RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541869.5

POLR1B-217, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR1B, Length 5,059 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-217ENST00000541869 COX8CQ7Z4L0 72 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1B-217ENST00000541869 MUC4Q99102 2169 aa7.27□□□□□ -1.25
POLR1B-217ENST00000541869 Q6ZRP5 223 aa7.26□□□□□ -1.25
POLR1B-217ENST00000541869 K7EP34 96 aa7.26□□□□□ -1.25
POLR1B-217ENST00000541869 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.26□□□□□ -1.25
POLR1B-217ENST00000541869 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.26□□□□□ -1.25
POLR1B-217ENST00000541869 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
POLR1B-217ENST00000541869 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
POLR1B-217ENST00000541869 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
POLR1B-217ENST00000541869 PRR4Q16378 134 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1B-217ENST00000541869 CRYGAP11844 174 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1B-217ENST00000541869 ETDBQ3ZM63 59 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1B-217ENST00000541869 TIMM17BO60830 172 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1B-217ENST00000541869 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1B-217ENST00000541869 ACYP1P07311 99 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1B-217ENST00000541869 X6R8D5 127 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1B-217ENST00000541869 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1B-217ENST00000541869 Q6ZSN1 163 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1B-217ENST00000541869 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1B-217ENST00000541869 A0A0B4J2C4 111 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1B-217ENST00000541869 C11orf72Q8NBR9 251 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1B-217ENST00000541869 FXYD2P54710 66 aa7.21□□□□□ -1.25
POLR1B-217ENST00000541869 Q6JHZ5 121 aa7.21□□□□□ -1.25
POLR1B-217ENST00000541869 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.21□□□□□ -1.25
POLR1B-217ENST00000541869 ITPR3Q14573 2671 aa7.21□□□□□ -1.25
POLR1B-217ENST00000541869 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR1B-217ENST00000541869 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
POLR1B-217ENST00000541869 CCKP06307 115 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR1B-217ENST00000541869 Q8NAQ8 132 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR1B-217ENST00000541869 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR1B-217ENST00000541869 KRTAP10-11P60412 298 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1B-217ENST00000541869 CLEC2BQ92478 149 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1B-217ENST00000541869 EPM2AB3EWF7 344 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1B-217ENST00000541869 Q6Q795 121 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1B-217ENST00000541869 Q6ZQY7 126 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1B-217ENST00000541869 SVIPQ8NHG7 77 aa7.2□□□□□ -1.26
POLR1B-217ENST00000541869 H3BT86 120 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR1B-217ENST00000541869 LINC00694P0DN24 101 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR1B-217ENST00000541869 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
POLR1B-217ENST00000541869 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR1B-217ENST00000541869 A8MZ25 164 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR1B-217ENST00000541869 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR1B-217ENST00000541869 IGIPA6NJ69 53 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR1B-217ENST00000541869 KLK9Q2XQG4 91 aa7.19□□□□□ -1.26
POLR1B-217ENST00000541869 PRYO14603 147 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR1B-217ENST00000541869 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR1B-217ENST00000541869 C19orf73Q9NVV2 129 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR1B-217ENST00000541869 COX6B2Q6YFQ2 88 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR1B-217ENST00000541869 TM2D3Q9BRN9 247 aa7.18□□□□□ -1.26
POLR1B-217ENST00000541869 GAS8-AS1O95177 125 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1B-217ENST00000541869 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1B-217ENST00000541869 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
POLR1B-217ENST00000541869 Q6ZRU5 148 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1B-217ENST00000541869 AGRNO00468 2067 aa7.17□□□□□ -1.26
POLR1B-217ENST00000541869 SLPIP03973 132 aa7.16□□□□□ -1.26
POLR1B-217ENST00000541869 SMIM20Q8N5G0 67 aa7.16□□□□□ -1.26
POLR1B-217ENST00000541869 CDIP1Q9H305 208 aa7.16□□□□□ -1.26
POLR1B-217ENST00000541869 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.16□□□□□ -1.26
POLR1B-217ENST00000541869 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.16□□□□□ -1.26
POLR1B-217ENST00000541869 Q9BRP9 147 aa7.15□□□□□ -1.26
POLR1B-217ENST00000541869 Q6ZVQ6 151 aa7.15□□□□□ -1.27
POLR1B-217ENST00000541869 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.15□□□□□ -1.27
POLR1B-217ENST00000541869 K7ERS5 55 aa7.14□□□□□ -1.27
POLR1B-217ENST00000541869 NOTCH1P46531 2555 aa7.14□□□□□ -1.27
POLR1B-217ENST00000541869 C22orf24Q9Y442 160 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1B-217ENST00000541869 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1B-217ENST00000541869 KRTAP10-3P60369 221 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1B-217ENST00000541869 SPTSSBQ8NFR3 76 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1B-217ENST00000541869 AMELXQ99217 191 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1B-217ENST00000541869 LINC00476Q8WZB0 136 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1B-217ENST00000541869 PRLHP81277 87 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1B-217ENST00000541869 B5MCH6 92 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1B-217ENST00000541869 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
POLR1B-217ENST00000541869 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1B-217ENST00000541869 TEN1Q86WV5 123 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1B-217ENST00000541869 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.1□□□□□ -1.27
POLR1B-217ENST00000541869 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.1□□□□□ -1.27
POLR1B-217ENST00000541869 CEP350Q5VT06 3117 aa7.1□□□□□ -1.27
POLR1B-217ENST00000541869 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.1□□□□□ -1.27
POLR1B-217ENST00000541869 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.1□□□□□ -1.27
POLR1B-217ENST00000541869 CASC10Q5T4H9 136 aa7.1□□□□□ -1.27
POLR1B-217ENST00000541869 TMEM258P61165 79 aa7.09□□□□□ -1.27
POLR1B-217ENST00000541869 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.09□□□□□ -1.27
POLR1B-217ENST00000541869 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
POLR1B-217ENST00000541869 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.08□□□□□ -1.28
POLR1B-217ENST00000541869 COL6A5A8TX70 2615 aa7.08□□□□□ -1.28
POLR1B-217ENST00000541869 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.08□□□□□ -1.28
POLR1B-217ENST00000541869 WFDC13Q8IUB5 93 aa7.08□□□□□ -1.28
POLR1B-217ENST00000541869 CENPEQ02224 2701 aa7.08□□□□□ -1.28
POLR1B-217ENST00000541869 A0A087WTM6 91 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1B-217ENST00000541869 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1B-217ENST00000541869 NDUFC2O95298 119 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1B-217ENST00000541869 J3KT08 172 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1B-217ENST00000541869 UTRNP46939 3433 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1B-217ENST00000541869 TRIAP1O43715 76 aa7.06□□□□□ -1.28
POLR1B-217ENST00000541869 MOBPQ13875 183 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR1B-217ENST00000541869 Q8N9L7 120 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR1B-217ENST00000541869 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.05□□□□□ -1.28
POLR1B-217ENST00000541869 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.05□□□□□ -1.28
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