RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585794.5

EFTUD2-204, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-204ENST00000585794 Q9UF83 564 aa5.7□□□□□ -1.5
EFTUD2-204ENST00000585794 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-204ENST00000585794 A0A1B0GWB2 263 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-204ENST00000585794 GAGE12HA6NDE8 117 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-204ENST00000585794 F8VRH5 84 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-204ENST00000585794 CHTF8P0CG12 524 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-204ENST00000585794 ENHOQ6UWT2 76 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-204ENST00000585794 DPH3Q96FX2 82 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-204ENST00000585794 C20orf78Q9BR46 151 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-204ENST00000585794 LENEPQ9Y5L5 61 aa5.69□□□□□ -1.5
EFTUD2-204ENST00000585794 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-204ENST00000585794 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-204ENST00000585794 K7ERJ3 54 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-204ENST00000585794 PRR3P79522 188 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-204ENST00000585794 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-204ENST00000585794 SPANXN1Q5VSR9 72 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-204ENST00000585794 SMIM2Q9BVW6 85 aa5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-204ENST00000585794 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
EFTUD2-204ENST00000585794 M0R381 172 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-204ENST00000585794 HERVK_113P61574 105 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-204ENST00000585794 REG3GQ6UW15 175 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-204ENST00000585794 NRACQ8N912 160 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-204ENST00000585794 SPACA4Q8TDM5 124 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-204ENST00000585794 C7orf33Q8WU49 177 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-204ENST00000585794 SCGB3A1Q96QR1 104 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-204ENST00000585794 CHCHD7Q9BUK0 85 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-204ENST00000585794 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-204ENST00000585794 TRAV21A0A0B4J279 112 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-204ENST00000585794 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-204ENST00000585794 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-204ENST00000585794 TOMM6Q96B49 74 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-204ENST00000585794 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-204ENST00000585794 H3BMG7 143 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-204ENST00000585794 SMAGPQ0VAQ4 97 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-204ENST00000585794 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-204ENST00000585794 C9orf85Q96MD7 179 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-204ENST00000585794 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 APOMO95445 188 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 CRPP02741 224 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 CNBPP62633 177 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 RPL32P62910 135 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 PTH2Q96A98 100 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 TTTY13Q9BZ97 58 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 CYSLTR1Q9Y271 337 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 ZNF815PA8K554 130 aa5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 H3BVH4 76 aa5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 SLPIP03973 132 aa5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 S100A4P26447 101 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 ETDBQ3ZM63 59 aa5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 ZFP2Q6ZN57 461 aa5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 C11orf21Q9P2W6 132 aa5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 PRO0461Q9UI25 63 aa5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 TMEM262E9PQX1 116 aa5.62□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 ANGP03950 147 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 MIAQ16674 131 aa5.62□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 PPDPFLQ8WWR9 84 aa5.62□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 TMEM141Q96I45 108 aa5.62□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa5.62□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa5.61□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 A8MWV9 139 aa5.61□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 M0QXV9 152 aa5.61□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 UBE2D1P51668 147 aa5.61□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 CKS1BP61024 79 aa5.61□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 FOXI1Q12951 378 aa5.61□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 C2orf66Q6UXQ4 117 aa5.61□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 JPT2Q9H910 190 aa5.61□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.61□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 MGPP08493 103 aa5.6□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 UBE2D3P61077 147 aa5.6□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 UBE2D2P62837 147 aa5.6□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 A0A087WWL8 130 aa5.59□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa5.59□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 VCYO14598 125 aa5.59□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 TSPAN13O95857 204 aa5.59□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 PSMB2P49721 201 aa5.59□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 PMVKQ15126 192 aa5.59□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa5.59□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 CLPSL2Q6UWE3 100 aa5.59□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 TEN1Q86WV5 123 aa5.59□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 ARL17AQ8IVW1 177 aa5.59□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 TIMM17AQ99595 171 aa5.59□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 KIR2DL4Q99706 377 aa5.59□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 PRR34Q9NV39 138 aa5.59□□□□□ -1.51
EFTUD2-204ENST00000585794 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa5.58□□□□□ -1.52
EFTUD2-204ENST00000585794 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
EFTUD2-204ENST00000585794 C11orf86A6NJI1 115 aa5.58□□□□□ -1.52
EFTUD2-204ENST00000585794 SPINK8P0C7L1 97 aa5.58□□□□□ -1.52
EFTUD2-204ENST00000585794 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
EFTUD2-204ENST00000585794 COX6A2Q02221 97 aa5.58□□□□□ -1.52
EFTUD2-204ENST00000585794 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa5.57□□□□□ -1.52
EFTUD2-204ENST00000585794 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
EFTUD2-204ENST00000585794 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
EFTUD2-204ENST00000585794 PRO1854Q9UHT4 67 aa5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.9 ms