RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 PYY3Q5JQD4 70 aa6.16□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.15□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 hDV102S1A0JD36 115 aa6.15□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 J3QQQ9 107 aa6.15□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 NDUFA1O15239 70 aa6.15□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 GCSHP23434 173 aa6.15□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 HERV-K104P63124 156 aa6.15□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 STPG4Q8N801 248 aa6.15□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.15□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.15□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.14□□□□□ -1.43
CS-220ENST00000550700 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.14□□□□□ -1.43
CS-220ENST00000550700 A0A087WTM6 91 aa6.14□□□□□ -1.43
CS-220ENST00000550700 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.14□□□□□ -1.43
CS-220ENST00000550700 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.14□□□□□ -1.43
CS-220ENST00000550700 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
CS-220ENST00000550700 RNF151Q2KHN1 245 aa6.14□□□□□ -1.43
CS-220ENST00000550700 ATOH7Q8N100 152 aa6.14□□□□□ -1.43
CS-220ENST00000550700 C15orf56Q8N910 161 aa6.14□□□□□ -1.43
CS-220ENST00000550700 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.14□□□□□ -1.43
CS-220ENST00000550700 SYCNQ0VAF6 134 aa6.13□□□□□ -1.43
CS-220ENST00000550700 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
CS-220ENST00000550700 COX17Q14061 63 aa6.13□□□□□ -1.43
CS-220ENST00000550700 KIAA0087Q14695 138 aa6.13□□□□□ -1.43
CS-220ENST00000550700 Q8N814 137 aa6.13□□□□□ -1.43
CS-220ENST00000550700 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.13□□□□□ -1.43
CS-220ENST00000550700 RTL8CO15255 209 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-220ENST00000550700 DLEU1O43261 78 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-220ENST00000550700 SPATA45Q537H7 98 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-220ENST00000550700 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-220ENST00000550700 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-220ENST00000550700 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-220ENST00000550700 CARD19Q96LW7 228 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-220ENST00000550700 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-220ENST00000550700 ZNF815PA8K554 130 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-220ENST00000550700 COX8AP10176 69 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-220ENST00000550700 COPS9Q8WXC6 57 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-220ENST00000550700 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
CS-220ENST00000550700 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-220ENST00000550700 LECT2O14960 151 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-220ENST00000550700 TIMM17BO60830 172 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-220ENST00000550700 MAJINQ3KP22 176 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-220ENST00000550700 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-220ENST00000550700 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-220ENST00000550700 Q6ZVH6 145 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-220ENST00000550700 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-220ENST00000550700 C12orf57Q99622 126 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-220ENST00000550700 LYSTQ99698 3801 aa6.09□□□□□ -1.43
CS-220ENST00000550700 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.08□□□□□ -1.44
CS-220ENST00000550700 TMEM238C9JI98 176 aa6.08□□□□□ -1.44
CS-220ENST00000550700 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.08□□□□□ -1.44
CS-220ENST00000550700 C2orf82Q6UX34 121 aa6.08□□□□□ -1.44
CS-220ENST00000550700 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.08□□□□□ -1.44
CS-220ENST00000550700 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.08□□□□□ -1.44
CS-220ENST00000550700 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.08□□□□□ -1.44
CS-220ENST00000550700 ERG28Q9UKR5 140 aa6.08□□□□□ -1.44
CS-220ENST00000550700 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-220ENST00000550700 A0A0J9YXY3 114 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-220ENST00000550700 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-220ENST00000550700 TSTD3H0UI37 97 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-220ENST00000550700 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-220ENST00000550700 WFDC2Q14508 124 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-220ENST00000550700 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-220ENST00000550700 Q6ZRU5 148 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-220ENST00000550700 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-220ENST00000550700 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-220ENST00000550700 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-220ENST00000550700 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-220ENST00000550700 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
CS-220ENST00000550700 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-220ENST00000550700 PCP2Q8IVA1 136 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-220ENST00000550700 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-220ENST00000550700 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-220ENST00000550700 HIGD1BQ9P298 99 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-220ENST00000550700 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-220ENST00000550700 LINC00158P58513 81 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-220ENST00000550700 C14orf144Q96I85 54 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-220ENST00000550700 SLPIP03973 132 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-220ENST00000550700 IFITM1P13164 125 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-220ENST00000550700 PFN2P35080 140 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-220ENST00000550700 C10orf25Q5T742 122 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-220ENST00000550700 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-220ENST00000550700 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CS-220ENST00000550700 C16orf90A8MZG2 172 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-220ENST00000550700 PTTG1IPP53801 180 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-220ENST00000550700 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.03□□□□□ -1.44
CS-220ENST00000550700 TAL2Q16559 108 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-220ENST00000550700 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-220ENST00000550700 SMIM13P0DJ93 91 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-220ENST00000550700 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-220ENST00000550700 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-220ENST00000550700 SPANXCQ9NY87 97 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-220ENST00000550700 KMT2AQ03164 3969 aa6.01□□□□□ -1.45
CS-220ENST00000550700 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
CS-220ENST00000550700 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
CS-220ENST00000550700 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.01□□□□□ -1.45
CS-220ENST00000550700 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.01□□□□□ -1.45
CS-220ENST00000550700 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.01□□□□□ -1.45
CS-220ENST00000550700 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
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