RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588340.1

EFTUD2-210, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-210ENST00000588340 OR10D4PQ8NGN7 298 aa4.36□□□□□ -1.71
EFTUD2-210ENST00000588340 C2orf48Q96LS8 159 aa4.36□□□□□ -1.71
EFTUD2-210ENST00000588340 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.36□□□□□ -1.71
EFTUD2-210ENST00000588340 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa4.35□□□□□ -1.71
EFTUD2-210ENST00000588340 FAT3Q8TDW7 4589 aa4.35□□□□□ -1.71
EFTUD2-210ENST00000588340 A0A087WYN8 130 aa4.35□□□□□ -1.71
EFTUD2-210ENST00000588340 H3BS24 57 aa4.35□□□□□ -1.71
EFTUD2-210ENST00000588340 OXTP01178 125 aa4.35□□□□□ -1.71
EFTUD2-210ENST00000588340 CHTF8P0CG12 524 aa4.35□□□□□ -1.71
EFTUD2-210ENST00000588340 RNF151Q2KHN1 245 aa4.35□□□□□ -1.71
EFTUD2-210ENST00000588340 HIGD2BQ4VC39 106 aa4.35□□□□□ -1.71
EFTUD2-210ENST00000588340 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa4.35□□□□□ -1.71
EFTUD2-210ENST00000588340 SPACA4Q8TDM5 124 aa4.35□□□□□ -1.71
EFTUD2-210ENST00000588340 DPH3Q96FX2 82 aa4.35□□□□□ -1.71
EFTUD2-210ENST00000588340 SCGB3A1Q96QR1 104 aa4.35□□□□□ -1.71
EFTUD2-210ENST00000588340 CST9LQ9H4G1 147 aa4.35□□□□□ -1.71
EFTUD2-210ENST00000588340 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa4.34□□□□□ -1.71
EFTUD2-210ENST00000588340 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa4.34□□□□□ -1.71
EFTUD2-210ENST00000588340 HIST1H2BKO60814 126 aa4.34□□□□□ -1.71
EFTUD2-210ENST00000588340 ATP6V1G1O75348 118 aa4.34□□□□□ -1.71
EFTUD2-210ENST00000588340 HIST1H2BJP06899 126 aa4.34□□□□□ -1.71
EFTUD2-210ENST00000588340 IGLC3P0DOY3 106 aa4.34□□□□□ -1.71
EFTUD2-210ENST00000588340 S100A1P23297 94 aa4.34□□□□□ -1.71
EFTUD2-210ENST00000588340 HIST1H2BOP23527 126 aa4.34□□□□□ -1.71
EFTUD2-210ENST00000588340 HIST1H2BBP33778 126 aa4.34□□□□□ -1.71
EFTUD2-210ENST00000588340 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
EFTUD2-210ENST00000588340 HIST1H2BDP58876 126 aa4.34□□□□□ -1.71
EFTUD2-210ENST00000588340 HIST1H2BCP62807 126 aa4.34□□□□□ -1.71
EFTUD2-210ENST00000588340 SEC11AP67812 179 aa4.34□□□□□ -1.71
EFTUD2-210ENST00000588340 PMVKQ15126 192 aa4.34□□□□□ -1.71
EFTUD2-210ENST00000588340 HIST2H2BEQ16778 126 aa4.34□□□□□ -1.71
EFTUD2-210ENST00000588340 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
EFTUD2-210ENST00000588340 Q6ZN92 141 aa4.34□□□□□ -1.71
EFTUD2-210ENST00000588340 HIST1H2BHQ93079 126 aa4.34□□□□□ -1.71
EFTUD2-210ENST00000588340 HIST1H2BNQ99877 126 aa4.34□□□□□ -1.71
EFTUD2-210ENST00000588340 HIST1H2BMQ99879 126 aa4.34□□□□□ -1.71
EFTUD2-210ENST00000588340 C2orf88Q9BSF0 95 aa4.34□□□□□ -1.71
EFTUD2-210ENST00000588340 VCX2Q9H322 139 aa4.34□□□□□ -1.71
EFTUD2-210ENST00000588340 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa4.33□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa4.33□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 A0A0J9YXV3 536 aa4.33□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 NUPR1O60356 82 aa4.33□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 ATP5LO75964 103 aa4.33□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 HERVK_113P63121 156 aa4.33□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 C5orf38Q86SI9 138 aa4.33□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 PLAC8Q9NZF1 115 aa4.33□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa4.33□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa4.32□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 SMIM1B2RUZ4 78 aa4.32□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 SERF1AO75920 110 aa4.32□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 APOMO95445 188 aa4.32□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 TLX1NBP0CAT3 122 aa4.32□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 SYCNQ0VAF6 134 aa4.32□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 PMCHL1Q16048 86 aa4.32□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 Q8IZM0 81 aa4.32□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 LINC00526Q96FQ7 95 aa4.32□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 A0A096LNI7 61 aa4.31□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 SPAG11BQ08648 103 aa4.31□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 Q6ZRU5 148 aa4.31□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 STPG4Q8N801 248 aa4.31□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 CARD19Q96LW7 228 aa4.31□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa4.3□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 HSBP1O75506 76 aa4.3□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 C10orf25Q5T742 122 aa4.3□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa4.3□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 BAGE3Q86Y29 109 aa4.3□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 C7orf33Q8WU49 177 aa4.3□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 ORAOV1Q8WV07 137 aa4.3□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 IFI27L1Q96BM0 104 aa4.3□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 LINC00474Q9P2X8 69 aa4.3□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 C6orf48Q9UBA6 75 aa4.3□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 PKIGQ9Y2B9 76 aa4.3□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 C11orf86A6NJI1 115 aa4.29□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 F8VRH5 84 aa4.29□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 PTTG1IPP53801 180 aa4.29□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM19A2Q8N3H0 131 aa4.29□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 NDUFA1O15239 70 aa4.28□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 LEPROTL1O95214 131 aa4.28□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 MT1HL1P0DM35 61 aa4.28□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 CXCL5P42830 114 aa4.28□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa4.28□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa4.28□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 LINC00469Q8N7U9 141 aa4.28□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 CAMK2N2Q96S95 79 aa4.28□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
EFTUD2-210ENST00000588340 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa4.27□□□□□ -1.73
EFTUD2-210ENST00000588340 PRR3P79522 188 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
EFTUD2-210ENST00000588340 GAGE2BQ13066 116 aa4.27□□□□□ -1.73
EFTUD2-210ENST00000588340 C2orf82Q6UX34 121 aa4.27□□□□□ -1.73
EFTUD2-210ENST00000588340 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.26□□□□□ -1.73
EFTUD2-210ENST00000588340 TMEM223A0PJW6 202 aa4.26□□□□□ -1.73
EFTUD2-210ENST00000588340 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa4.26□□□□□ -1.73
EFTUD2-210ENST00000588340 Q6ZRP5 223 aa4.26□□□□□ -1.73
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
EFTUD2-210ENST00000588340 HSPB8Q9UJY1 196 aa4.26□□□□□ -1.73
EFTUD2-210ENST00000588340 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.4 ms