RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-211ENST00000582232 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-211ENST00000582232 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
GGA3-211ENST00000582232 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
GGA3-211ENST00000582232 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-211ENST00000582232 CKS1BP61024 79 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-211ENST00000582232 RNF151Q2KHN1 245 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-211ENST00000582232 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.47□□□□□ -1.21
GGA3-211ENST00000582232 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-211ENST00000582232 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-211ENST00000582232 J3QQQ9 107 aa7.46□□□□□ -1.22
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GGA3-211ENST00000582232 KRTAP10-2P60368 255 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-211ENST00000582232 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-211ENST00000582232 C2orf82Q6UX34 121 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-211ENST00000582232 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-211ENST00000582232 Q6ZRU5 148 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-211ENST00000582232 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-211ENST00000582232 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
GGA3-211ENST00000582232 CARD19Q96LW7 228 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-211ENST00000582232 PKHD1P08F94 4074 aa7.46□□□□□ -1.22
GGA3-211ENST00000582232 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.45□□□□□ -1.22
GGA3-211ENST00000582232 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.45□□□□□ -1.22
GGA3-211ENST00000582232 MAJINQ3KP22 176 aa7.45□□□□□ -1.22
GGA3-211ENST00000582232 C10orf25Q5T742 122 aa7.45□□□□□ -1.22
GGA3-211ENST00000582232 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-211ENST00000582232 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
GGA3-211ENST00000582232 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-211ENST00000582232 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-211ENST00000582232 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.43□□□□□ -1.22
GGA3-211ENST00000582232 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.43□□□□□ -1.22
GGA3-211ENST00000582232 HERV-K104P63124 156 aa7.43□□□□□ -1.22
GGA3-211ENST00000582232 VAMP8Q9BV40 100 aa7.42□□□□□ -1.22
GGA3-211ENST00000582232 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.42□□□□□ -1.22
GGA3-211ENST00000582232 SMIM6P0DI80 62 aa7.41□□□□□ -1.22
GGA3-211ENST00000582232 COX17Q14061 63 aa7.41□□□□□ -1.22
GGA3-211ENST00000582232 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.41□□□□□ -1.22
GGA3-211ENST00000582232 HERC2O95714 4834 aa7.4□□□□□ -1.22
GGA3-211ENST00000582232 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.4□□□□□ -1.22
GGA3-211ENST00000582232 LINC00587B1AMM8 73 aa7.4□□□□□ -1.22
GGA3-211ENST00000582232 GCSHP23434 173 aa7.4□□□□□ -1.22
GGA3-211ENST00000582232 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.22
GGA3-211ENST00000582232 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.4□□□□□ -1.22
GGA3-211ENST00000582232 ZNF815PA8K554 130 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-211ENST00000582232 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-211ENST00000582232 SPATA45Q537H7 98 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-211ENST00000582232 PCP2Q8IVA1 136 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-211ENST00000582232 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-211ENST00000582232 ERG28Q9UKR5 140 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-211ENST00000582232 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-211ENST00000582232 DNAH8Q96JB1 4490 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-211ENST00000582232 A0A0J9YXY3 114 aa7.38□□□□□ -1.23
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GGA3-211ENST00000582232 LRP1BQ9NZR2 4599 aa7.37□□□□□ -1.23
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GGA3-211ENST00000582232 S100A12P80511 92 aa7.37□□□□□ -1.23
GGA3-211ENST00000582232 Q6ZRP5 223 aa7.37□□□□□ -1.23
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GGA3-211ENST00000582232 KRTAP10-1P60331 282 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-211ENST00000582232 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
GGA3-211ENST00000582232 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-211ENST00000582232 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.36□□□□□ -1.23
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GGA3-211ENST00000582232 SMIM13P0DJ93 91 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-211ENST00000582232 PFN2P35080 140 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-211ENST00000582232 Q6ZSA8 131 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-211ENST00000582232 LINC00158P58513 81 aa7.34□□□□□ -1.23
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GGA3-211ENST00000582232 GAGE2BQ13066 116 aa7.34□□□□□ -1.23
GGA3-211ENST00000582232 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.34□□□□□ -1.23
GGA3-211ENST00000582232 C14orf144Q96I85 54 aa7.34□□□□□ -1.23
GGA3-211ENST00000582232 LITAFQ99732 161 aa7.34□□□□□ -1.23
GGA3-211ENST00000582232 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.33□□□□□ -1.24
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GGA3-211ENST00000582232 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
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GGA3-211ENST00000582232 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.32□□□□□ -1.24
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GGA3-211ENST00000582232 EPM2AB3EWF7 344 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-211ENST00000582232 TMEM238C9JI98 176 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-211ENST00000582232 PANO1I0J062 215 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-211ENST00000582232 CHTF8P0CG12 524 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-211ENST00000582232 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-211ENST00000582232 C12orf57Q99622 126 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-211ENST00000582232 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-211ENST00000582232 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-211ENST00000582232 SPANXCQ9NY87 97 aa7.31□□□□□ -1.24
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