RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552346.1

USP15-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 655 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-218ENST00000552346 TTC37Q6PGP7 1564 aa0.49□□□□□ -2.33
USP15-218ENST00000552346 NCOR2Q9Y618 2525 aa0.48□□□□□ -2.33
USP15-218ENST00000552346 NLRP1Q9C000 1473 aa0.48□□□□□ -2.33
USP15-218ENST00000552346 PKDREJQ9NTG1 2253 aa0.48□□□□□ -2.33
USP15-218ENST00000552346 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa0.48□□□□□ -2.33
USP15-218ENST00000552346 C7orf77A4D0Y5 90 aa0.48□□□□□ -2.33
USP15-218ENST00000552346 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa0.48□□□□□ -2.33
USP15-218ENST00000552346 Q5VSD8 79 aa0.48□□□□□ -2.33
USP15-218ENST00000552346 FDCSPQ8NFU4 85 aa0.48□□□□□ -2.33
USP15-218ENST00000552346 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa0.48□□□□□ -2.33
USP15-218ENST00000552346 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
USP15-218ENST00000552346 MED14O60244 1454 aa0.48□□□□□ -2.33
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USP15-218ENST00000552346 UNC79Q9P2D8 2635 aa0.47□□□□□ -2.33
USP15-218ENST00000552346 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
USP15-218ENST00000552346 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
USP15-218ENST00000552346 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa0.47□□□□□ -2.33
USP15-218ENST00000552346 ASIPP42127 132 aa0.47□□□□□ -2.33
USP15-218ENST00000552346 NRXN1Q9ULB1 1477 aa0.47□□□□□ -2.33
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USP15-218ENST00000552346 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
USP15-218ENST00000552346 MAST4O15021 2626 aa0.46□□□□□ -2.34
USP15-218ENST00000552346 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa0.46□□□□□ -2.34
USP15-218ENST00000552346 U3KQA8 63 aa0.46□□□□□ -2.34
USP15-218ENST00000552346 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa0.46□□□□□ -2.34
USP15-218ENST00000552346 KNDC1Q76NI1 1749 aa0.46□□□□□ -2.34
USP15-218ENST00000552346 FANCAO15360 1455 aa0.46□□□□□ -2.34
USP15-218ENST00000552346 NCOR1O75376 2440 aa0.45□□□□□ -2.34
USP15-218ENST00000552346 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa0.45□□□□□ -2.34
USP15-218ENST00000552346 GNG2P59768 71 aa0.45□□□□□ -2.34
USP15-218ENST00000552346 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa0.45□□□□□ -2.34
USP15-218ENST00000552346 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa0.44□□□□□ -2.34
USP15-218ENST00000552346 CFDP00746 253 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
USP15-218ENST00000552346 C9orf62Q8N4C0 152 aa0.44□□□□□ -2.34
USP15-218ENST00000552346 KIAA0556O60303 1618 aa0.44□□□□□ -2.34
USP15-218ENST00000552346 TSC2P49815 1807 aa0.43□□□□□ -2.34
USP15-218ENST00000552346 IGSF10Q6WRI0 2623 aa0.43□□□□□ -2.34
USP15-218ENST00000552346 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa0.43□□□□□ -2.34
USP15-218ENST00000552346 ANKRD36A6QL64 1941 aa0.43□□□□□ -2.34
USP15-218ENST00000552346 H3BQF6 201 aa0.43□□□□□ -2.34
USP15-218ENST00000552346 MON2Q7Z3U7 1717 aa0.43□□□□□ -2.34
USP15-218ENST00000552346 UQCRHLA0A096LP55 91 aa0.42□□□□□ -2.34
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USP15-218ENST00000552346 PYY3Q5JQD4 70 aa0.42□□□□□ -2.34
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USP15-218ENST00000552346 UBR1Q8IWV7 1749 aa0.41□□□□□ -2.34
USP15-218ENST00000552346 C5P01031 1676 aa0.41□□□□□ -2.34
USP15-218ENST00000552346 MYH4Q9Y623 1939 aa0.41□□□□□ -2.34
USP15-218ENST00000552346 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa0.41□□□□□ -2.34
USP15-218ENST00000552346 COX6B1P14854 86 aa0.41□□□□□ -2.34
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USP15-218ENST00000552346 IQSEC2Q5JU85 1478 aa0.41□□□□□ -2.34
USP15-218ENST00000552346 URB1O60287 2271 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.34
USP15-218ENST00000552346 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.34
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USP15-218ENST00000552346 H0Y9P7 68 aa0.4□□□□□ -2.35
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USP15-218ENST00000552346 SPRR1AP35321 89 aa0.39□□□□□ -2.35
USP15-218ENST00000552346 DEFB109BQ30KR1 87 aa0.39□□□□□ -2.35
USP15-218ENST00000552346 ATP10BO94823 1461 aa0.39□□□□□ -2.35
USP15-218ENST00000552346 DNMBPQ6XZF7 1577 aa0.39□□□□□ -2.35
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USP15-218ENST00000552346 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP0.38□□□□□ -2.35
USP15-218ENST00000552346 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP0.38□□□□□ -2.35
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USP15-218ENST00000552346 MAGI2Q86UL8 1455 aa0.38□□□□□ -2.35
USP15-218ENST00000552346 ARMS2P0C7Q2 107 aa0.38□□□□□ -2.35
USP15-218ENST00000552346 HMGN3Q15651 99 aa0.38□□□□□ -2.35
USP15-218ENST00000552346 C6orf201Q7Z4U5 140 aa0.38□□□□□ -2.35
USP15-218ENST00000552346 C20orf78Q9BR46 151 aa0.38□□□□□ -2.35
USP15-218ENST00000552346 V9GYS6 101 aa0.38□□□□□ -2.35
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USP15-218ENST00000552346 K7EP34 96 aa0.37□□□□□ -2.35
USP15-218ENST00000552346 GYPAP02724 150 aa0.37□□□□□ -2.35
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USP15-218ENST00000552346 DEFB107AQ8IZN7 70 aa0.37□□□□□ -2.35
USP15-218ENST00000552346 HIGD1BQ9P298 99 aa0.37□□□□□ -2.35
USP15-218ENST00000552346 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa0.37□□□□□ -2.35
USP15-218ENST00000552346 CCDC18Q5T9S5 1454 aa0.36□□□□□ -2.35
USP15-218ENST00000552346 K7EQZ3 153 aa0.36□□□□□ -2.35
USP15-218ENST00000552346 ZNF720Q7Z2F6 126 aa0.36□□□□□ -2.35
USP15-218ENST00000552346 CUX1P39880 1505 aa0.36□□□□□ -2.35
USP15-218ENST00000552346 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP0.36□□□□□ -2.35
USP15-218ENST00000552346 RGPD2P0DJD1 1756 aa0.36□□□□□ -2.35
USP15-218ENST00000552346 KIF20BQ96Q89 1820 aa0.36□□□□□ -2.35
USP15-218ENST00000552346 ABCA8O94911 1581 aa0.36□□□□□ -2.35
USP15-218ENST00000552346 LRRC37AA6NMS7 1700 aa0.35□□□□□ -2.35
USP15-218ENST00000552346 KIF14Q15058 1648 aa0.35□□□□□ -2.35
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