RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612839.1

CCL3L3-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL3L3, Length 1,458 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L3-201ENST00000612839 HBDP02042 147 aa7.28□□□□□ -1.24
CCL3L3-201ENST00000612839 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.28□□□□□ -1.24
CCL3L3-201ENST00000612839 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa7.27□□□□□ -1.25
CCL3L3-201ENST00000612839 A0A087WZ39 114 aa7.27□□□□□ -1.25
CCL3L3-201ENST00000612839 APOMO95445 188 aa7.27□□□□□ -1.25
CCL3L3-201ENST00000612839 KRTDAPP60985 99 aa7.27□□□□□ -1.25
CCL3L3-201ENST00000612839 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.26□□□□□ -1.25
CCL3L3-201ENST00000612839 SCXQ7RTU7 201 aa7.26□□□□□ -1.25
CCL3L3-201ENST00000612839 Q8N1X5 172 aa7.26□□□□□ -1.25
CCL3L3-201ENST00000612839 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.26□□□□□ -1.25
CCL3L3-201ENST00000612839 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CCL3L3-201ENST00000612839 PANO1I0J062 215 aa7.25□□□□□ -1.25
CCL3L3-201ENST00000612839 ORAOV1Q8WV07 137 aa7.25□□□□□ -1.25
CCL3L3-201ENST00000612839 CHAC1Q9BUX1 264 aa7.25□□□□□ -1.25
CCL3L3-201ENST00000612839 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.25□□□□□ -1.25
CCL3L3-201ENST00000612839 A0A0J9YXV3 536 aa7.24□□□□□ -1.25
CCL3L3-201ENST00000612839 SCGB1D1O95968 90 aa7.24□□□□□ -1.25
CCL3L3-201ENST00000612839 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CCL3L3-201ENST00000612839 HERVK_113P63121 156 aa7.24□□□□□ -1.25
CCL3L3-201ENST00000612839 SPAG11BQ08648 103 aa7.24□□□□□ -1.25
CCL3L3-201ENST00000612839 SYCNQ0VAF6 134 aa7.24□□□□□ -1.25
CCL3L3-201ENST00000612839 PMVKQ15126 192 aa7.24□□□□□ -1.25
CCL3L3-201ENST00000612839 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.24□□□□□ -1.25
CCL3L3-201ENST00000612839 CARD19Q96LW7 228 aa7.24□□□□□ -1.25
CCL3L3-201ENST00000612839 CST9LQ9H4G1 147 aa7.24□□□□□ -1.25
CCL3L3-201ENST00000612839 FAT1Q14517 4588 aa7.24□□□□□ -1.25
CCL3L3-201ENST00000612839 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7.24□□□□□ -1.25
CCL3L3-201ENST00000612839 SEC11AP67812 179 aa7.24□□□□□ -1.25
CCL3L3-201ENST00000612839 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CCL3L3-201ENST00000612839 Q6ZRU5 148 aa7.24□□□□□ -1.25
CCL3L3-201ENST00000612839 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.24□□□□□ -1.25
CCL3L3-201ENST00000612839 C2orf48Q96LS8 159 aa7.24□□□□□ -1.25
CCL3L3-201ENST00000612839 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.24□□□□□ -1.25
CCL3L3-201ENST00000612839 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.24□□□□□ -1.25
CCL3L3-201ENST00000612839 CHTF8P0CG12 524 aa7.23□□□□□ -1.25
CCL3L3-201ENST00000612839 KIAA0087Q14695 138 aa7.23□□□□□ -1.25
CCL3L3-201ENST00000612839 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.23□□□□□ -1.25
CCL3L3-201ENST00000612839 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.23□□□□□ -1.25
CCL3L3-201ENST00000612839 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CCL3L3-201ENST00000612839 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.22□□□□□ -1.25
CCL3L3-201ENST00000612839 ATP5LO75964 103 aa7.22□□□□□ -1.25
CCL3L3-201ENST00000612839 PET117Q6UWS5 81 aa7.22□□□□□ -1.25
CCL3L3-201ENST00000612839 PCLOQ9Y6V0 5065 aa7.22□□□□□ -1.25
CCL3L3-201ENST00000612839 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.21□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.21□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 A0A096LNI7 61 aa7.2□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 EPM2AB3EWF7 344 aa7.2□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 F8WDY8 70 aa7.2□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 C10orf25Q5T742 122 aa7.2□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.2□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 Q5VSD8 79 aa7.2□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 LINC01545Q5VT33 79 aa7.2□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.2□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 ABCA13Q86UQ4 5058 aa7.19□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.19□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.19□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 H0Y8G0 127 aa7.19□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 NDUFA1O15239 70 aa7.19□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 IGLC3P0DOY3 106 aa7.19□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.19□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 A0A087WYN8 130 aa7.18□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.18□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 RNF151Q2KHN1 245 aa7.18□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 C2orf82Q6UX34 121 aa7.18□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 ATOH7Q8N100 152 aa7.18□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 PMCHL2Q9BQD1 86 aa7.18□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.18□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.17□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 C20orf202A1L168 122 aa7.17□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 S100A12P80511 92 aa7.17□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 Q8IZM0 81 aa7.17□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.17□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.17□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 PRSS2P07478 247 aa7.17□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 PTTG1IPP53801 180 aa7.17□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 ODF1Q14990 250 aa7.17□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 MAJINQ3KP22 176 aa7.17□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 DPH3Q96FX2 82 aa7.17□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.17□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.16□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 SPINK8P0C7L1 97 aa7.16□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 GAGE2BQ13066 116 aa7.16□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.16□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.16□□□□□ -1.26
CCL3L3-201ENST00000612839 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.15□□□□□ -1.27
CCL3L3-201ENST00000612839 C11orf86A6NJI1 115 aa7.15□□□□□ -1.27
CCL3L3-201ENST00000612839 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.15□□□□□ -1.27
CCL3L3-201ENST00000612839 CKS1BP61024 79 aa7.15□□□□□ -1.27
CCL3L3-201ENST00000612839 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
CCL3L3-201ENST00000612839 STPG4Q8N801 248 aa7.15□□□□□ -1.27
CCL3L3-201ENST00000612839 VAMP8Q9BV40 100 aa7.15□□□□□ -1.27
CCL3L3-201ENST00000612839 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.15□□□□□ -1.27
CCL3L3-201ENST00000612839 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
CCL3L3-201ENST00000612839 H3BRM9 83 aa7.14□□□□□ -1.27
CCL3L3-201ENST00000612839 Q6ZRP5 223 aa7.14□□□□□ -1.27
CCL3L3-201ENST00000612839 PRO1933Q9H354 126 aa7.14□□□□□ -1.27
CCL3L3-201ENST00000612839 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.13□□□□□ -1.27
CCL3L3-201ENST00000612839 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57 ms