RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552189.5

SENP1-210, Transcript of SUMO specific peptidase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SENP1, Length 4,967 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1-210ENST00000552189 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa5.54□□□□□ -1.52
SENP1-210ENST00000552189 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP5.54□□□□□ -1.52
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SENP1-210ENST00000552189 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
SENP1-210ENST00000552189 A0A1B0GUV1 79 aa5.54□□□□□ -1.52
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SENP1-210ENST00000552189 M0QXV9 152 aa5.54□□□□□ -1.52
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SENP1-210ENST00000552189 LOC400499M0QZD8 3231 aa5.46□□□□□ -1.53
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SENP1-210ENST00000552189 NREPQ16612 68 aa5.43□□□□□ -1.54
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SENP1-210ENST00000552189 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa5.43□□□□□ -1.54
SENP1-210ENST00000552189 LINC00476Q8WZB0 136 aa5.43□□□□□ -1.54
SENP1-210ENST00000552189 CLEC2BQ92478 149 aa5.43□□□□□ -1.54
SENP1-210ENST00000552189 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa5.42□□□□□ -1.54
SENP1-210ENST00000552189 CELSR2Q9HCU4 2923 aa5.42□□□□□ -1.54
SENP1-210ENST00000552189 H3BQ85 93 aa5.42□□□□□ -1.54
SENP1-210ENST00000552189 RBM3P98179 157 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
SENP1-210ENST00000552189 REG3GQ6UW15 175 aa5.42□□□□□ -1.54
SENP1-210ENST00000552189 MYO15AQ9UKN7 3530 aa5.42□□□□□ -1.54
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