXQ7RTU7 201 aa9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 APOBP04114 4563 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM168BA1KXE4 195 aa9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 Q6ZSA8 131 aa9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 A0A087WYN8 130 aa9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LINC00474Q9P2X8 69 aa9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 COX17Q14061 63 aa9.23□□□□□ -0.93
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C14orf144Q96I85 54 aa9.23□□□□□ -0.93
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa9.23□□□□□ -0.93
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa9.22□□□□□ -0.93
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 A0A1W2PNN7 141 aa9.21□□□□□ -0.94
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LINC00587B1AMM8 73 aa9.21□□□□□ -0.94
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 XGP55808 180 aa9.21□□□□□ -0.94
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa9.21□□□□□ -0.94
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 COX8AP10176 69 aa9.2□□□□□ -0.94
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 S100A12P80511 92 aa9.2□□□□□ -0.94
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa9.2□□□□□ -0.94
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MIEN1Q9BRT3 115 aa9.2□□□□□ -0.94
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RYR1P21817 5038 aa9.2□□□□□ -0.94
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.8 ms