RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587586.5

GTF3C2-AS1-204, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 529 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 LINC00469Q8N7U9 141 aa4.12□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 C9orf163Q8N9P6 203 aa4.12□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 SPINK8P0C7L1 97 aa4.11□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 MALP21145 153 aa4.11□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 RNF151Q2KHN1 245 aa4.11□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 C10orf25Q5T742 122 aa4.11□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 SDIM1Q6ZPB5 146 aa4.11□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ORAOV1Q8WV07 137 aa4.11□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 LINC00526Q96FQ7 95 aa4.11□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa4.1□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 hDV102S1A0JD36 115 aa4.1□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 E9PLD3 99 aa4.1□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 H0Y8G0 127 aa4.1□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 H3BRM9 83 aa4.1□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP4.1□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 HIGD2BQ4VC39 106 aa4.1□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 TMEM170BQ5T4T1 132 aa4.1□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 CDPF1Q6NVV7 123 aa4.1□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa4.1□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 Q6ZRU5 148 aa4.1□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 COX7B2Q8TF08 81 aa4.1□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 DNAH8Q96JB1 4490 aa4.1□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 FAT1Q14517 4588 aa4.1□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 MYCBP2O75592 4640 aa4.09□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa4.09□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 EPM2AB3EWF7 344 aa4.09□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa4.09□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 EREGO14944 169 aa4.09□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 LEPROTO15243 131 aa4.09□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 TLX1NBP0CAT3 122 aa4.09□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 AKR1D1P51857 326 aa4.09□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 TSPEAR-AS2P59090 65 aa4.09□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 SPAG11BQ08648 103 aa4.09□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 SYCNQ0VAF6 134 aa4.09□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 C6orf226Q5I0X4 101 aa4.09□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 PYY3Q5JQD4 70 aa4.09□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 C2orf82Q6UX34 121 aa4.09□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 STPG4Q8N801 248 aa4.09□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 C6orf48Q9UBA6 75 aa4.09□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa4.08□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 CXCL5P42830 114 aa4.08□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 KRTAP10-1P60331 282 aa4.08□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 MAJINQ3KP22 176 aa4.08□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ANKRD39Q53RE8 183 aa4.08□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 Q6ZSA8 131 aa4.08□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 PLEKHB2Q96CS7 222 aa4.08□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.08□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.08□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.07□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 C20orf202A1L168 122 aa4.07□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 J3QQQ9 107 aa4.07□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 NDUFA1O15239 70 aa4.07□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 GCSHP23434 173 aa4.07□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ATOH7Q8N100 152 aa4.07□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 CAMK2N2Q96S95 79 aa4.07□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa4.06□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 PANO1I0J062 215 aa4.06□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 SCGB1D1O95968 90 aa4.06□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 PRSS2P07478 247 aa4.06□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 LINC01620Q4KN68 170 aa4.06□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa4.06□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 CARD19Q96LW7 228 aa4.06□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 FAM30AQ9NZY2 134 aa4.06□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 TOMM7Q9P0U1 55 aa4.06□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa4.05□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 NMUP48645 174 aa4.05□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 XGP55808 180 aa4.05□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 CKS1BP61024 79 aa4.05□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 HERVK_113P61574 105 aa4.05□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 HERV-K104P63124 156 aa4.05□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 COX17Q14061 63 aa4.05□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 SFTA2Q6UW10 78 aa4.05□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 Q6ZRP5 223 aa4.05□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ARL17AQ8IVW1 177 aa4.05□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 LITAFQ99732 161 aa4.05□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 TTTY13Q9BZ97 58 aa4.05□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 NDUFA12Q9UI09 145 aa4.05□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 A0A096LNI7 61 aa4.04□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 A0A0J9YXY3 114 aa4.04□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa4.04□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa4.04□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 C16orf90A8MZG2 172 aa4.04□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa4.04□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 DLEU1O43261 78 aa4.04□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 PTTG1IPP53801 180 aa4.04□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 PCP2Q8IVA1 136 aa4.04□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 BOD1L2Q8IYS8 172 aa4.04□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.04□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ERG28Q9UKR5 140 aa4.04□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 TIMM17BO60830 172 aa4.03□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa4.03□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 SPACA4Q8TDM5 124 aa4.03□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms