RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602511.1

KDM5B-210, Transcript of lysine demethylase 5B, humanhuman

TSL 5

Gene KDM5B, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5B-210ENST00000602511 C5orf38Q86SI9 138 aa5.45□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 BOD1L2Q8IYS8 172 aa5.45□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 HERV-K104P63124 156 aa5.44□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 COX7B2Q8TF08 81 aa5.44□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 ORAOV1Q8WV07 137 aa5.44□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 Q9HAA7 133 aa5.44□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 UQCR10Q9UDW1 63 aa5.44□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.44□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 FRAS1Q86XX4 4008 aa5.44□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa5.43□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 LINC00587B1AMM8 73 aa5.43□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 LY6G6CO95867 125 aa5.43□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 PRSS2P07478 247 aa5.43□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 TSPEAR-AS2P59090 65 aa5.43□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 KIAA0087Q14695 138 aa5.43□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 C14orf177Q52M58 125 aa5.43□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 C2orf48Q96LS8 159 aa5.43□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 MIEN1Q9BRT3 115 aa5.43□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 HIGD1BQ9P298 99 aa5.43□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 NDUFA12Q9UI09 145 aa5.43□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 ZNF815PA8K554 130 aa5.42□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 SPAG11BQ08648 103 aa5.42□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 PCP2Q8IVA1 136 aa5.42□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 C6orf223Q8N319 242 aa5.42□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 C15orf56Q8N910 161 aa5.42□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa5.41□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 PSCAO43653 123 aa5.41□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 TIMM17BO60830 172 aa5.41□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 GCSHP23434 173 aa5.41□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 C6orf226Q5I0X4 101 aa5.41□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 C14orf144Q96I85 54 aa5.41□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 KMT2AQ03164 3969 aa5.4□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa5.4□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 TMEM238C9JI98 176 aa5.4□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 CKS1BP61024 79 aa5.4□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 COX17Q14061 63 aa5.4□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 C1orf134Q5TEV5 83 aa5.4□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.4□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 Q6ZVH6 145 aa5.4□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 PRO1933Q9H354 126 aa5.4□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 PPDPFQ9H3Y8 114 aa5.4□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 TOMM7Q9P0U1 55 aa5.4□□□□□ -1.54
KDM5B-210ENST00000602511 A0A0J9YXY3 114 aa5.39□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 USP17L23D6RBM5 183 aa5.39□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 TAL2Q16559 108 aa5.39□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 RNF151Q2KHN1 245 aa5.39□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa5.39□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 DNAH10Q8IVF4 4471 aa5.38□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 DDTP30046 118 aa5.38□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 CNBPP62633 177 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 C2orf91Q6ZV80 131 aa5.38□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 COPS9Q8WXC6 57 aa5.38□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 SPANXDQ9BXN6 97 aa5.38□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 TTTY13Q9BZ97 58 aa5.38□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 SPANXCQ9NY87 97 aa5.38□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 PKIGQ9Y2B9 76 aa5.38□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 LRCOL1A6NCL2 159 aa5.37□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 M0R2N4 97 aa5.37□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 PTTG1IPP53801 180 aa5.37□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 CAMK2N2Q96S95 79 aa5.37□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.37□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 TP73-AS1Q9UF72 201 aa5.37□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 TLX1NBP0CAT3 122 aa5.36□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 IFITM1P13164 125 aa5.36□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 HSD52Q0P140 79 aa5.36□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 SYCNQ0VAF6 134 aa5.36□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 HIGD2BQ4VC39 106 aa5.36□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 MEIG1Q5JSS6 88 aa5.36□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 CARD19Q96LW7 228 aa5.36□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 LITAFQ99732 161 aa5.36□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 ERG28Q9UKR5 140 aa5.36□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 HERC1Q15751 4861 aa5.35□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 DNAH2Q9P225 4427 aa5.35□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 C2orf82Q6UX34 121 aa5.35□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 C6orf48Q9UBA6 75 aa5.35□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa5.34□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 A0A087WTM6 91 aa5.34□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa5.34□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 M0R143 59 aa5.34□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.34□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa5.34□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 Q6ZRU5 148 aa5.34□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 ARL17AQ8IVW1 177 aa5.34□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 Q8N814 137 aa5.34□□□□□ -1.55
KDM5B-210ENST00000602511 DNAH17Q9UFH2 4485 aa5.34□□□□□ -1.56
KDM5B-210ENST00000602511 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa5.33□□□□□ -1.56
KDM5B-210ENST00000602511 SMIM13P0DJ93 91 aa5.33□□□□□ -1.56
KDM5B-210ENST00000602511 WFDC2Q14508 124 aa5.33□□□□□ -1.56
KDM5B-210ENST00000602511 C10orf25Q5T742 122 aa5.33□□□□□ -1.56
KDM5B-210ENST00000602511 CEND1Q8N111 149 aa5.33□□□□□ -1.56
KDM5B-210ENST00000602511 LINC00526Q96FQ7 95 aa5.33□□□□□ -1.56
KDM5B-210ENST00000602511 HIST1H4GQ99525 98 aa5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63 ms