RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551155.1

CS-224, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-224ENST00000551155 HIST1H2BJP06899 126 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-224ENST00000551155 IGLC3P0DOY3 106 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-224ENST00000551155 HIST1H2BOP23527 126 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-224ENST00000551155 HIST1H2BBP33778 126 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-224ENST00000551155 HIST1H2BDP58876 126 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-224ENST00000551155 HIST1H2BCP62807 126 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-224ENST00000551155 HAMPP81172 84 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-224ENST00000551155 KIAA0087Q14695 138 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-224ENST00000551155 HIST2H2BEQ16778 126 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-224ENST00000551155 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
CS-224ENST00000551155 SPACA4Q8TDM5 124 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-224ENST00000551155 HIST1H2BHQ93079 126 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-224ENST00000551155 HIST1H2BNQ99877 126 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-224ENST00000551155 HIST1H2BMQ99879 126 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-224ENST00000551155 TOMM7Q9P0U1 55 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-224ENST00000551155 HSPB8Q9UJY1 196 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-224ENST00000551155 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
CS-224ENST00000551155 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CS-224ENST00000551155 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa5.97□□□□□ -1.45
CS-224ENST00000551155 EPM2AB3EWF7 344 aa5.97□□□□□ -1.45
CS-224ENST00000551155 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
CS-224ENST00000551155 CXCL5P42830 114 aa5.97□□□□□ -1.45
CS-224ENST00000551155 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa5.97□□□□□ -1.45
CS-224ENST00000551155 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
CS-224ENST00000551155 DNAH5Q8TE73 4624 aa5.96□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 A0A096LNI7 61 aa5.96□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa5.96□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 SMIM1B2RUZ4 78 aa5.96□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 TLX1NBP0CAT3 122 aa5.96□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 LINC00310P59036 64 aa5.96□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 MAJINQ3KP22 176 aa5.96□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.96□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 KIAA1109Q2LD37 5005 aa5.96□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 LRP1BQ9NZR2 4599 aa5.95□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 A0A087WYN8 130 aa5.95□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 F8VRH5 84 aa5.95□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 PANO1I0J062 215 aa5.95□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 NUPR1O60356 82 aa5.95□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 SPINK8P0C7L1 97 aa5.95□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 CHTF8P0CG12 524 aa5.95□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 FABP4P15090 132 aa5.95□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 PTTG1IPP53801 180 aa5.95□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 GAGE2BQ13066 116 aa5.95□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 TMEM170BQ5T4T1 132 aa5.95□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 C10orf25Q5T742 122 aa5.95□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 Q5VSD8 79 aa5.95□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 C2orf82Q6UX34 121 aa5.95□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 STPG4Q8N801 248 aa5.95□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 COX7B2Q8TF08 81 aa5.95□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 C6orf48Q9UBA6 75 aa5.95□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 C11orf86A6NJI1 115 aa5.94□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa5.94□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.94□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa5.93□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 H0Y8G0 127 aa5.93□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 SFTA2Q6UW10 78 aa5.93□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa5.92□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 PLNP26678 52 aa5.92□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 ODF1Q14990 250 aa5.92□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 Q6ZRP5 223 aa5.92□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 C7orf33Q8WU49 177 aa5.92□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 TMEM223A0PJW6 202 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 DPM2O94777 84 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 GAGE2EQ4V326 116 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 APOBP04114 4563 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CS-224ENST00000551155 IGKCP01834 107 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-224ENST00000551155 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CS-224ENST00000551155 COX17Q14061 63 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-224ENST00000551155 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-224ENST00000551155 HSPG2P98160 4391 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-224ENST00000551155 RYR1P21817 5038 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-224ENST00000551155 A0A1W2PNN7 141 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-224ENST00000551155 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-224ENST00000551155 INAFM2P0DMQ5 153 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-224ENST00000551155 HERVK_113P61574 105 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-224ENST00000551155 HERC2O95714 4834 aa5.87□□□□□ -1.47
CS-224ENST00000551155 LINC00587B1AMM8 73 aa5.87□□□□□ -1.47
CS-224ENST00000551155 S100A6P06703 90 aa5.87□□□□□ -1.47
CS-224ENST00000551155 PET117Q6UWS5 81 aa5.87□□□□□ -1.47
CS-224ENST00000551155 HERV-K104P63124 156 aa5.86□□□□□ -1.47
CS-224ENST00000551155 PLEKHB2Q96CS7 222 aa5.86□□□□□ -1.47
CS-224ENST00000551155 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
CS-224ENST00000551155 PMCHL2Q9BQD1 86 aa5.86□□□□□ -1.47
CS-224ENST00000551155 ERG28Q9UKR5 140 aa5.86□□□□□ -1.47
CS-224ENST00000551155 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-224ENST00000551155 LEPROTO15243 131 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-224ENST00000551155 C3orf79P0CE67 100 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-224ENST00000551155 S100A2P29034 98 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-224ENST00000551155 PFN2P35080 140 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-224ENST00000551155 AKR1D1P51857 326 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-224ENST00000551155 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CS-224ENST00000551155 LINC01545Q5VT33 79 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-224ENST00000551155 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 108.9 ms