RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569899.5

GDE1-205, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 4

Gene GDE1, Length 1,618 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-205ENST00000569899 Q9HAA7 133 aa6.69□□□□□ -1.34
GDE1-205ENST00000569899 A0A087WZ39 114 aa6.68□□□□□ -1.34
GDE1-205ENST00000569899 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.68□□□□□ -1.34
GDE1-205ENST00000569899 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.68□□□□□ -1.34
GDE1-205ENST00000569899 J3QQQ9 107 aa6.68□□□□□ -1.34
GDE1-205ENST00000569899 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.68□□□□□ -1.34
GDE1-205ENST00000569899 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.68□□□□□ -1.34
GDE1-205ENST00000569899 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.68□□□□□ -1.34
GDE1-205ENST00000569899 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.68□□□□□ -1.34
GDE1-205ENST00000569899 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
GDE1-205ENST00000569899 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.68□□□□□ -1.34
GDE1-205ENST00000569899 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.68□□□□□ -1.34
GDE1-205ENST00000569899 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.68□□□□□ -1.34
GDE1-205ENST00000569899 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.68□□□□□ -1.34
GDE1-205ENST00000569899 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.68□□□□□ -1.34
GDE1-205ENST00000569899 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.67□□□□□ -1.34
GDE1-205ENST00000569899 ZNF815PA8K554 130 aa6.67□□□□□ -1.34
GDE1-205ENST00000569899 COX7A2LO14548 114 aa6.67□□□□□ -1.34
GDE1-205ENST00000569899 CASC10Q5T4H9 136 aa6.67□□□□□ -1.34
GDE1-205ENST00000569899 DDTP30046 118 aa6.66□□□□□ -1.34
GDE1-205ENST00000569899 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.66□□□□□ -1.34
GDE1-205ENST00000569899 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.65□□□□□ -1.34
GDE1-205ENST00000569899 DLEU1O43261 78 aa6.65□□□□□ -1.34
GDE1-205ENST00000569899 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
GDE1-205ENST00000569899 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.65□□□□□ -1.34
GDE1-205ENST00000569899 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.65□□□□□ -1.34
GDE1-205ENST00000569899 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.65□□□□□ -1.35
GDE1-205ENST00000569899 COX7B2Q8TF08 81 aa6.65□□□□□ -1.35
GDE1-205ENST00000569899 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.65□□□□□ -1.35
GDE1-205ENST00000569899 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.65□□□□□ -1.35
GDE1-205ENST00000569899 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.64□□□□□ -1.35
GDE1-205ENST00000569899 C3orf84H3BNL1 204 aa6.64□□□□□ -1.35
GDE1-205ENST00000569899 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.64□□□□□ -1.35
GDE1-205ENST00000569899 K7EP13 123 aa6.63□□□□□ -1.35
GDE1-205ENST00000569899 NDUFA1O15239 70 aa6.63□□□□□ -1.35
GDE1-205ENST00000569899 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.63□□□□□ -1.35
GDE1-205ENST00000569899 TTC32Q5I0X7 151 aa6.63□□□□□ -1.35
GDE1-205ENST00000569899 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.62□□□□□ -1.35
GDE1-205ENST00000569899 LINC00587B1AMM8 73 aa6.62□□□□□ -1.35
GDE1-205ENST00000569899 SPAG11BQ08648 103 aa6.62□□□□□ -1.35
GDE1-205ENST00000569899 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.62□□□□□ -1.35
GDE1-205ENST00000569899 Q8IZM0 81 aa6.62□□□□□ -1.35
GDE1-205ENST00000569899 C15orf56Q8N910 161 aa6.62□□□□□ -1.35
GDE1-205ENST00000569899 RMI2Q96E14 147 aa6.62□□□□□ -1.35
GDE1-205ENST00000569899 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.62□□□□□ -1.35
GDE1-205ENST00000569899 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
GDE1-205ENST00000569899 A0A0J9YXY3 114 aa6.61□□□□□ -1.35
GDE1-205ENST00000569899 M0R2N4 97 aa6.61□□□□□ -1.35
GDE1-205ENST00000569899 APOMO95445 188 aa6.61□□□□□ -1.35
GDE1-205ENST00000569899 LY6G6CO95867 125 aa6.61□□□□□ -1.35
GDE1-205ENST00000569899 PRSS2P07478 247 aa6.61□□□□□ -1.35
GDE1-205ENST00000569899 KIAA0087Q14695 138 aa6.61□□□□□ -1.35
GDE1-205ENST00000569899 CTAG1AP78358 180 aa6.61□□□□□ -1.35
GDE1-205ENST00000569899 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.61□□□□□ -1.35
GDE1-205ENST00000569899 C2orf82Q6UX34 121 aa6.61□□□□□ -1.35
GDE1-205ENST00000569899 HIGD1BQ9P298 99 aa6.61□□□□□ -1.35
GDE1-205ENST00000569899 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.6□□□□□ -1.35
GDE1-205ENST00000569899 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.6□□□□□ -1.35
GDE1-205ENST00000569899 C6orf223Q8N319 242 aa6.6□□□□□ -1.35
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GDE1-205ENST00000569899 KMT2AQ03164 3969 aa6.58□□□□□ -1.36
GDE1-205ENST00000569899 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
GDE1-205ENST00000569899 CXCL5P42830 114 aa6.58□□□□□ -1.36
GDE1-205ENST00000569899 CKS1BP61024 79 aa6.58□□□□□ -1.36
GDE1-205ENST00000569899 HERV-K104P63124 156 aa6.58□□□□□ -1.36
GDE1-205ENST00000569899 WFDC2Q14508 124 aa6.58□□□□□ -1.36
GDE1-205ENST00000569899 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.58□□□□□ -1.36
GDE1-205ENST00000569899 C10orf25Q5T742 122 aa6.58□□□□□ -1.36
GDE1-205ENST00000569899 Q6ZR54 194 aa6.58□□□□□ -1.36
GDE1-205ENST00000569899 TM2D2Q9BX73 214 aa6.58□□□□□ -1.36
GDE1-205ENST00000569899 COX11Q9Y6N1 276 aa6.58□□□□□ -1.36
GDE1-205ENST00000569899 A0A0U1RRA0 63 aa6.57□□□□□ -1.36
GDE1-205ENST00000569899 PSCAO43653 123 aa6.57□□□□□ -1.36
GDE1-205ENST00000569899 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
GDE1-205ENST00000569899 HSD52Q0P140 79 aa6.57□□□□□ -1.36
GDE1-205ENST00000569899 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
GDE1-205ENST00000569899 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
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GDE1-205ENST00000569899 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.56□□□□□ -1.36
GDE1-205ENST00000569899 SFTA2Q6UW10 78 aa6.56□□□□□ -1.36
GDE1-205ENST00000569899 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.56□□□□□ -1.36
GDE1-205ENST00000569899 DAND5Q8N907 189 aa6.56□□□□□ -1.36
GDE1-205ENST00000569899 HIST1H4GQ99525 98 aa6.56□□□□□ -1.36
GDE1-205ENST00000569899 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
GDE1-205ENST00000569899 BATFQ16520 125 aa6.55□□□□□ -1.36
GDE1-205ENST00000569899 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
GDE1-205ENST00000569899 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.55□□□□□ -1.36
GDE1-205ENST00000569899 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.55□□□□□ -1.36
GDE1-205ENST00000569899 DNAH2Q9P225 4427 aa6.55□□□□□ -1.36
GDE1-205ENST00000569899 TIMM17BO60830 172 aa6.54□□□□□ -1.36
GDE1-205ENST00000569899 NPC2P61916 151 aa6.54□□□□□ -1.36
GDE1-205ENST00000569899 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
GDE1-205ENST00000569899 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.54□□□□□ -1.36
GDE1-205ENST00000569899 Q6ZRU5 148 aa6.54□□□□□ -1.36
GDE1-205ENST00000569899 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.54□□□□□ -1.36
GDE1-205ENST00000569899 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.54□□□□□ -1.36
GDE1-205ENST00000569899 SPANXCQ9NY87 97 aa6.54□□□□□ -1.36
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