RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-206ENST00000588815 TAL2Q16559 108 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-206ENST00000588815 Q6ZR54 194 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-206ENST00000588815 HSD52Q0P140 79 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-206ENST00000588815 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-206ENST00000588815 C2orf48Q96LS8 159 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-206ENST00000588815 PSCAO43653 123 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-206ENST00000588815 Q6ZVH6 145 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-206ENST00000588815 MEIG1Q5JSS6 88 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-206ENST00000588815 USP17L23D6RBM5 183 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-206ENST00000588815 C2orf82Q6UX34 121 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-206ENST00000588815 HIST1H4GQ99525 98 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-206ENST00000588815 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-206ENST00000588815 LITAFQ99732 161 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-206ENST00000588815 M0R2N4 97 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-206ENST00000588815 HIGD2BQ4VC39 106 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-206ENST00000588815 M0R143 59 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-206ENST00000588815 SPANXDQ9BXN6 97 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-206ENST00000588815 SPANXCQ9NY87 97 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-206ENST00000588815 C6orf223Q8N319 242 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-206ENST00000588815 COX17Q14061 63 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-206ENST00000588815 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-206ENST00000588815 CAMK2N2Q96S95 79 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-206ENST00000588815 ERG28Q9UKR5 140 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-206ENST00000588815 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-206ENST00000588815 C14orf177Q52M58 125 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC00526Q96FQ7 95 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-206ENST00000588815 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-206ENST00000588815 CEND1Q8N111 149 aa20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-206ENST00000588815 ALMS1Q8TCU4 4167 aa20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-206ENST00000588815 SMIM13P0DJ93 91 aa20.4■□□□□ 0.86
CAPNS1-206ENST00000588815 COPS9Q8WXC6 57 aa20.4■□□□□ 0.86
CAPNS1-206ENST00000588815 IFITM1P13164 125 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-206ENST00000588815 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-206ENST00000588815 GCSHP23434 173 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-206ENST00000588815 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-206ENST00000588815 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-206ENST00000588815 PTTG1IPP53801 180 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-206ENST00000588815 C10orf25Q5T742 122 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC00158P58513 81 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-206ENST00000588815 SYCNQ0VAF6 134 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-206ENST00000588815 PPDPFQ9H3Y8 114 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-206ENST00000588815 DNAH6Q9C0G6 4158 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-206ENST00000588815 C1orf134Q5TEV5 83 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-206ENST00000588815 C6orf48Q9UBA6 75 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-206ENST00000588815 PFN2P35080 140 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF151Q2KHN1 245 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-206ENST00000588815 Q6ZRU5 148 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A0U1RRA0 63 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-206ENST00000588815 SNHG12Q9BXW3 62 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-206ENST00000588815 LECT2O14960 151 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-206ENST00000588815 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-206ENST00000588815 LRCOL1A6NCL2 159 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-206ENST00000588815 A6NJY4 79 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-206ENST00000588815 RPL24P83731 157 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-206ENST00000588815 CARD19Q96LW7 228 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-206ENST00000588815 MUSTN1Q8IVN3 82 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-206ENST00000588815 WFDC2Q14508 124 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-206ENST00000588815 DAND5Q8N907 189 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-206ENST00000588815 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC00308Q8TCZ7 52 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-206ENST00000588815 FXYD2P54710 66 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-206ENST00000588815 BATFQ16520 125 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-206ENST00000588815 KMT2AQ03164 3969 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-206ENST00000588815 CNBPP62633 177 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-206ENST00000588815 A6NDN8 102 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-206ENST00000588815 EREGO14944 169 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-206ENST00000588815 SLPIP03973 132 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-206ENST00000588815 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-206ENST00000588815 LCE6AA0A183 80 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-206ENST00000588815 ARL17AQ8IVW1 177 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-206ENST00000588815 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-206ENST00000588815 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-206ENST00000588815 TLX1NBP0CAT3 122 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-206ENST00000588815 NPC2P61916 151 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-206ENST00000588815 DNAH10Q8IVF4 4471 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A087WTM6 91 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-206ENST00000588815 A4D1N5 150 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-206ENST00000588815 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-206ENST00000588815 Q8N814 137 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-206ENST00000588815 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-206ENST00000588815 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1B0GWB2 263 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-206ENST00000588815 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-206ENST00000588815 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-206ENST00000588815 PKIGQ9Y2B9 76 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-206ENST00000588815 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A0B4J2C4 111 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-206ENST00000588815 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-206ENST00000588815 CFC1BP0CG36 223 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-206ENST00000588815 CFC1P0CG37 223 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-206ENST00000588815 NDUFC2O95298 119 aa20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-206ENST00000588815 Q6ZRP5 223 aa20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-206ENST00000588815 C9orf163Q8N9P6 203 aa20.08■□□□□ 0.81
CAPNS1-206ENST00000588815 RTL8CO15255 209 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-206ENST00000588815 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB37Q96AX2 223 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-206ENST00000588815 GAGE2EQ4V326 116 aa20.04■□□□□ 0.8
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