RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		15.98	■□□□□ 0.15
GPS1-223	ENST00000584229	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
GPS1-223	ENST00000584229	C10orf25	Q5T742	122 aa		15.98	■□□□□ 0.15
GPS1-223	ENST00000584229	SCX	Q7RTU7	201 aa		15.98	■□□□□ 0.15
GPS1-223	ENST00000584229	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		15.98	■□□□□ 0.15
GPS1-223	ENST00000584229		A0A096LNI7	61 aa		15.96	■□□□□ 0.15
GPS1-223	ENST00000584229	GAGE2B	Q13066	116 aa		15.96	■□□□□ 0.15
GPS1-223	ENST00000584229	ODF1	Q14990	250 aa		15.96	■□□□□ 0.15
GPS1-223	ENST00000584229	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	15.96	■□□□□ 0.15
GPS1-223	ENST00000584229	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		15.96	■□□□□ 0.15
GPS1-223	ENST00000584229	PANO1	I0J062	215 aa		15.95	■□□□□ 0.14
GPS1-223	ENST00000584229	MAJIN	Q3KP22	176 aa		15.95	■□□□□ 0.14
GPS1-223	ENST00000584229	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	15.94	■□□□□ 0.14
GPS1-223	ENST00000584229	RNF151	Q2KHN1	245 aa		15.94	■□□□□ 0.14
GPS1-223	ENST00000584229	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		15.94	■□□□□ 0.14
GPS1-223	ENST00000584229	RYR1	P21817	5038 aa		15.94	■□□□□ 0.14
GPS1-223	ENST00000584229	CXCL5	P42830	114 aa		15.93	■□□□□ 0.14
GPS1-223	ENST00000584229	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		15.93	■□□□□ 0.14
GPS1-223	ENST00000584229	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		15.92	■□□□□ 0.14
GPS1-223	ENST00000584229	S100A6	P06703	90 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GPS1-223	ENST00000584229	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		15.91	■□□□□ 0.14
GPS1-223	ENST00000584229	HSPG2	P98160	4391 aa		15.9	■□□□□ 0.14
GPS1-223	ENST00000584229	PLN	P26678	52 aa		15.9	■□□□□ 0.14
GPS1-223	ENST00000584229	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	15.9	■□□□□ 0.14
GPS1-223	ENST00000584229	DPM2	O94777	84 aa		15.89	■□□□□ 0.13
GPS1-223	ENST00000584229	PTTG1IP	P53801	180 aa		15.89	■□□□□ 0.13
GPS1-223	ENST00000584229	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		15.89	■□□□□ 0.13
GPS1-223	ENST00000584229	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		15.88	■□□□□ 0.13
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM223	A0PJW6	202 aa		15.88	■□□□□ 0.13
GPS1-223	ENST00000584229	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		15.88	■□□□□ 0.13
GPS1-223	ENST00000584229		A0A087WYN8	130 aa		15.87	■□□□□ 0.13
GPS1-223	ENST00000584229	IGKC	P01834	107 aa		15.87	■□□□□ 0.13
GPS1-223	ENST00000584229	KRTDAP	P60985	99 aa		15.87	■□□□□ 0.13
GPS1-223	ENST00000584229	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	15.87	■□□□□ 0.13
GPS1-223	ENST00000584229	GAGE2E	Q4V326	116 aa		15.87	■□□□□ 0.13
GPS1-223	ENST00000584229	STPG4	Q8N801	248 aa		15.87	■□□□□ 0.13
GPS1-223	ENST00000584229	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		15.87	■□□□□ 0.13
GPS1-223	ENST00000584229	S100A2	P29034	98 aa		15.85	■□□□□ 0.13
GPS1-223	ENST00000584229		Q8N1X5	172 aa		15.84	■□□□□ 0.13
GPS1-223	ENST00000584229	C3orf79	P0CE67	100 aa		15.83	■□□□□ 0.12
GPS1-223	ENST00000584229		Q6ZRP5	223 aa		15.83	■□□□□ 0.12
GPS1-223	ENST00000584229	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		15.83	■□□□□ 0.12
GPS1-223	ENST00000584229	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		15.82	■□□□□ 0.12
GPS1-223	ENST00000584229	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		15.82	■□□□□ 0.12
GPS1-223	ENST00000584229	PET117	Q6UWS5	81 aa		15.82	■□□□□ 0.12
GPS1-223	ENST00000584229	HERC2	O95714	4834 aa		15.82	■□□□□ 0.12
GPS1-223	ENST00000584229	HERVK_113	P61574	105 aa		15.81	■□□□□ 0.12
GPS1-223	ENST00000584229	EPM2A	B3EWF7	344 aa		15.8	■□□□□ 0.12
GPS1-223	ENST00000584229	FAM229A	H3BQW9	127 aa		15.8	■□□□□ 0.12
GPS1-223	ENST00000584229		Q5VSD8	79 aa		15.8	■□□□□ 0.12
GPS1-223	ENST00000584229	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		15.8	■□□□□ 0.12
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	15.79	■□□□□ 0.12
GPS1-223	ENST00000584229	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		15.79	■□□□□ 0.12
GPS1-223	ENST00000584229	LINC01545	Q5VT33	79 aa		15.78	■□□□□ 0.12
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		15.78	■□□□□ 0.12
GPS1-223	ENST00000584229	C20orf202	A1L168	122 aa		15.77	■□□□□ 0.12
GPS1-223	ENST00000584229	PFN2	P35080	140 aa		15.76	■□□□□ 0.11
GPS1-223	ENST00000584229	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	15.76	■□□□□ 0.11
GPS1-223	ENST00000584229	SFTA2	Q6UW10	78 aa		15.76	■□□□□ 0.11
GPS1-223	ENST00000584229	LEPROT	O15243	131 aa		15.74	■□□□□ 0.11
GPS1-223	ENST00000584229	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	15.74	■□□□□ 0.11
GPS1-223	ENST00000584229	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		15.74	■□□□□ 0.11
GPS1-223	ENST00000584229	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		15.74	■□□□□ 0.11
GPS1-223	ENST00000584229	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		15.73	■□□□□ 0.11
GPS1-223	ENST00000584229	ERG28	Q9UKR5	140 aa		15.73	■□□□□ 0.11
GPS1-223	ENST00000584229		A0A1W2PNN7	141 aa		15.72	■□□□□ 0.11
GPS1-223	ENST00000584229	FAM168B	A1KXE4	195 aa		15.72	■□□□□ 0.11
GPS1-223	ENST00000584229	C7orf33	Q8WU49	177 aa		15.72	■□□□□ 0.11
GPS1-223	ENST00000584229	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	15.71	■□□□□ 0.11
GPS1-223	ENST00000584229	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		15.71	■□□□□ 0.11
GPS1-223	ENST00000584229	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	15.7	■□□□□ 0.1
GPS1-223	ENST00000584229	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		15.7	■□□□□ 0.1
GPS1-223	ENST00000584229	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		15.7	■□□□□ 0.1
GPS1-223	ENST00000584229	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	15.7	■□□□□ 0.1
GPS1-223	ENST00000584229		J3QQQ9	107 aa		15.69	■□□□□ 0.1
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		15.69	■□□□□ 0.1
GPS1-223	ENST00000584229		A0A0U1RRA0	63 aa		15.68	■□□□□ 0.1
GPS1-223	ENST00000584229	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		15.68	■□□□□ 0.1
GPS1-223	ENST00000584229	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	15.68	■□□□□ 0.1
GPS1-223	ENST00000584229	LINC00158	P58513	81 aa		15.67	■□□□□ 0.1
GPS1-223	ENST00000584229	ATOH7	Q8N100	152 aa		15.67	■□□□□ 0.1
GPS1-223	ENST00000584229	HERV-K104	P63124	156 aa		15.66	■□□□□ 0.1
GPS1-223	ENST00000584229	C5orf52	A6NGY3	159 aa		15.65	■□□□□ 0.1
GPS1-223	ENST00000584229		E9PLD3	99 aa		15.65	■□□□□ 0.1
GPS1-223	ENST00000584229	COX17	Q14061	63 aa		15.65	■□□□□ 0.1
GPS1-223	ENST00000584229	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	15.65	■□□□□ 0.1
GPS1-223	ENST00000584229		M0QXV9	152 aa		15.63	■□□□□ 0.09
GPS1-223	ENST00000584229	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	15.63	■□□□□ 0.09
GPS1-223	ENST00000584229	FAT1	Q14517	4588 aa		15.62	■□□□□ 0.09
GPS1-223	ENST00000584229	SMIM13	P0DJ93	91 aa		15.62	■□□□□ 0.09
GPS1-223	ENST00000584229	NMU	P48645	174 aa		15.62	■□□□□ 0.09
GPS1-223	ENST00000584229	AKR1D1	P51857	326 aa		15.62	■□□□□ 0.09
GPS1-223	ENST00000584229	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		15.6	■□□□□ 0.09
GPS1-223	ENST00000584229	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		15.59	■□□□□ 0.09
GPS1-223	ENST00000584229	LINC00587	B1AMM8	73 aa		15.58	■□□□□ 0.08
GPS1-223	ENST00000584229	UBE2B	P63146	152 aa		15.58	■□□□□ 0.08
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		15.57	■□□□□ 0.08
GPS1-223	ENST00000584229	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		15.56	■□□□□ 0.08
GPS1-223	ENST00000584229	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		15.55	■□□□□ 0.08
GPS1-223	ENST00000584229	SCGB1D1	O95968	90 aa		15.55	■□□□□ 0.08

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